• 参考地址:

    https://www.biostars.org/p/56246/

    -q INT only include reads with mapping quality >= INT [0]

    Like for getting the unique reads (a single read mapping at one best position)

    命令如下,也有文献报告使用的-q 2
samtools view -bq 1 file.bam > unique.bam

samtools获取uniq reads的更多相关文章

  1. UiAutomator自动化测试框架介绍

    UiAutomator自动化测试框架介绍 环境搭建 1         必要条件 1.1       JDK 1.2       SDK(API高于15) 1.3       Eclipse 2    ...

  2. SQL查询性能分析

    http://blog.csdn.net/dba_huangzj/article/details/8300784 SQL查询性能的好坏直接影响到整个数据库的价值,对此,必须郑重对待. SQL Serv ...

  3. Java的IO流——（七）

    目录结构:

  4. vue中indexDB的应用

    // indexedDB.js,浏览器本地数据库操作 export default { // indexedDB兼容 indexedDB: window.indexedDB || window.web ...

  5. SAMTOOLS使用 SAM BAM文件处理

    [怪毛匠子 整理] samtools学习及使用范例,以及官方文档详解 #第一步:把sam文件转换成bam文件,我们得到map.bam文件 system"samtools view -bS m ...

  6. 获取linux服务器基本信息脚本

    为了方便日常运维写的一段简单脚本,用于集中获取服务器操作系统.CPU.内存使用.负载.硬盘使用.网络信息. 脚本比较简单,就不解释了,有兴趣的朋友请自行查看. #!/bin/bash##Name:sy ...

  7. samtools常用命令详解

    samtools的说明文档:http://samtools.sourceforge.net/samtools.shtmlsamtools是一个用于操作sam和bam文件的工具合集.包含有许多命令.以下 ...

  8. Pyqt 获取打包二进制文件中的资源

    记得有一次打开一个单独exe程序,点击btn中的一个帮助说明按钮,在同级目录下就多出一个help.chm 文件并自动打开. 那这个exe肯定是把help.chm 打包到exe中,当我触发“帮助”按钮的 ...

  9. kafka使用getOffsetsBefore()获取获取offset异常分析

    根据时间戳获取kafka的topic的偏移量,结果获取的偏移量量数据组的长度为0,就会出现如下的数组下标越界的异常,实现的原理是使用了kafka的getOffsetsBefore()方法: Excep ...

随机推荐

  1. AtCoder Grand Contest 015题解

    传送门 \(A\) 找到能达到的最大的和最小的,那么中间任意一个都可以被表示出来 typedef long long ll; int n,a,b;ll res; int main(){ scanf(& ...

  2. 【一起来烧脑】一步学会CSS3体系

    [外链图片转存失败(img-yfi1VPyy-1563434266398)(https://upload-images.jianshu.io/upload_images/11158618-fc8784 ...

  3. Tkinter 之PanedWindow标签

    一.参数说明 参数 作用 background(bg) 设置背景颜色 borderwidth(bd) 设置边框宽度 cursor  指定当鼠标在PanedWindow上飘过的时候的鼠标样式 handl ...

  4. Ubuntu不能连接网络

    我的问题是在选择桥接模式下的界面名称选择错误,在windows中我的Intel7260显示未连接,所以更改为Controller之后好用了,折磨了我大半天.

  5. python中whl的讲解

    whl 格式:这是一个压缩包,在其中包含了py文件,以及经过编译的pyd文件. 这个格式可以使文件在不具备编译环境的情况下,选择合适自己的python环境进行安装. 安装方法如下 进入命令行输入:pi ...

  6. java.util之一：ArrayList

    ArrayList是java中的线性结构的一种表示方法,在java中使用频率非常高,下面来一步一步分析其底层的实现.(JDK1.8) 一.构造函数 ArrayList的构造函数有三个,分别如下, 我们 ...

  7. AOSP---"Android Open-Source Project"

    定义 编辑 "Android Open-Source Project"的缩写 中文意为"Android 开放源代码项目" 内容 编辑 在Android Open ...

  8. qt 应用程序版本设置方法

    pro 增加 VERSION = 1.2.3.4 DEFINES += APP_VERSION=\\\"$$VERSION\\\" 应用程序中用 APP_VERSION 宏就可以获 ...

  9. Visual Studio 2019 使用 Web Deploy 发布远程站点到IIS服务器

    Visual Studio 2019 使用 Web Deploy 发布远程站点到IIS服务器的方式 在开发完项目之后,我们需要把开发的项目发布到指定的服务器上,有两种方式,如下 1.把项目发布成文件系 ...

  10. Statement.setQueryTimeout(seconds)在家中环境的再次试验 证明此语句还是有效的

    对比实验:https://www.cnblogs.com/xiandedanteng/p/11955887.html 这次实验的环境是T440p上安装的Windows版Oracle11g,版本为: O ...