• 参考地址:

    https://www.biostars.org/p/56246/

    -q INT only include reads with mapping quality >= INT [0]

    Like for getting the unique reads (a single read mapping at one best position)

    命令如下,也有文献报告使用的-q 2
samtools view -bq 1 file.bam > unique.bam

samtools获取uniq reads的更多相关文章

  1. UiAutomator自动化测试框架介绍

    UiAutomator自动化测试框架介绍 环境搭建 1         必要条件 1.1       JDK 1.2       SDK(API高于15) 1.3       Eclipse 2    ...

  2. SQL查询性能分析

    http://blog.csdn.net/dba_huangzj/article/details/8300784 SQL查询性能的好坏直接影响到整个数据库的价值,对此,必须郑重对待. SQL Serv ...

  3. Java的IO流——（七）

    目录结构:

  4. vue中indexDB的应用

    // indexedDB.js,浏览器本地数据库操作 export default { // indexedDB兼容 indexedDB: window.indexedDB || window.web ...

  5. SAMTOOLS使用 SAM BAM文件处理

    [怪毛匠子 整理] samtools学习及使用范例,以及官方文档详解 #第一步:把sam文件转换成bam文件,我们得到map.bam文件 system"samtools view -bS m ...

  6. 获取linux服务器基本信息脚本

    为了方便日常运维写的一段简单脚本,用于集中获取服务器操作系统.CPU.内存使用.负载.硬盘使用.网络信息. 脚本比较简单,就不解释了,有兴趣的朋友请自行查看. #!/bin/bash##Name:sy ...

  7. samtools常用命令详解

    samtools的说明文档:http://samtools.sourceforge.net/samtools.shtmlsamtools是一个用于操作sam和bam文件的工具合集.包含有许多命令.以下 ...

  8. Pyqt 获取打包二进制文件中的资源

    记得有一次打开一个单独exe程序,点击btn中的一个帮助说明按钮,在同级目录下就多出一个help.chm 文件并自动打开. 那这个exe肯定是把help.chm 打包到exe中,当我触发“帮助”按钮的 ...

  9. kafka使用getOffsetsBefore()获取获取offset异常分析

    根据时间戳获取kafka的topic的偏移量,结果获取的偏移量量数据组的长度为0,就会出现如下的数组下标越界的异常,实现的原理是使用了kafka的getOffsetsBefore()方法: Excep ...

随机推荐

  1. 本地spark下保存rdd为文件

    写随笔大概也是做笔记记录下自己思考的意思吧,之前有些事情觉得做随笔还是比较有用的,mark一下一个有用的网址 关于rdd的操作,网上有很多很多的教程,当初全部顺一遍,除了对rdd这个类型有了点概念,剩 ...

  2. Atcoder Grand Contest 026 (AGC026) F - Manju Game 博弈,动态规划

    原文链接www.cnblogs.com/zhouzhendong/AGC026F.html 前言 太久没有发博客了,前来水一发. 题解 不妨设先手是 A,后手是 B.定义 \(i\) 为奇数时,\(a ...

  3. Zk单机多实例部署

    一.环境准备 当前环境:centos7.3一台软件版本:zookeeper-3.5.2部署目录:/usr/local/zookeeper启动端口:2181,2182,2183配置文件:/usr/loc ...

  4. Anaconda3自带jupyter

    1.cmd命令行中输入 JupyterNotebook 2.系统自动调起下面页面(注册端口冲突是打不开的)

  5. Control.ImeMode属性简释

    在WINFORM中,我们经常遇到如下问题.文本输入框中输入法有时候需要被禁用,或者某些时候全半角输入自动转换.查阅相关资料,现小结如下. (一)Control.ImeMode 属性:获取或设置控件的输 ...

  6. Android根据内网外网连接情况配置服务器访问IP

    新项目的app,可通过内网和外网的服务器ip进行请求访问,但是客户提供了专业终端,终端在wifi情况下走外网内网都可以,但关闭wifi则只能走4G专网,也就是只能走内网. 可前往我的小站查看:Andr ...

  7. 【软工实践】Alpha冲刺（3/6）

    链接部分 队名:女生都队 组长博客: 博客链接 作业博客:博客链接 小组内容 恩泽(组长) 过去两天完成了哪些任务 描述 对推送模块进行详细划分 基于用户的协同过滤,寻找更感兴趣的话题 学习API文档 ...

  8. [Web前端] WEEX、React-Native开发App心得 （转载）

    转自: https://www.jianshu.com/p/139c5074ae5d 2018 JS状态报告: https://2018.stateofjs.com/mobile-and-deskto ...

  9. RTSP、RTMP、HTTP协议

    一.异同1.RSTP.RTMP.HTTP协议共同点RTSP RTMP HTTP都是用在应用层.理论上这三种协议都可以做直播和点播,但直播一般用RTSP和RTMP点播用HTTP.2.RSTP.RTMP. ...

  10. CentOS 安装抓包工具wireshark-tshark抓包工具

    原文出处:razeen -> https://razeen.me/post/how-to-install-tshark-on-centos.html 准备在服务器上用tshark抓包,分析一下数 ...