本文首发于”生信补给站“,https://mp.weixin.qq.com/s/yhMgkST-rVD6SaQS7R-eoA 桑基图(Sankey diagram),是一种特定类型的流程图,图中延伸的分支的宽度对应数据流量的大小,通常应用于能源.材料成分.金融等数据的可视化分析. 因1898年Matthew Henry Phineas Riall Sankey绘制的“蒸汽机的能源效率图”而闻名,此后便以其名字命名为“桑基图”. 一 载入R包,数据 本文使用TCGA数据集中的LIHC的临床数据进行

  /* 数据统计与IO 重定向版模板 描述:本机测试用文件数据流重定向,一旦提交到比赛就自动“删除”重定向语句 */ # define LOCAL #include<stdio.h> #include<time.h> int main(){ #ifdef LOCAL freopen("data.in","r", stdin); freopen("data.out","w", stdout); cloc

转载生信技能树 https://mp.weixin.qq.com/s/JB_329LCWqo5dY6MLawfEA TCGA数据源 - R包RTCGA的简单介绍 - 首先安装及加载包 - 指定任意基因从任意癌症里面获取芯片表达数据 - 绘制指定基因在不同癌症的表达量区别boxplot - 更多boxplot参数 - 指定任意基因从任意癌症里面获取测序表达数据 - 用全部的rnaseq的表达数据来做主成分分析 - 用5个基因在3个癌症的表达量做主成分分析 - 用突变数据做生存分析 - 多个基因在多

由于经常需要涉及到TCGA数据的分析,我简单的整理了一下数据批量下载的文件后缀. cancer_name <- "SKCM" output_path <- paste0("/home/wang/Documents/课题/data/zip/", cancer_name) system(paste0("mkdir ", output_path)) axel_string <- paste0("axel -n 30 -o &

Spring Cloud(六):Hystrix 监控数据聚合 Turbine[Finchley 版]  发表于 2018-04-17 |  更新于 2018-05-07 |  上一篇我们介绍了使用 Hystrix Dashboard 来展示 Hystrix 用于熔断的各项度量指标.通过 Hystrix Dashboard,我们可以方便的查看服务实例的综合情况,比如:服务调用次数.服务调用延迟等.但是仅通过 Hystrix Dashboard 我们只能实现对服务当个实例的数据展现,在生产环境我们的

不多说了,原理采用xlwt导出excel文件,所谓的强化版指的是实现在网页上选择一定条件导出对应的数据 之前我的博文出过这类文章,但只是实现导出数据,这次左思右想,再加上网上的搜索,终于找出方法实现条件导出的功能了. 先上图: 再说明:核心是使用django视图中的命名组,例如配置url(r'^perm=(?P<a>\w+)$', 'keywork.views.work) 那么,我可以访问网址/perm=参数值,这类的参数值就是我们的条件了,最后在javascript中编写一个click函数弹

MWeb Lite 版的文档库中的文档要搬到 MWeb 正式版中,如果 Lite 版的文档中没有图片或者只有少量图片,可以用导入导出为 Markdown 的方法. 否则的话请用以下方式(注意下面这个方法会将 MWeb 正式版的所有内容都换为 Lite 版): 1. 打开 Lite 版文档库文档所在的文件夹 如上图,选择 Lite 版文档库中的任何一篇文章,右键标题栏,从图中可以看到这个文档的保存位置,选择 MWeb 并点击,会打开 Lite 版文档库中的文档所保存的位置,会打开如下图的 Find

TCGA 的数据可以在5个组织机构获取,它们都提供了类似的接口来供用户下载数据. cgdsR 包是cBioPortal 提供的R包 http://www.cbioportal.org/rmatlab cgds -- Cancer genomic Data Service 安装 cgdsR >install.packages("cgdsR", repos="http://cran.us.r-project.org") 使用 cgdsR library("

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上一篇文章<Python爬虫:抓取新浪新闻数据>详细解说了如何抓取新浪新闻详情页的相关数据,但代码的构建不利于后续扩展,每次抓取新的详情页时都需要重新写一遍,因此,我们需要将其整理成函数,方便直接调用. 详情页抓取的6个数据:新闻标题.评论数.时间.来源.正文.责任编辑. 首先,我们先将评论数整理成函数形式表示: import requests import json import re comments_url = 'http://comment5.news.sina.com.cn/page

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吐槽 最近新项目需要用到导出数据到Excel,试了试之前写的一篇博文,但是感觉那个不太好,主要原因是没能实现样式控制,今天我们就来介绍一种新的导出Excel方法,而且这种方法很轻量级,它利用xml生成,然后加不同后缀进行导出不同格式的文件. 正文 1.前台实现(这里直接使用submit将参数post到后台即可.) function download() { $('form').submit(); } 2.控制器实现 return new XmlExcelResult<MemberMessageL

项目需要引用NPOI的Nuget包:DotNetCore.NPOI-v1.2.2 本篇文章是对WebAPI项目使用NPOI操作Excel时的帮助类:ExcelHelper的改进优化做下记录: 备注:下面的帮助类代码使用的文件格式为:xlsx文件,xlsx相对xls的优缺点代码里有注释,推荐使用xlsx文件保存数据! using Microsoft.AspNetCore.Mvc; using Microsoft.Extensions.Logging; using Microsoft.Net.Htt

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对于做海洋数据处理的同学,会经常遇到nc格式的文件,nc文件的格式全称是NetCDF,具体的详细解释请查询官网[https://www.unidata.ucar.edu/software/netcdf/docs/index.html],一般从全球大洋数据库里面下载的温盐.风场及云量等数据,基本上是nc文件格式,每一个文件里面包含多个数据集,例如最简单的海面表温数据(Sea surface temperature data),数据范围是全球,空间分辨率为0.25 *0.25(~25km),时间分辨

1.内存文件存储系统 Tachyon是一个开源分布式存储系统,拥有高性能.高容错等优点.并具有类Java的文件API.插件式的底层文件系统.兼容Hadoop MapReduce和 Apache Spark 等特征.Tachyon能够为集群框架(如Spark.MapReduce等)提供内存级速度的跨集群文件共享服务,官方号称最高比HDFS吞吐量高300倍.诞生于Berkeley的AMPLab实验室,由该实验室的在读博士李浩源创立.