R语言—如何安装Github包的解决方法,亲测有效 准备安装材料: R包-REmap GitHub下载地址:https://github.com/lchiffon/REmap R包-baidumap GitHub下载地址:https://github.com/badbye/baidumap 准备环境条件: #方法一:在线安装 install.packages("devtools") install.packages("rJava") library(rJava) l

开学的时候,男神给了数据(.xlsx格式)让用R语言分析分析,作为编程小白,读了一天都没读近R,更别提如何分析了. 现在小伙伴们都喜欢读txt 和csv格式的,好多xlsx的表格读不进R,将xlsx格式另存为csv格式就可以读进去啦.但偶尔会有格式不兼容的情况,会干掉有些数据,导致我们最后跑出的结果和男神给的案例结果不一样.其中一种解决方法是(我认为好用的): (1)安装xlsx包时会提醒需要rJava包,而rJava包需要配置电脑的环境变量,没有环境变量会导致包装不上,装不上! 首先电脑要安装

在R语言中使用openxlsx包,会报错 解决办法就是: 下载安装Set-Rtool,安装时注意勾选对话框 然后在R中运行以下代码: Sys.setenv("R_ZIPCMD" = "H:/Rtools/bin/zip.exe") #your Rtools path 具体情况看看你的R软件在哪个盘里面装着.

自动安装(在线安装) 在R的控制台,输入 install.packages("gridExtra") # 安装 gridExtra install.packages("stepNorm", contriburl="http://www.your.url", dependencies = TRUE) # 安装 stepNorm 若要指定安装目录 `mydir`,则输入 install.packages("stepNorm", c

我使用Rtudio环境,安装sqldb几次出错.网上没有好的教程. 经过自己试验之后,这样处理.我写出来以后,供大家参考. > install.packages("sqldf") also installing the dependencies ‘BH’, ‘plogr’, ‘gsubfn’, ‘proto’, ‘RSQLite’, ‘DBI’, ‘chron’ trying URL 'https://cran.rstudio.com/bin/windows/contrib/3.

转载生信技能树 https://mp.weixin.qq.com/s/JB_329LCWqo5dY6MLawfEA TCGA数据源 - R包RTCGA的简单介绍 - 首先安装及加载包 - 指定任意基因从任意癌症里面获取芯片表达数据 - 绘制指定基因在不同癌症的表达量区别boxplot - 更多boxplot参数 - 指定任意基因从任意癌症里面获取测序表达数据 - 用全部的rnaseq的表达数据来做主成分分析 - 用5个基因在3个癌症的表达量做主成分分析 - 用突变数据做生存分析 - 多个基因在多

R语言中文分词包jiebaR R的极客理想系列文章,涵盖了R的思想,使用,工具,创新等的一系列要点,以我个人的学习和体验去诠释R的强大. R语言作为统计学一门语言,一直在小众领域闪耀着光芒.直到大数据的爆发,R语言变成了一门炙手可热的数据分析的利器.随着越来越多的工程背景的人的加入,R语言的社区在迅速扩大成长.现在已不仅仅是统计领域,教育,银行,电商,互联网-.都在使用R语言. 要成为有理想的极客,我们不能停留在语法上,要掌握牢固的数学,概率,统计知识,同时还要有创新精神,把R语言发挥到各个领域

每每以为攀得众山小,可.每每又切实来到起点,大牛们,缓缓脚步来俺笔记葩分享一下吧,please~ --------------------------- R语言H2o包的几个应用案例 笔者寄语:受启发想了解H2o平台的一些R语言实现,网上已有一篇H2o的demo文件.笔者在这多贴一些案例,并且把自己实践的一些小例子贴出来. 关于H2o平台长啥样,可以看H2o的官网,关于深度学习长啥样,可以看一些教程,比如ParallelR博客之中的解析. 下面主要是贴几个案例,让大家看看. ----------

R语言:recommenderlab包的总结与应用案例   1. 推荐系统:recommenderlab包整体思路 recommenderlab包提供了一个可以用评分数据和0-1数据来发展和测试推荐算法的框架.它提供了几种基础算法,并可利用注册机制允许用户使用自己的算法recommender包的数据类型采用S4类构造. (1)评分矩阵数据接口:使用抽象的raringMatrix为评分数据提供接口.raringMatrix采用了很多类似矩阵对象的操作,如 dim(),dimnames() ,row

每每以为攀得众山小,可.每每又切实来到起点,大牛们,缓缓脚步来俺笔记葩分享一下吧,please~ --------------------------- <数据挖掘之道>摘录话语:虽然我比较执着于Rwordseg,并不代表各位看管执着于我的执着,推荐结巴分词包,小巧玲珑,没有那么多幺蛾子,而且R版本和python版本都有,除了词性标注等分词包必备功能以外,jiebaR还加入了一些基础的文本分析算法,比如提取关键字(TFIDF).分析文本相似性等等,真是老少咸宜. 同时官网也有一个在线jieba

