REF https://www.plob.org/article/5987.html 解压后,查看html格式的结果报告.结果分为如下几项: 结果分为绿色的"PASS",黄色的"WARN"和红色的"FAIL". 1 Basic statistics如下面例子所示: 2 Per base sequence qualityquality就是Fred值,-10*log10(p),p为测错的概率.所以一条reads某位置出错概率为0.01时,其quali

Nature Biotechnology:人类基因研究走近平民 数据是基础解读更重要 5万美元可以做什么?最近,美国斯坦福大学教授斯蒂芬·夸克在国际著名学术期刊<自然·生物技术>发表论文宣布,只用3个人.4周.1台已经上市的仪器,花费不到5万美元,就绘制出了自己的全基因组图谱.虽然价格还有些高,但比起去年的25万美金,显然离走近平民,又近了一大步. 5万美元可以做什么?最近,美国斯坦福大学教授斯蒂芬·夸克在国际著名学术期刊<自然·生物技术>发表论文宣布,只用3个人.4周.1台已经上

原文链接:http://www.infoq.com/cn/articles/depth-interpretation-of-kafka-data-reliability Kafka起初是由LinkedIn公司开发的一个分布式的消息系统,后成为Apache的一部分,它使用Scala编写,以可水平扩展和高吞吐率而被广泛使用.目前越来越多的开源分布式处理系统如Cloudera.Apache Storm.Spark等都支持与Kafka集成. 1 概述 Kafka与传统消息系统相比,有以下不同: 它被设计

转帖:http://www.infoq.com/cn/articles/depth-interpretation-of-kafka-data-reliability Kafka起初是由LinkedIn公司开发的一个分布式的消息系统,后成为Apache的一部分,它使用Scala编写,以可水平扩展和高吞吐率而被广泛使用.目前越来越多的开源分布式处理系统如Cloudera.Apache Storm.Spark等都支持与Kafka集成. 1 概述 Kafka与传统消息系统相比,有以下不同: 它被设计为一

在使用淘宝时发现搜索框很神奇,它可以将将我们想要的商品全部查询出来,但是我们并感觉不到数据库查询的过程,速度很快.通过阅读这篇文章让我知道了搜索框背后包含着很多技术,对我以后的学习可能很有借鉴. 平时都常用搜索框,应该用的都是在线搜索,应该是在数据库中查询信息.但什么是离线搜索呢?在阿里工程中把“将各种来源数据转换处理后送入搜索引擎等‘在线’服务的系统称为“离线”系统.离线系统是一个大数据系统,它有以下一些特点: 1.任务模型上区分全量和增量 (1)全量是指将搜索业务数据全部重新处理生成,并传送

1 概述 Kakfa起初是由LinkedIn公司开发的一个分布式的消息系统,后成为Apache的一部分,它使用Scala编写,以可水平扩展和高吞吐率而被广泛使用.目前越来越多的开源分布式处理系统如Cloudera.Apache Storm.Spark等都支持与Kafka集成. Kafka凭借着自身的优势,越来越受到互联网企业的青睐,唯品会也采用Kafka作为其内部核心消息引擎之一.Kafka作为一个商业级消息中间件,消息可靠性的重要性可想而知.如何确保消息的精确传输?如何确保消息的准确存储?如何

离线?在阿里搜索工程体系中我们把搜索引擎.在线算分.SearchPlanner等ms级响应用户请求的服务称之为“在线”服务:与之相对应的,将各种来源数据转换处理后送入搜索引擎等“在线”服务的系统统称为“离线”系统. 特点:1. 任务模型上区分全量和增量(1)全量是指将搜索业务数据全部重新处理生成,并传送给在线引擎,一般是每天一次.这么做有两个原因:有业务数据是daily更新:引擎需要全量数据来高效的进行索引整理和预处理,提高在线服务效率.(2)增量是指将上游数据源实时发生的数据变化更新到在线引擎

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知乎上有一个问题:疫情结束后,你最想做的一件事是什么? 很多人学习python,不知道从何学起.很多人学习python,掌握了基本语法过后,不知道在哪里寻找案例上手.很多已经做案例的人,却不知道如何去学习更加高深的知识.那么针对这三类人,我给大家提供一个好的学习平台,免费领取视频教程,电子书籍,以及课程的源代码!QQ群:1097524789 有人这样回答,最想见的人就是家楼下烧烤店的老板:最想做的事,就是来一扎啤酒,来几十个串,一个人慢慢悠悠地吃,然后看着周围的人热热闹闹地聊天. 一场疫情,终于

