该软件对于处理FASTA/Q十分方便,省去自己编写脚本 安装 1 conda install seqkit 使用 序列操作(seq) 1 ## 取方向序列 2 seqkit seq test.fa -r > test_re.fa 3 4 ## 取互补序列 5 seqkit seq test.fa -p > test_com.fa 6 7 ## 取方向互补序列 8 seqkit seq test.fa -r -p > test_re_com.fa 9 10 ## RNA---> DN

基因组长度 利用seqkit统计长度 seqkit stat test.fa 结果如下: file format type num_seqs sum_len min_len avg_len max_len test.fa FASTA DNA 149 396,098,845 10,246 2,658,381.5 44,776,151 sum_len总长度 各条染色体 利用pyfaidx pip install pyfaidx faidx test.fa -i chromsizes > test.s

好久没有写博客了,这段时间准备写一下字符串函数 QQ群: 499092562:欢迎交流 字符串函数: 1.LEN(需要获取长度的字符串) 返回:字符串的长度 示例: SELECT LEN('小搬运工很帅!') 2.RIGHT(需要被从右边截取的字符串,截取的开始下标,截取的长度) 返回:右边的字符串 示例: SELECT RIGHT('小搬运工',2,2) ‘小搬运工’从右边数第二个下标开始,长度为二的字符串 3.CHARINDEX(父字符串,需要查找位置的子字符串,从哪个位置开始找) 示例:S

整理了下在C++工程代码中遇到的技巧与建议. 0x00 巧用宏定义. 经常看见程序员用 enum 值,打印调试信息的时候又想打印数字对应的字符意思.见过有人写这样的代码 if(today == MONDAY) return "MONDAY"; 一般错误代码会有很多种,应该选用 switch-case 而不是 if-else.因为 if-else 最坏比较N次,switch-case 最坏是lgN次.这里用上宏,代码简介明了.而且也去掉了查找,直接索引到对应的字符串. // from A

0 shell基础概念 Shell是解释性语言,使用脚本编程语言的好处是,它们多半运行在比编译型语言还高的层级,能够轻易处理文件与目录之类的对象:缺点是它们的效率通常不如编译型语言.Shell命令有本身的限制和效率问题,以下情况一般不推荐Shell: 资源密集型的任务,尤其在需要考虑效率时(比如,排序,hash等等). 需要处理大任务的数学操作,尤其是浮点运算,精确运算,或者复杂的算术运算(这种情况一般使用C++或FORTRAN 来处理). 有跨平台(操作系统)移植需求(一般使用C 或Java)

有些写法上的说明写的过于武断,可能有很多不当之处,仅供参考.   package ForLoop; import java.util.ArrayList; import java.util.Iterator; import java.util.List; /** * java中for循环的6种写法 * * @author Panda.Pan * * @创建时间:2014-2-28 上午09:39:13 */ public class ForLoop { public static void ma

浅析busybox-1.12.0中ash的脚本命令局限性 LUTHER= 表示将LUTHER清空,将其变为null echo ${LUTHER:-111}如果执行该句之前LUTHER变量不存在,那么显示111,否则显示$LUTHER echo ${LUTHER:=111}如果执行该句之前LUTHER变量不存在,那么显示111,同时将111赋值给LUTHER,就此创建变量LUTHER变量,否则显示$LUTHER echo ${LUTHER:+111}如果执行该句之前LUTHER变量不存在,那么显示

IP协议结构 UDP协议结构 TFTP协议结构 TFTP端口 读写请求端口: 69 其他请求端口:1024~65535 主程序 /******************************************************************** *名称:menu *参数: * none *返回: * none *功能:菜单命令 *********************************************************************/ voi

使用SSL/TLS创建安全的Netty程序 Java提供了抽象的SslContext和SslEngine,实际上SslContext可以用来获取SslEngine来进行加密和解密.Netty拓展了Java的SslEngine,称SslHandler,用来对网络数据进行加密和解密. 1.制作自签证书 #keytool -genkey -keysize 2048 -validity 365 -keyalg RSA -dnam e "CN=gornix.com" -keypass 65432

Lodash用来操作对象和集合,比Underscore拥有更多的功能和更好的性能. 官网:https://lodash.com/引用:<script src="//cdnjs.cloudflare.com/ajax/libs/lodash.js/2.4.1/lodash.min.js"></script>安装:npm install lodash 首先通过npm安装lodash:npm i --save lodash 在js文件中引用lodash:var _ =

