TM-align是由zhang yang LAB开发的一款做蛋白结构比对的软件. 下载链接:http://zhanglab.ccmb.med.umich.edu/TM-align/TMtools20170708.tar.gz 平台:Linux 下载下来的为TMtools,压缩包里包含TM-align及TM-score的可执行文件及编译文件. 如果嫌安装麻烦,那你就可以使用可执行文件,但是作者推荐重新对两个工具进行编译,因为这样可以根据自己的PC的环境,使TM-align的速度最快. tar zx

技术背景 由于创建软链接这个事情,在算法开发的日常中使用到的并不是很多,因此本文也是做一个简单的回顾.这里我们使用的案例是通过TMalign这个蛋白质打分文件,在编译好可执行文件之后,可以使用建立软链接的方法快捷的使用该可执行文件. TMalign的下载与安装 TMalign可以给两个给定的蛋白质pdb文件进行评分: $ TMalign out.pdb origin.pdb *************************************************************