杭白菊是一种流行的药用和食用植物，主要通过黄酮类和咖啡酰奎宁酸(CQAs)的存在发挥其生物活性。然而，菊花头状花序中黄酮和CQA生物合成的调控机制尚不清楚。

本研究采用高效液相色谱法测定了菊花头状花序发育过程中黄酮类化合物和CQAs的含量，发现在S1和S2阶段含量较高，在S3 ~ S5阶段含量逐渐降低。转录组学分析显示，CmPAL1/2、CmCHS1/2、CmFNS、CmHQT和CmHCT是黄酮类化合物和CQAs生物合成的关键结构基因。此外，本研究还通过加权基因共表达相关网络分析(WGCNA)、k-means聚类、相关分析和蛋白互作预测等方法，鉴定与黄酮和CQA生物合成相关的转录因子(TFs)，包括MYB、bHLH、AP2/ERF和MADS-box家族。CmERF/PTI6和CmCMD77被认为是CmMYB3和CmbHLH143的上游调控因子，而CmMYB3和CmbHLH143可能形成复合物，直接调控结构基因CmPAL1/2、CmCHS1/2、CmFNS、CmHQT和CmHCT，从而控制黄酮和CQA的生物合成。

总体而言，这些发现初步揭示了菊花头状花序黄酮和CQAs积累的TF调控网络，为杭白菊品质提升和产业高质量发展奠定了理论基础。

BMC Genomics | 综合代谢组学和转录组学分析揭示了菊花黄酮和咖啡酰奎宁酸的生物合成机制的更多相关文章

  1. 微生物组学数据分析工具综述 | 16S+宏基因组＋宏病毒组＋宏转录组--转载

    转载:https://mp.weixin.qq.com/s/xsL9GuLs7b3nRF8VeRtinQ 建立在高通量测序基础上的微生物群落研究,当前主要有三大类:基于16S/18S/ITS等扩增子做 ...

  2. 【讲座】朱正江——基于LC-MS的非靶向代谢组学

    本次课程主题为<基于LC-MS的非靶向代谢组学>,主要分为代谢组学简介.代谢组学技术简介.非靶向代谢组学方法和数据采集.非靶向代谢组学数据分析和代谢物结构鉴定几个方面. 一.代谢组简介 基 ...

  3. 解读人：范徉，Methylome and Metabolome Analyses Reveal Adaptive Mechanisms in Geobacter sulfurreducens Grown on Different Terminal Electron Acceptors（甲基化组学和代谢组学分析发现Geobacter sulfurreducens生长在不同电子终受体中的适应机制）

    发表时间: (2019年4月) IF:3.950 单位: Fujian Provincial Key Laboratory of Soil Environmental Health and Regul ...

  4. 解读人：谭亦凡，Macrophage phosphoproteome analysis reveals MINCLE-dependent and -independent mycobacterial cord factor signaling（巨噬细胞磷酸化蛋白组学分析揭示MINCLE依赖和非依赖的分支杆菌索状因子信号通路）（MCP换）

    发表时间:2019年4月 IF:5.232 一. 概述: 分支杆菌索状因子TDM(trehalose-6,6’-dimycolate)能够与巨噬细胞C-型凝集素受体(CLR)MINCLE结合引起下游通 ...

  5. Spanve：一种检测大规模空间转录组学数据中空间变异基因的有效统计方法

    文章题目 Spanve: an Effective Statistical Method to Detect Spatially Variable Genes in Large-scale Spati ...

  6. Journal of Proteomics Research | Th-MYCN转基因小鼠的定量蛋白质学分析揭示了Aurora Kinase抑制剂改变代谢途径和增强ACADM以抑制神经母细胞瘤的进展

    题目:Quantitative Proteomics of Th-MYCN Transgenic Mice Reveals Aurora Kinase Inhibitor Altered Metabo ...

  7. Android : 跟我学Binder --- (2) AIDL分析及手动实现

    目录: Android : 跟我学Binder --- (1) 什么是Binder IPC?为何要使用Binder机制? Android : 跟我学Binder --- (2) AIDL分析及手动实现 ...

