安装R $sudo apt-get update $sudo apt-get install r-base $sudo apt-get install r-base-dev 安装一些可能的依赖包 $sudo add-apt-repository -y ppa:opencpu/imagemagick $sudo apt-get update $sudo apt-get install -y libmagick++-dev $sudo apt-get install libcurl4-openssl

转自 http://bnuzhutao.cn/archives/901 一般 R 语言的书籍上,介绍安装 R 包的方法都是这样的: install.packages("packagename"); 一般而言这不会成功,因为它默认会安装到系统目录下面,而普通用户在这个目录里并没有写入的权限. 因此,需要在 install.packages 这个函数里面指定安装的路径,例如想安装到 /home/myname/R 这个目录,就这么写: install.packages("packa

MacOS 上安装 R 包 install.packages("data.table") 后面提示是否安装需要编译的版本: Do you want to install from sources the package which needs compilation?y/n 选择了 y 之后,报错 clang: error: unsupported option '-fopenmp' 网上找到的解决方法是: 安装 clang-omp brew install clang-omp 但是提

1.综述 越来越多的R包正在由世界上不同的人所创建,其中一部分原因是devtools包使得开发R包1变得更加简单.devtools包不仅让开发R包变得简单,而且用于分发R包. 当开发者发布一个R包的时候,CRAN2一般是最常用的.使用install.packages()函数可以安装发布在CRAN上的R包.例如,如下方法可以安装dplyr包: install.packages('dplyr') devtools包的install_github()函数用于从Github上安装R包. library(

安装R包("RcppArmadillo")失败,导致依赖该包的DESeq2 无法使用: 首先对gcc,g++升级至4.7, 但依然报错,还是安装不了RcppArmadillo: 报错如下: $ R > source("https://bioconductor.org/biocLite.R") > biocLite("DESeq2") BioC_mirror: https://bioconductor.org Using Biocond

http://forum.ubuntu.org.cn/viewtopic.php?t=401717 ubuntu安装R时候增加软件源到sources.list,sudo apt-get update不能更新,原因如上

https://www.cnblogs.com/jessepeng/p/10984983.html Linux 的R环境,可以通过anaconda jupyter notbook很容易的配置,见我之前的博客  https://www.cnblogs.com/shanyr/p/11276755.html 安装R包 Linux下安装R包一般有2种方式: 1. R CMD INSTALL 下载源码 R CMD INSTALL /.../mypackage.tar.gz 也可指定安装库路径: R CMD

R version: 3.5.3, 3.6.3 更新日期: 2020-9-10 大家测试后多提建议哈, 有问题我会持续更新的 在工作中,我们使用的服务器通常是不能联外网的,这在安装R包的时候产生了巨大的不便.网上有很多帖子使用tools::package_dependencies这个工具下载依赖,但是这个工具是有坑的,相信尝试过的同学依然会发现有些依赖包在下载时被漏掉了,查了很多帖子,这个问题一直没有很好的解决. 今天,我就来解决这个问题,一来,方便自己,二来,服务他人. 我们就用R自己来解决自

1.rpm包安装的,可以用rpm -qa看到,如果要查找某软件包是否安装,用 rpm -qa | grep “软件或者包的名字”. [root@hexuweb102 ~] rpm -qa | grep ruby 2.以deb包安装的,可以用dpkg -l能看到.如果是查找指定软件包,用dpkg -l | grep “软件或者包的名字”: [root@hexuweb102~]dpkg-l|grepruby 3.yum方法安装的,可以用yum list installed查找,如果是查找指定包,命令

在Ubuntu下安装deb包需要使用dpkg命令.Dpkg 的普通用法: 1.sudo dpkg -i <package.deb> 安装一个 Debian 软件包,如你手动下载的文件. 2.sudo dpkg -c <package.deb> 列出 <package.deb> 的内容. 3.sudo dpkg -I <package.deb> 从 <package.deb> 中提取包裹信息. 4.sudo dpkg -r <package&