精简版: 定义:your_name=123      PS:=符号左右不能有空格! 使用:${your_name},单独使用变量时可以不加{} 只读:readonly your_name  PS:设置为只读后不可删除 删除:unset your_name 引号:单引号显示实质内容,双引号可以拼接字符串并且可以使用转义字符 大小:${#your_name} 可以查看变量所占大小,字符串长度 提取子字符串:echo ${string:1:4} 字符串以0为下表起始 查找子字符串:`expr inde

题意:对N个由(,)组成的字符串,求拼接后得到的最大的balance序列的长度.balance序列:空串/ A+B(A,B都是b序列)/ (+A+),A为b序列.此三种情况. 分析:在读入N每个字符串时,先将单独一个字符串中的b序列长度提取出来,记录其没有被使用的左弧L和右弧R的数目.因为要使其最后拼接后得到的子序列长度尽可能地大,那么按照贪心的思想,肯定希望左弧多的字符串在前,右弧多的字符串在后,所以要对其排序.但是排序时关键字的比较并不只是简单地比较二者的L与R,而且要先比较自身L与R的大小

运算符优先级: 在所有的运算符中,括号的优先级最高,赋值符号的优先级最低. 小括号 > 计算运算符 > 比较运算符 > 逻辑运算符 > 赋值符号———————————————————————————————————————————————————————————— 算术运算符(从左至右依次计算) -.+. *./.%.++.--.+=.-=.*=.%=.注意点: "+"只有两个作用: 数学运算和字符串连接(任何数据类型加字符串都是起连接作用). "%&

<?php /** * 字串乱序 PHP&JS * * php 中把字串乱序后输出给客户机的 JAVASCRIPT , JAVASCRIPT 中恢复 * 在指定长度提取一个字符,并把这一组字串倒序, * 形成这样的几组字串,最后貌似就形成了数字. * * 效果一般 */ $str = "0123456789测试ab"\"'cdefghijklmnop你好多字节字符乱"; $url = 'http://www.baidu.com'; $str = htt

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数据包编解码过程中主要的工作就是:在编码过程中进行序列化,在解码过程中从Byte流中分离出数据包然后反序列化.在MessageToByteEncoder中,已经解决了序列化之后的问题,ByteToMessageDecoder中已经部分第解决了从Byte流中分离出数据包的问题.实现具体的数据包编解码,只需要实现MessageToByteEncoder的encode和ByteToMessageDecoder的decode方法即可. 为了方便开发者使用Netty,在io.netty.handler.c

https://codeforces.com/problemset/problem/1000/B 题意: 一个模拟思维题.就是有一盏灯,0时刻开着.n次操作,你可以在其中加入一次操作(或者不加),操作为:a[i]时刻按一下开关,状态变为相反状态(开->关or关->开).问灯亮着的时长最长为多少? 样例一0~4开(时长为4-0),4~6关(时长为6-4),6~7开(时长为7-6),7~10关(时长为10-7),可以这这些时间点中加操作使开灯时间变长 在3处加操作,开灯时长变为0-3(开)3-4(

总结一下"入门3R"(Reading, 'Riting, 'Rrithmetic)中的读和写,不同的数据结构下的读写还是有点区别的. vector 命名 12 month.days<-c(31,28,31,30,31,30,31,31,30,31,30,31)names(month.days)<-month.name 操作文本 1.文本分离 12 pangram<-"The quick brown fox jumps over the lazy dog&qu

IPv6 Rapid Deployment: Provide IPv6 Access to Customers over an IPv4-Only Network 原文地址:https://www.cisco.com/c/en/us/products/collateral/ios-nx-os-software/enterprise-ipv6-solution/whitepaper_c11-665758.html 一.你将会学到什么? IPv6 rapid deployment(6rd)(RFC

// 提取特殊字符串长度(scrstr 源字符串 armstr 特殊字符) getStrCount: function(scrstr, armstr) { var count = 0; while (scrstr.indexOf(armstr) >= 1) { scrstr = scrstr.replace(armstr, "") count++; } return count; }

一.最小外接圆 #include "opencv2/opencv.hpp" #include<iostream> using namespace std; using namespace cv; void main() { Mat srcImg = imread("E://10.png"); imshow("src", srcImg); Mat dstImg = srcImg.clone(); GaussianBlur(srcImg,