fold change

英文简称 : FC

中文全称 : 倍性变化

所属分类 : 生物科学

词条简介 : 一种用于描述两个用于相比的对象数量差异的方法。例如,第一个样本和第二个样本的量是50/10,那么FC(Ratio)就是5,反之就是0.2。

用这种方法分析微阵列的数据可以说明:

1)从基因表达的绝对值而来的表达变化是有意义的;

2)这种方法可以说明基因表达变化是否显著;

3)可以利用这种模型用于有效数据的筛选。

fold change(ratio)的更多相关文章

  1. 差异基因分析:fold change(差异倍数), P-value(差异的显著性)

    在做基因表达分析时必然会要做差异分析(DE) DE的方法主要有两种: Fold change t-test fold change的意思是样本质检表达量的差异倍数,log2 fold change的意 ...

  2. Fold Change和t分布

    基因表达谱数据 基因表达谱可以用一个矩阵来表示,每一行代表一个基因,每一列代表一个样本(如图1).所有基因的表达谱数据在“gene_exp.txt”文件中存储,第一列为基因的entrez geneid ...

  3. fold change的意义[转载]

    转自:https://zhidao.baidu.com/question/2052933434631672387.html 1.解释 解释:表达值倍数变化 ,分析,消除可能的混杂因素,必要时可以用读段 ...

  4. cuffdiff 和 edgeR 对差异表达基因的描述

    ASE又走到了关键的一步  要生成能决定是否有差异表达的table. 准备借鉴一下cuffdiff和edgeR 的结果 cuffdiff对差异表达基因的描述: 一共十四列: 第一列, test_id ...

  5. DEXSeq

    1)Introduction DEXSeq是一种在多个比较RNA-seq实验中,检验差异外显子使用情况的方法. 通过差异外显子使用(DEU),我们指的是由实验条件引起的外显子相对使用的变化. 外显子的 ...

  6. Analyzing Microarray Data with R

    1) 熟悉CEL file 从 NCBI GEO (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE24460)下载GSE24460. 将得到 ...

  7. airway之workflow

    1)airway简介 在该workflow中,所用的数据集来自RNA-seq,气道平滑肌细胞(airway  smooth muscle cells )用氟美松(糖皮质激素,抗炎药)处理.例如,哮喘患 ...

  8. DESeq2包

    1)简介: DESeq2-package: for differential analysis of count data(对count data 做差异分析) 2)安装 if("DESeq ...

  9. TCGA系列--GDCRNATools

    https://github.com/Jialab-UCR/GDCRNATools GDCRNATools - An R package for downloading, organizing, an ...

随机推荐

  1. php源码分析之PHPAPI宏的作用

    在PHP源码中,我们经常会看到很多函数前面有个PHPAPI,但这是什么呢? 于是我在php源码/main/php.h中找到了它的定义 #ifdef PHP_WIN32 # include " ...

  2. 我也谈 javascript 模块化 -AMD规范

    最近,读了很多有关js模块化编程方面的文章,自己也有些小小的理解,不过,还是得借助别人的总结,在这个基础上谈一谈自己的理解吧!参考:http://www.ruanyifeng.com/blog/201 ...

  3. Sasha and Array

    Sasha and Array time limit per test 5 seconds memory limit per test 256 megabytes input standard inp ...

  4. 适用于kali linux的远程桌面开启方法(从windows xp 远程登录到kali linux )

    为了解决Windows远程桌面访问Ubuntu 12.04 之一 中提到的VNC远程桌面的缺点(见http://www.linuxidc.com/Linux/2012-07/64801.htm),我们 ...

  5. Android--->Button按钮操作

    main.xml中设置两个按钮 <?xml version="1.0" encoding="utf-8"?> <LinearLayout xm ...

  6. AD进行行PCB DRC检查时,软件提示...report_drc.xsl不存在

    之前装过一次AD软件没有报过这样的错误,卸掉后重新装了之后,在对电气规则检查检查时“软件提示...report_drc.xsl不存在”. 原因:之前装的目录默认在C盘下,所以AD软件输出的报告也是默认 ...

  7. Delphi引用C对象文件(转)

    源:http://blog.csdn.net/henreash/article/details/7357618 C语言应用非常广泛,并在世界各地拥有大量的代码库.这些代码库与Delphi的可比性较小, ...

  8. JavaScript 中实现继承的方式(列举3种在前一章,我们曾经讲解过创建类的最好方式是用构造函数定义属性,用原型定义方法。)

    第一种:对象冒充 function ClassA(sColor) { this.color = sColor; this.sayColor = function () { alert(this.col ...

  9. sencha touch环境搭建

    引入touch文件,包括resources和sencha-touch-debug.js文件 index.html文件内容如下: <!DOCTYPE HTML> <html> & ...

  10. 【BZOJ3524/2223】[Poi2014]Couriers 主席树

    [BZOJ3524][Poi2014]Couriers Description 给一个长度为n的序列a.1≤a[i]≤n.m组询问,每次询问一个区间[l,r],是否存在一个数在[l,r]中出现的次数大 ...