使用spark ml pipeline进行机器学习

一、关于spark ml pipeline与机器学习

一个典型的机器学习构建包含若干个过程

1、源数据ETL

2、数据预处理

3、特征选取

4、模型训练与验证

以上四个步骤可以抽象为一个包括多个步骤的流水线式工作，从数据收集开始至输出我们需要的最终结果。因此，对以上多个步骤、进行抽象建模，简化为流水线式工作流程则存在着可行性，对利用spark进行机器学习的用户来说，流水线式机器学习比单个步骤独立建模更加高效、易用。

受 scikit-learn 项目的启发，并且总结了MLlib在处理复杂机器学习问题的弊端(主要为工作繁杂，流程不清晰)，旨在向用户提供基于DataFrame
之上的更加高层次的 API 库，以更加方便的构建复杂的机器学习工作流式应用。一个pipeline 在结构上会包含一个或多个Stage，每一个
Stage 都会完成一个任务，如数据集处理转化，模型训练，参数设置或数据预测等，这样的Stage 在 ML 里按照处理问题类型的不同都有相应的定义和实现。两个主要的stage为Transformer和Estimator。Transformer主要是用来操作一个DataFrame
数据并生成另外一个DataFrame 数据，比如svm模型、一个特征提取工具，都可以抽象为一个Transformer。Estimator
则主要是用来做模型拟合用的，用来生成一个Transformer。可能这样说比较难以理解，下面就以一个完整的机器学习案例来说明spark ml pipeline是怎么构建机器学习工作流的。

二、使用spark
ml pipeline构建机器学习工作流

在此以Kaggle数据竞赛Display Advertising Challenge的数据集(该数据集为利用用户特征进行广告点击预测)开始，利用spark ml pipeline构建一个完整的机器学习工作流程。

Display
Advertising Challenge的这份数据本身就不多做介绍了，主要包括3部分，numerical型特征集、Categorical类型特征集、类标签。

首先，读入样本集，并将样本集划分为训练集与测试集：

       //使用file标记文件路径，允许spark读取本地文件

        String fileReadPath = "file:\\D:\\dac_sample\\dac_sample.txt";

        //使用textFile读入数据

        SparkContext sc = Contexts.sparkContext;

        RDD<String> file = sc.textFile(fileReadPath,1);

        JavaRDD<String> sparkContent = file.toJavaRDD();

        JavaRDD<Row> sampleRow = sparkContent.map(new Function<String, Row>() {

            public Row call(String string) {

                String tempStr = string.replace("\t",",");

                String[] features = tempStr.split(",");

                int intLable= Integer.parseInt(features[0]);

                String intFeature1  = features[1];

                String intFeature2  = features[2];                String CatFeature1 = features[14];

                String CatFeature2 = features[15];

                return RowFactory.create(intLable, intFeature1, intFeature2, CatFeature1, CatFeature2);

            }

        });

        double[] weights = {0.8, 0.2};

        Long seed = 42L;

        JavaRDD<Row>[] sampleRows = sampleRow.randomSplit(weights,seed);

得到样本集后，构建出 DataFrame格式的数据供spark ml pipeline使用：

        List<StructField> fields = new ArrayList<StructField>();

        fields.add(DataTypes.createStructField("lable", DataTypes.IntegerType, false));

        fields.add(DataTypes.createStructField("intFeature1", DataTypes.StringType, true));

        fields.add(DataTypes.createStructField("intFeature2", DataTypes.StringType, true));

        fields.add(DataTypes.createStructField("CatFeature1", DataTypes.StringType, true));

        fields.add(DataTypes.createStructField("CatFeature2", DataTypes.StringType, true));

        //and so on

        StructType schema = DataTypes.createStructType(fields);

        DataFrame dfTrain = Contexts.hiveContext.createDataFrame(sampleRows[0], schema);//训练数据

        dfTrain.registerTempTable("tmpTable1");

        DataFrame dfTest = Contexts.hiveContext.createDataFrame(sampleRows[1], schema);//测试数据

        dfTest.registerTempTable("tmpTable2");

由于在dfTrain、dfTest中所有的特征目前都为string类型，而机器学习则要求其特征为numerical类型，在此需要对特征做转换，包括类型转换和缺失值的处理。

首先，将intFeature由string转为double，cast()方法将表中指定列string类型转换为double类型，并生成新列并命名为intFeature1Temp，

之后，需要删除原来的数据列并将新列重命名为intFeature1，这样，就将string类型的特征转换得到double类型的特征了。

        //Cast integer features from String to Double

       dfTest = dfTest.withColumn("intFeature1Temp",dfTest.col("intFeature1").cast("double"));

       dfTest = dfTest.drop("intFeature1").withColumnRenamed("intFeature1Temp","intFeature1");

如果intFeature特征是年龄或者特征等类型，则需要进行分箱操作，将一个特征按照指定范围进行划分：

        /*特征转换，部分特征需要进行分箱，比如年龄，进行分段成成年未成年等 */

        double[] splitV = {0.0,16.0,Double.MAX_VALUE};

