今天的内容讲讲单细胞文章中经常出现的展示细胞marker的图:tsne/umap图.热图.堆叠小提琴图.气泡图,每个图我都会用两种方法绘制. 使用的数据来自文献:Single-cell transcriptomics reveals regulators underlying immune cell diversity and immune subtypes associated with prognosis in nasopharyngeal carcinoma. 去年7月发表在Cell Re

许多分析软件 : https://github.com/seandavi/awesome-single-cell#software-packages Smart-seq.CEL-seq.SCRB-seq和Drop-seq.Smart-seqSMART(Switching mechanism at 5’ end of the RNA transcript)是一个具有里程碑意义的重要技术.实际上,能够从单细胞生成全长cDNA的测序方案并不多,Smart-seq就是其中之一.对于等位基因特异性表达或者

单细胞在脑科学方面的应用 Session 1: Deciphering the Cellular Landscape of the Brain Using Single Cell Transcriptomics Single cell/nucleus transcriptomics has emerged as a powerful approach to classify cell types and dynamic cell states in any multicellular organ

单细胞测序技术(single cell sequencing) 2018-03-02 11:02   来源: 一呼百诺  点击次数:6587关键词:   前言 单细胞生物学最近几年是非常热门的研究方向.在这一领域中,最前沿的则是单细胞测序技术.传统测序方法一次处理成千上万个细胞,得到的变异水平也是成千上万个细胞的平均后水平.但是,就如同世界上没有完全相同的两片树叶一样,没有两个细胞是完全相同的.所以,单细胞测序对于研究单个细胞就显得至关重要. 单细胞测序可以揭示出每个细胞独特的微妙变化,甚至可以

业界良心啊,开源的单细胞课程. 随便看了几章,课程写得非常用心,非常适合新手. 课程地址:Analysis of single cell RNA-seq data 源码地址:hemberg-lab/scRNA.seq.course

Title:  Multiclonal Invasion in Breast Tumors Identified by Topographic Single Cell Sequencing 课题的目的和意义: Ductal carcinoma in situ (DCIS,原位导管癌)是一种早期的乳腺癌,很少发展成invasive ductal carcinoma(IDC,浸润型导管癌).由于瘤内异质性和导管中肿瘤细胞数量低,因此很难刻画在侵袭期间的基因组进化过程.为了克服这个障碍,作者开发了To

干货满满! Single Cell Genomics Day: A Practical Workshop

生物医疗大数据 安吉丽娜朱莉发现抑癌基因事件,BRCA突变与乳腺癌关联. 个体化测序商品23 and me 多组学数据研究:eg:太空和地球双胞胎发现生化指标差不多. 研究模式和工业模式相结合. 研究模式: 工业模式: 热点:量子计算其实没有研究成果. 未来方向: 传染病预警的技术,eg:flu tracking 抗生素危机 自免疫挑战 微生物群落和健康.eg:iHMP 新生儿/早产儿微生物群落失调,导致慢性疾病,可以使用移植的方法治疗. Cancer:eg:CAR-T 健康的衰老:衰老的迹象

问题描述 Xamarin使用IsGroupingEnabled="true"之后再Cell操作就会出现数据展示bug,数据不刷新的问题,如下图所示: 点击取消的是其他钢厂,但ViewCell展示的一直是“长峰”,这就分组试图一个比较常见的bug. 解决方案 在Tapped事件移除数据之前先把ListView的数据源设置为null,等操作完数据之后,在给ListView重新赋值上数据源,即可.核心代码如下:

资源: sci-hub paper CellBench package - github CellBench_data - code for the paper 现在单细胞领域的突出问题就是工具过多,但缺乏gold-standard benchmark datasets,没有一定的标准来衡量工具的好坏. 另外人们也不容易根据自己的问题来选择合适的工具,所以保险起见,现在大家都只用最有名气的那几个工具:seurat.monocle.SC3等. 算法是无穷的,随便套几个方法就能组成一个分析方法,做生

最近在项目中.要做到在tableview的cell上边加一个输入框.允许用户输入. 1.我首先选的是在uitextView  然后在通知键盘出现的时候,将tableview的内容设置在键盘的上边.但是不知道为什么,我的键盘出现了,但是tableview却没有出现.但是在我输入的时候,tableview又可以上去. 我觉得上述方法不可行. 2.我就是用uitextFiled  这样的话当键盘出来的时候,tableview确实能够 上移,但是我的天呀,uitextFiled 竟然不能换行!!!! 这