R语言处理大规模数据速度不算快,通过安装其他包比如data.table可以提升读取处理速度. 案例,分别用read.csv和data.table包的fread函数读取一个1.67万行.230列的表格数据. # 用read.csv读取数据timestart<-Sys.time() data <- read.csv("XXXXs.csv",header = T,stringsAsFactors = F) timeend<-Sys.time() runningtime<

    今天看论文,需要用到R语言的库,于是又折腾了半天..     其实并没有什么太大的问题,只是在第三方包的下载方面还有python中使用R方面遇到了问题: 第三方包的导入      其实在网上有很多的方法了,R中包的安装     先说结论:最推荐直接使用install.packages("包名"),如果里面没有的话,再考虑在这个网站下载网站地址     这里一开始我担心又因为网速慢的问题,半天在线下不下来,所以直接从网站搜的包,然后下载下来,自己安,结果他并不添加其他依赖,下了一

什么是分位数回归 分位数回归(Quantile Regression)是计量经济学的研究前沿方向之一,它利用解释变量的多个分位数(例如四分位.十分位.百分位等)来得到被解释变量的条件分布的相应的分位数方程. 与传统的OLS只得到均值方程相比,分位数回归可以更详细地描述变量的统计分布.它是给定回归变量X,估计响应变量Y条件分位数的一个基本方法:它不仅可以度量回归变量在分布中心的影响,而且还可以度量在分布上尾和下尾的影响,因此较之经典的最小二乘回归具有独特的优势.众所周知,经典的最小二乘回归是针对因

#清除内存空间 rm(list=ls()) #导入tm包 library(tm) library(SnowballC) #查看tm包的文档 #vignette("tm") ##1.Data Import 导入自带的路透社的20篇xml文档 #找到/texts/crude的目录,作为DirSource的输入,读取20篇xml文档 reut21578 <- system.file("texts", "crude", package = &quo

R语言是单线程的,如果数据量比较大的情况下最好用并行计算来处理数据,这样会获得运行速度倍数的提升.这里介绍一个基于Unix系统的并行程序包:multicore. 我们用三种不同的方式来进行一个简单的数据处理: 我们从 1000 genome project 数据库下载了VCF文件,现在需要手动提取出每个allele的 allele frequency(AF)值(vcftools 可以很好的解决这个问题,但是假设我的vcf文件没有genotype, 或者我要实现一些个性化功能,那么可能要手动解决)

错误信息: configure: error: GNU MP not found, or not 4.1.4 or up, see http://gmplib.org ERROR: configuration failed for package ‘gmp’ * removing ‘/home/chenyansu/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.3/gmp’ Warning in install.packages : installation of package

数据导入 以下R包主要用于数据导入和保存数据 feather:一种快速,轻量级的文件格式.在R和python上都可使用readr:实现表格数据的快速导入.中文介绍可参考这里readxl:读取Microsoft Excel电子表格数据openxlsx:读取Microsoft Excel电子表格数据googlesheets:读取google电子表格数据haven:读取SAS,SPSS和Stata统计软件格式的数据httr:从网站开放的API中读取数据rvest:网页数据抓取包xml2:读取HTML和

安装rCharts的方法 install.packages('devtools') library(devtools) require(devtools) install_github('ramnathv/rCharts') recharts的安装 install_github("yummyZhou/recharts")就行了 参考:http://cos.name/cn/topic/408544/ Mac系统下安装rattle包方法:http://www.cnblogs.com/zhz

在linux下,对于手动安装的软件,当时间长了,我们就会忘记安装这个软件的细节.这就不利于以后软件的卸载工作了.而yum则会帮我们记住相关安装细节,当软件被卸载的时候,没用的文件也会一并被删除.因此,在centos 7下我们建议优先使用yum的方式安装软件. 在centos 7下安装R软件可以使用两种方式:源码编译安装和Yum在线安装.而R的官网上已经说明了,R已经被EPEL仓库管理着,EPEL是一个汇集了各种附加软件包的项目,所以我们使用yum来安装. 具体步骤如下: 1 通过如下命令安装并启

错误信息 Package'libxml-2.0',requiredby'ggobi',notfound     错误原因 ggobi缺乏libxml依赖 解决方案 sudo apt install libxml2 sudo apt install libxml2-dev (注意,有一个坑是,运行了第一条指令后,仍将缺乏libxml2依赖,因为许多 Linux 发行版会进行拆包,把开发用的部分单独拆出去.在我们实际运行中,会缺乏libxml2 所需要的头文件.静态库和一些相关工具. 应该执行第二条