  8. .Net应该学什么怎么学（三）

    更新时间:2012年06月05日18时26分 来源:传智播客.Net 接上篇[我来解惑].Net应该学什么怎么学(二)七.HTML.JavaScript.Dom        HTML是对网页长什么样 ...

  9. .Net应该学什么怎么学（二）

    更新时间:2012年06月05日18时23分 来源:传智播客.Net 接上篇<[我来解惑].Net应该学什么怎么学(一)>. 二.C#面向对象基础 初学者学面向对象的时候没必要(也做不到) ...

  10. python入门灵魂5问--python学习路线，python教程，python学哪些，python怎么学，python学到什么程度

    一.python入门简介 对于刚接触python编程或者想学习python自动化的人来说,基本都会有以下python入门灵魂5问--python学习路线,python教程,python学哪些,pyth ...

随机推荐

  1. linux解压缩，复制，重命名，删除，目录按更新时间排序，grep递归搜索文档

    linux解压缩,复制,重命名,删除,目录按更新时间排序,grep递归搜索文档 1.解压缩压缩命令 zip -p -r mymail-1026.zip mymail/ 解压命令 unzip mymai ...

  2. 海量数据处理利器 Roaring BitMap 原理介绍

    作者:来自 vivo 互联网服务器团队- Zheng Rui 本文结合个人理解梳理了BitMap及Roaring BitMap的原理及使用,分别主要介绍了Roaring BitMap的存储方式及三种c ...

  3. python 发起PUT请求，报"Method not Allowed" 和 取返回的报文的内容

    发起请求的时候,默认使用的POST请求方式,导致发起请求,返回[405 Method not Allowed ],检查此更新接口的请求方式为PUT,更改请求方式为PUT PUT接口返回的内容,不能通过 ...

  4. Dell服务器配置RIAD并创建热备盘

    在系统启动期间,按F2键进入System Setup(系统设置)主菜单 单击Device Settings(设备设置). 单击所需的RAID controller(RAID控制器)设备. 4.单击Co ...

  5. 超大容量 | 瑞芯微RK3588J工业核心板新增16GB DDR + 128GB eMMC配置！

    作为瑞芯微的金牌合作伙伴,创龙科技在2023年9月即推出搭载瑞芯微旗舰级处理器RK3588J的全国产工业核心板--SOM-TL3588. SOM-TL3588工业核心板是基于瑞芯微RK3588J/RK ...

  6. 全志科技A40i开发板规格书（四核ARM Cortex-A7，主频1.2GHz）

    1.评估板简介 创龙科技TLA40i-EVM是一款基于全志科技A40i处理器设计的4核ARM Cortex-A7高性能低功耗国产评估板,每核主频高达1.2GHz,由核心板和评估底板组成. 评估板接口资 ...

  7. Javascript克隆数据

    JS 复制数据 1 浅复制 具体方法 // 数组 Array.prototype.slice // 普通对象 Object.assign 思考 2 深复制 1) function deepClone( ...

  8. oeasy教您玩转vim - 29 - # 垂直翻页

    ​ 垂直翻页 回忆上节课内容 我们上次了解了横向滚动的相关信息 横滚幅度 - sidescroll 横滚留位 - sidescrolloff 自动换行 - wrap g j.g k 可以逐行上下移动 ...

  9. [ABC363G] Dynamic Scheduling 与 P4511 [CTSC2015] 日程管理

    思路: 对于插入操作,设插入 \(\{t,p\}\): 若当前 \(1 \sim t\) 有空位,那么就放进去. 否则,\(1 \sim t\) 是被塞满了的: 首先容易想到的是找到 \(1 \sim ...

  10. Windows下搭建Vue脚手架CLI

    Vue CLI的使用依赖Node.js,先按照Node.js环境. //安装环境C:\Users\16779>npm install --global vue-cli npm WARN depr ...