-------------------------------------------------------------- 自学记录,交流请发送邮件至gxz1984@gmail.com -------------------------------------------------------------- 环境:Ubuntu 14.10 官方网站http://www.rstudio.com/products/rstudio/download-commercial/ 安装R $ sudo a

我个人的环境是 ubuntu 12.04 64 位桌面版. 我自己在安装R 语言时,发现它依赖的库真不是一般的多,所以我在这里简单记录一下我整个安装过程 首先你需要安装 apt-get install libreadline6-dev apt-get install libXt.dev apt-get install gfortran apt-get install zlib1g-dev 然后它开始报告zlib 和 bzip2 库不对,或者是版本不够高,这时候,我就自己分别上对应的官网下载源码,

安装 sudo dpkg -i DEB_PACKAGE 卸载 sudo dpkg -r PACKAGE_NAME 重新配置已安装的包 Reconfigure an existing package 例如: sudo dpkg-reconfigure keyboard-configuration 在终端输入之后,会进入重新配置keyboard的界面.

最近安装github上的R包,经常显示Error in utils::download.file(url, path, method = method, quiet = quiet, : 无法打开URL'https://api.github.com/repos/之类的错误.起初以为是网络的问题,换了网不行,登梯子不行,关闭重启也不行. 在网上查了下,说是R默认是通过IE浏览器来下载包的,所以需要设置IE的安全选项. but,我已经很多年没用过IE了(但很多政府官方网站的操作都是默认IE,而且是要

1,先将R包下载到本地 2,getwd() setwd("F:\\CNV\\Paper\\Case-control\\mHMM") 3, install.packages("mHMM_1.0.zip",repos=NULL) 4, library(mHMM)

ubuntu下的rpm包的安装方法 一般是不能够直接安装的,我们需要一个工具叫alien,先install它吧.然后按照下面择所需. 1.直接安装: alien -i -c filename.rpm 2.转换成deb包再安装 alien -d -c filename.rpm #会生成一个filename.deb包 alien/dpkg -i filename.deb 3.deb格式包的安装: alien/dpkg -i filename.deb 4.tar.gz格式包的安装: alien -d

ubuntu下的各种包的安装方法 Ubuntu麒麟自带的包管理工具有apt-get,但是里面的软件包一般年代比较久远,源更新很慢,支持也很少.如果想安装一些比较新的包,可以尝试到PPA上去找找看,找到之后只需要使用add-apt-repository命令将找到的源添加到本机,然后能使用apt-get安装了. 不过本文不关心如何使用ppa添加源,而是下载完软件包后如何安装.首先,我们需要一个工具叫alien,先用apt-get install它吧.然后按照下面择所需. deb包的安装(二选一) a

包(package)是多个函数的集合,常作为分享代码的基本单元,代码封装成包可以方便其他用户使用.越来越多的R包正在由世界上不同的人所创建并分发,这些分发的R包,可以从CRAN 或 github 上获取,由于向 CRAN 提交包审核非常严格,有些开发者并没有将自己开发的R包提至CRAN的意向,通过 devtools 可以轻松从 github上下载安装.包的生命周期一般会经历 source.bundled.binary.installed和in-memory五个阶段.参考资料 (http://r-

自动安装(在线安装) 在R的控制台,输入 install.packages("gridExtra") # 安装 gridExtra install.packages("stepNorm", contriburl="http://www.your.url", dependencies = TRUE) # 安装 stepNorm 若要指定安装目录 `mydir`,则输入 install.packages("stepNorm", c

前言 R对windows使用很友好,对Linux来说充满了敌意.小数据可以在windows下交互操作,效果很好很棒.可是当我们要处理大数据,或者要在集群上搭建pipeline时,不得不面对在Linux上装R及想要的R包这个难题,尤其是对非root用户而言更是艰难重重. 准备依赖库 依次安装:zlib/bzip/liblzma/pcre/curl,注意顺序和版本.目前3.4以上3.6以下R版本相对较为稳定和不过时,我自己安装的是3.5.2. cd zlib-1.2.11 ./configure -