stringtie 新转录本多为单外显子

2024-08-29

史上最全 | 39个RNAseq分析工具与对比

文献:Sahraeian S M E, Mohiyuddin M, Sebra R, et al. Gaining comprehensive biological insight into the transcriptome by performing a broad-spectrum RNA-seq analysis[J]. Nature Communications, 2017, 8(1):59. 这是一篇在NC上发表的使用RNAseq工具对比的一篇文献,解读这篇文献对我们使用RNAseq

HTML5初步——新的表单元素和属性

HTML5初步--新的表单元素和属性 HTML5初步--新的表单元素和属性 <!DOCTYPE html> <html> <head> <meta charset="utf-8" /> <title>HTML5 移动Web开发指南</title> <style type="text/css"> h1, h2, h3, h4, h5, h6 { text-align: center;

HTML5 的新的表单属性

本章讲解涉及 <form> 和 <input> 元素的新属性. 新的 form 属性: autocomplete novalidate 新的 input 属性: autocomplete autofocus form form overrides (formaction, formenctype, formmethod, formnovalidate, formtarget) height 和 width list min, max 和 step multiple pattern

表单验证—html5新特性表单验证

一.表单 <body> <section id="register"> <div><img src="images/logo.jpg" alt="logo" /><img src="images/banner.jpg" alt="banner" /></div> <h1 class="hr_1">新用户注

drf-更新四大接口-单改整体-单改局部-群改整体-群改局部-04

目录复习基于前一天序列化基础整体单改单与整体局部修改复习 """ 1.ModelSerializer序列化类 models.py class BaseModel(models.Model): is_delete = models.BooleanFiled(default=Flase) class Meta: abstract = True # ***** class Car(BaseModel): name = models.CharFiled(max_length

C# 新特性操作符单?与??和 ?. 的使用

1.单问号(?) 1.1 单问号运算符可以表示:可为Null类型,C#2.0里面实现了Nullable数据类型 //A.比如下面一句,直接定义int为null是错误的,错误提示为无法将null转化成int,因为后者是不可以为null的值类型. private int getNum = null; //B.如果修改为下面的写法就可以初始指为null,在特定情况下?等同于基础类型为Nullable. private int? getNum = null; private Nullable<int>

mysql使用存储过程,自动生成新的表单

use mydb; delimiter // CREATE procedure create_table(In imax int) BEGIN DECLARE `@i` int(11); DECLARE `@sqlstr` varchar(2560); declare `@date` date; declare `@name` varchar(22); SET `@i`= 0; WHILE `@i` < imax DO set `@date` = DATE_AD

转录本组装软件StringTie的使用说明

转录本组装软件StringTie的使用说明 StringTie 转录本组装软件StringTie的使用说明转录组分析流程 HISTA + StringTie 组合.其Protocol 发表在Nature Protocol 上“Transcript-level expression analysis of RNA-seq experiments with HISAT, StringTie and Ballgown” 其中StringTie 在组装转录本的完整度,精度和速度方面都较以往的cuffl

H5表单新特性

1.HTML5表单新特性之——新的input type <input type=" "> HTML5之前已有的input type: text.password.radio.checkbox.file.submit.reset.button.image.hidden HTML5新增的input type: 1.Email:邮件输入域,在表单提交时提供简单的邮箱格式验证,并弹出一个提示矿口(可定制内容不能定制样式) <input type="email&quo

HTML5——新表单元素表单属性语义元素

表单元素新的表单元素 datalist——输入域选项列表 keygen——提供一种验证用户的可靠方法 output——不同类型的输出,比如计算或脚本输出表单属性 <form> / <input> autocomplete 属性——自动填充 <form> novalidate 属性——无需验证 <input> autofocus 属性——自动对焦 <input> form 属性——引用别处表单 <input> formaction

HTML的表格标签，列表标签，表单标签，HTML5有哪些新特性

欢迎大家去博客冰山一树Sankey,浏览效果更好.直接右上角搜索该标题即可博客园主页:博客园主页-冰山一树Sankey CSDN主页:CSDN主页-冰山一树Sankey 前端学习:学习地址:黑马程序员pink老师前端入门教程,零基础必看的h5(html5)+css3+移动,下面这些都是一些学习笔记.临渊羡鱼,不如退而结网!!愿我自己学有所成,也愿每个前端爱好者学有所成一. 表格标签 1.1 表格的主要作用表格主要用于显示.展示数据,因为它可以让数据显示的非常的规整,可读性非常好.特别是后台