        Bucketizer bucketizer = new Bucketizer().setInputCol("").setOutputCol("").setSplits(splitV);

再次，需要将categorical 类型的特征转换为numerical类型。主要包括两个步骤，缺失值处理和编码转换。

缺失值处理方面，可以使用全局的NA来统一标记缺失值：

        /*将categoricalb类型的变量的缺失值使用NA值填充*/

        String[] strCols = {"CatFeature1","CatFeature2"};

        dfTrain = dfTrain.na().fill("NA",strCols);

        dfTest = dfTest.na().fill("NA",strCols);

缺失值处理完成之后，就可以正式的对categorical类型的特征进行numerical转换了。在spark
ml中，可以借助StringIndexer和oneHotEncoder完成

这一任务：

        // StringIndexer  oneHotEncoder 将 categorical变量转换为 numerical 变量

        // 如某列特征为星期几、天气等等特征，则转换为七个0-1特征

        StringIndexer cat1Index = new StringIndexer().setInputCol("CatFeature1").setOutputCol("indexedCat1").setHandleInvalid("skip");

        OneHotEncoder cat1Encoder = new OneHotEncoder().setInputCol(cat1Index.getOutputCol()).setOutputCol("CatVector1");

        StringIndexer cat2Index = new StringIndexer().setInputCol("CatFeature2").setOutputCol("indexedCat2");

        OneHotEncoder cat2Encoder = new OneHotEncoder().setInputCol(cat2Index.getOutputCol()).setOutputCol("CatVector2");

至此，特征预处理步骤基本完成了。由于上述特征都是处于单独的列并且列名独立，为方便后续模型进行特征输入，需要将其转换为特征向量，并统一命名，

可以使用VectorAssembler类完成这一任务：

        /*转换为特征向量*/

        String[] vectorAsCols = {"intFeature1","intFeature2","CatVector1","CatVector2"};

        VectorAssembler vectorAssembler = new VectorAssembler().setInputCols(vectorAsCols).setOutputCol("vectorFeature");

通常，预处理之后获得的特征有成千上万维，出于去除冗余特征、消除维数灾难、提高模型质量的考虑，需要进行选择。在此，使用卡方检验方法，

利用特征与类标签之间的相关性，进行特征选取：

        /*特征较多时，使用卡方检验进行特征选择，主要是考察特征与类标签的相关性*/

        ChiSqSelector chiSqSelector = new ChiSqSelector().setFeaturesCol("vectorFeature").setLabelCol("label").setNumTopFeatures(10)

                .setOutputCol("selectedFeature");

在特征预处理和特征选取完成之后，就可以定义模型及其参数了。简单期间，在此使用LogisticRegression模型，并设定最大迭代次数、正则化项：

        /* 设置最大迭代次数和正则化参数 setElasticNetParam=0.0 为L2正则化 setElasticNetParam=1.0为L1正则化*/

        /*设置特征向量的列名，标签的列名*/

        LogisticRegression logModel = new LogisticRegression().setMaxIter(100).setRegParam(0.1).setElasticNetParam(0.0)

                .setFeaturesCol("selectedFeature").setLabelCol("lable");

在上述准备步骤完成之后，就可以开始定义pipeline并进行模型的学习了：

        /*将特征转换，特征聚合，模型等组成一个管道，并调用它的fit方法拟合出模型*/

        PipelineStage[] pipelineStage = {cat1Index,cat2Index,cat1Encoder,cat2Encoder,vectorAssembler,logModel};

        Pipeline pipline = new Pipeline().setStages(pipelineStage);

        PipelineModel pModle = pipline.fit(dfTrain);

上面pipeline的fit方法得到的是一个Transformer，我们可以使它作用于训练集得到模型在训练集上的预测结果：

        //拟合得到模型的transform方法进行预测

        DataFrame output = pModle.transform(dfTest).select("selectedFeature", "label", "prediction", "rawPrediction", "probability");

        DataFrame prediction = output.select("label", "prediction");

        prediction.show();

分析计算，得到模型在训练集上的准确率，看看模型的效果怎么样：

        /*测试集合上的准确率*/

        long correct = prediction.filter(prediction.col("label").equalTo(prediction.col("'prediction"))).count();

        long total = prediction.count();

        double accuracy = correct / (double)total;

        System.out.println(accuracy);

最后，可以将模型保存下来，下次直接使用就可以了：

        String pModlePath = ""file:\\D:\\dac_sample\\";

        pModle.save(pModlePath);

三，梳理和总结：

上述，借助代码实现了基于spark ml pipeline的机器学习，包括数据转换、特征生成、特征选取、模型定义及模型学习等多个stage，得到的pipeline

模型后，就可以在新的数据集上进行预测，总结为两部分并用流程图表示如下：

训练阶段：

预测阶段：

借助于Pepeline，在spark上进行机器学习的数据流向更加清晰，同时每一stage的任务也更加明了，因此，无论是在模型的预测使用上、还是

模型后续的改进优化上，都变得更加容易。