文献编号:19Mar - 11 2019年04月23日三读,会其精髓: 相信这种方法的话,那么它的精髓是什么,如何整合出这个core gene set. 首先要考虑样本的选择,样本里是否存在明显的分层? 2019年04月01日再读:精读: 已经发现我的data没法在PCA里有明显的规律:应该可以直接从bulk RNA-seq里获取有价值的信息,那么single cell到底有什么优势呢?回答:单细胞的数据是必须的,它可以把core genes锚定到case-control pseudotime,

在ios实际开发当中,我们常常用到Core Data做为数据储存首选.但在处理一些大量复杂的数据值且数据之间相互关联的时候,这就不得不使用关系型数据库来实现.例如一个导航程序,自身应该包含大量的地图自身数据并且数据需要在app启动的时候就开始读取加载.而且数据本身变动不是特别频繁.重复向服务器发送请求获取信息是一件十分浪费的事情.因此我们可以用一个本地数据文件来直接配置.做为轻量级关系型数据库的sqlite是ios开发首选.而xcode本身包含了sqlite库,因此在ios使用的时候不需要额外配

1.代码实现Cell高度自适应的方法 通过代码来实现,需要计算每个控件的高度,之后获取一个cell的 总高度,比较常见的是通过lable的文本计算需要的高度. CGSize labelsize = [@"asdassdas" sizeWithFont:font constrainedToSize:CGSizeMake(320,2000) lineBreakMode:NSLineBreakModeWordWrap]; 这样就可以计算展示需要的高度,cell里面展示的时候可以在代理的方法内

目录: 1. UITableTableViewCell 2. tag技术 3. 自定义Cell 4. 用nib文件构造自定义的静态表 5. TableView数据模型总结 6. Xcode代码调试 <#name#> 回到顶部 1.UITableTableViewCell [1-TableViewCell-contentView] 1. UITableViewCell : UIView -contentView -imageView -textLabel -detailTextLabel -自定

昨天我们写了使用系统的cell怎样创建tableView,今天我们再细分一下,就是不同风格的cell,我们怎写代码.先自己创建一个cell,继承于UItableviewcell 我们看看 cell 里面的代码怎么写的,我现在把 整个 cell 代码展示出来. import UIKit class HomeTableViewCell: UITableViewCell { let oneImage:UIImageView = UIImageView() override init(style: UI

iOS回顾笔记(08) -- 自定义Cell的类型和创建步骤总结 项目中我们常见的自定义cell主要分为两种 等高cell:如应用列表.功能列表 非等高cell:如微博列表.QQ聊天页面 下面对这两类cell的创建方式简单记录各步骤. 等高Cell 等高cell通常有三种创建方式: storyboard自定义cell xib自定义cell 代码创建cell(使用frame计算/使用Autolayout布局) 下面分别记录每种创建步骤: 1. storyboard自定义cell 1.创建一个继

1.前言 iOS开发时,经常接触到的列表展示就是Tableview再熟悉不过了,但是如果接触到多层多级cell的展示,用大牛Augustyniak写的RATreeView是最好不过的了,Git地址:https://github.com/Augustyniak/RATreeView 闲话少说,重点在下面: 2.导入RATreeView 如果安装了CocoaPods,就直接在podfile文件里面添加  pod 'RATreeView', 保存后直接终端输入 pod install,就可以导入到项目

参考: 诱导性多能干细胞 Induced pluripotent stem cell Induced Pluripotent Stem Cells: Problems and Advantages when Applying them in Regenerative Medicine Induced pluripotency: history, mechanisms, and applications Targeting RNA foci in iPSC-derived motor neuron

在M上 1.cell的展示,一直都是依靠数据源的支持.所以,必须要在数据源里面新增bool,默认为false 在V上 2.cell的setModel方法里面,将数据源的新增bool赋值为cell的是否选中 在C上 3.在控制器上,接受cell的点击事件方法里面,也就是 func tableView(tableView: UITableView, didSelectRowAtIndexPath indexPath: NSIndexPath) {} 里面,遍历数据源,将数据源的bool设置复位成fa

生物信息学 Cell theory:7个要点 All known living things are made up of one or more cells. All living cells arise from pre-existing cells by division. The cell is the fundamental unit of structure and function in all living organisms. The activity of an organi