HTML 5中不同的新表单元素类型是什么？

HTML 5推出了10个重要的新的表单元素: Color. Date Datetime-local Email Time Url Range Telephone Number Search

转录组分析---Hisat2+StringTie+Ballgown使用

转录组分析---Hisat2+StringTie+Ballgown使用 (2016-10-10 08:14:45) 转载▼ 标签: 生物信息学转录组 1.Hisat2建立基因组索引: First, using the python scripts included in the HISAT2 package, extract splice-site and exon information from the gene annotation file: $ extract_splice_

读书笔记：《HTML5开发手册》Web表单

这是补充HTML5基础知识的第五篇内容,其他为: 一.HTML5-- 新的结构元素二.HTML5-- figure.time.details.mark 三.HTML5-- details活学活用四.HTML5-- 现存元素的变化在之前的笔记中记录了HTML5标签元素的语义以及新定义,本周开始进入Web表单部分的学习,该章节已经读过一遍,很多表单验证的工作都可以通过HTML5完成!现在整理笔记,再次进入Web表单的神奇地域. 因该书出版较早,很多东西已经更改,我会在文中已经更正. 一.表单验

StringTie用法详解

StringTie 参考链接: https://ccb.jhu.edu/software/stringtie/index.shtml?t=manual#input https://www.cnblogs.com/adawong/articles/7977314.html 参数简介 StringTie的基本用法: stringtie <aligned_reads.bam> [options]* 其中,aligned_reads.bam 是输入文件,该输入文件要求必须按其基因组位置排序, HISA

HISAT2+StringTie+Ballgown安装及使用流程

HISAT2+StringTie+Ballgown安装及使用流程 2015年Nature Methods上面发表了一款快速比对工具hisat,作为接替tophat和bowtie的比对工具,它具有更快的比对速度和更高的比对率,最近把这个流程走完一遍,感觉优势还是很明显的. 一.HISAT2: 1.下载安装: hisat2下载地址:ftp://ftp.ccb.jhu.edu/pub/infphilo/hisat2/downloads/hisat2-2.1.0-Linux_x86_64.zip his

转录组组装软件stringtie

StringTie是約翰·霍普金斯大學计算机生物中心开发的一款转录组组装软件,在组装转录本的完整度,精度和速度方面都较以往的cufflinks 有很大的提升,也是目前有参考基因组转录组主流的组装软件. 软件的下载 wget http://ccb.jhu.edu/software/stringtie/dl/stringtie-1.3.6.Linux_x86_64.tar.gz tar zxvf stringtie-1.3.6.Linux_x86_64.tar.gz StringTie 使用说明:新

HTML5 学习总结（二）——HTML5新增属性与表单元素

一.HTML5新增属性 1.1.contextmenu contextmenu的作用是指定右键菜单. <!DOCTYPE html> <html> <head> <meta charset="UTF-8"> <title></title> </head> <body> <div id="div1" style="height:900px; backgrou

HTML5 学习笔记（二）——HTML5新增属性与表单元素

目录一.HTML5新增属性 1.1.contextmenu 1.2.contentEditable 1.3.hidden 1.4.draggable 1.5.data-* 1.6.placeholder占位属性 1.7.required必填属性 1.8.pattern正则属性 1.9.autofocus自动聚焦属性 1.10.autocomplete自动完成属性 1.11.novalidate不验证属性 1.12.multiple多选属性二.HTML5表单新功能解析 2.1.表单结构更自由

HTML5和CSS3新特性一览

HTML5 1.HTML5 新元素 HTML5提供了新的元素来创建更好的页面结构: 标签描述 <article> 定义页面独立的内容区域. <aside> 定义页面的侧边栏内容. <bdi> 允许您设置一段文本,使其脱离其父元素的文本方向设置. <command> 定义命令按钮,比如单选按钮.复选框或按钮 <details> 用于描述文档或文档某个部分的细节 <dialog> 定义对话框,比如提示框 <summary>

html5新特性

这一篇博文不会告诉你怎么去使用html5的新特性,只会给你总结一下新特性------对于好学的人可以把这篇文章当做一个目录对于初接触的人来说是一个导向对于已经接触过的人来说是一个检测你掌握程度的检测 html5新特性综述: 1.用于绘画的canvas和SVG, canvas和SVG都允许在浏览器中创建图片,但是他们的实现原理是不同的. SVG通过xml完成2d图形的绘制:----------反正我不用 canvas是通过JavaScript完成2d图形:---------我也不常手写他最多也

stringtie 新转录本多为单外显子

热门专题