文章转载于 Original 2017-07-06 Jolvii 生信百科 介绍一下如何理解 FastQC 各模块的结果 FastQC 的使用 FastQC的安装介绍请看这里.FastQC 支持 fastq.gzip 压缩的 fastq.SAM.BAM 等格式,在不指定文件类型的情况下,FastQC 会根据文件的名字来推测文件的类型: 以 .sam 或者 .bam 结尾的文件会被当作 SAM/BAM 文件来打开,并统计 mapped 和 unmapped reads 在内的所有 reads:其它

在node中,只要涉及到文件IO的场景一般都会涉及到一个类-Stream.Stream是对IO设备的抽象表示,其在JAVA中也有涉及,主要体现在四个类-InputStream.Reader.OutputStream.Writer,其中InputStream和OutputStream类针对字节数据进行读写:Reader和Writer针对字符数据读写.同时Java中有多种针对这四种类型的扩展类,如节点流.缓冲流和转换流等.比较而言,node中Stream类型也和Java中的类似,同样提供了支持字节和

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JVM 判断一段数据到底是数据还是引用类型,首先要看JVM选择用什么方式.通常这个选择会影响到GC的实现. 一.保守式 如果JVM选择不记录任何这种类型的数据,那么它就无法区分内存里某个位置上的数据到底应该解读为引用类型还是整型还是别的什么.这种条件下,实现出来的GC就会是“保守式GC(conservative GC)”. 在进行GC的时候,JVM开始从一些已知位置(例如说JVM栈)开始扫描内存,扫描的时候每看到一个数字就看看它“像不像是一个指向GC堆中的指针”.这 里会涉及上下边界检查(GC堆

算法霸权 作者在华尔街对冲基金德绍集团担任过金融工程师,后来去银行做过风险分析,再后来去做旅游网站的用户分析.后来辞职专门揭露美国社会生活背后的各种算法的阴暗面. 书中提到的算法的技术缺陷,我归纳为两点:第一个比较致命:不准确.不准确有两种体现,首先是算法先天的问题,比如教师评估算法,针对大规模的学生来评估教学质量是可行的,但是具体到一个教师,每年只教30个学生,如果这30个学生中有一两个极好或极差的,会导致对教师的评估出现很大的波动. 算法不准确的第二种情况是得不到反馈因此没法逐步优化,作者举

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解读一:Features for Multi-Target Multi-Camera Tracking and Re-identification Abstract MTMCT:从多个摄像头采集的视频中跟踪多个人. Re-id:从一系列图片中检索与一张被查询图片相似的图片. 我们用CNN为MTMCT和Reid学习好的特征. 贡献包括: ①为训练设计的一个自适应权重的三重损失 ②一种新的艰难身份挖掘技术 我们测验了好的re-id和好的MTMCT分数之间的相关性,并且做了消融研究,以阐明系统主要成分

代码块: python真正的代码块:一个模块,一个函数,一个类,一个文件等都是一个代码块. 但是,在python终端交互模式下,每一条代码都是一个代码块 python在同一个代码块中的变量,初始化对象的命令时,它会将变量与值的对应关系放到一个字典中, 如果下面的代码在遇到初始化对象的命令,他会先从字典中寻找,如果存在相同的值,他会复用,指向的都是同一个内存地址. >>> i1 = 1000 可以理解为这一行在一个文件中. >>> i2 = 1000 可以理解为这一行在另

Apache Doris是一个现代化的MPP分析性数据库产品.是一个由百度开源,在2018年贡献给Apache基金会,成为有顶级开源项目.仅需要亚秒级响应时间即可获得查询结果,可以有效地支持实时数据分析.Apache Doris可以满足多种数据分析需求,如数仓T+1模式固定历史报表,实时数据分析等. 数据模型:Doris中的字段类型: TINYINT 1字节 范围:-2^7 + 1 ~ 2^7 - 1 SMALLINT 2字节 范围:-2^15 + 1 ~ 2^15 - 1 BIGINT 8字节

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