fold change(ratio)
英文简称 : FC
中文全称 : 倍性变化
所属分类 : 生物科学
词条简介 : 一种用于描述两个用于相比的对象数量差异的方法。例如,第一个样本和第二个样本的量是50/10,那么FC(Ratio)就是5,反之就是0.2。
用这种方法分析微阵列的数据可以说明:
1)从基因表达的绝对值而来的表达变化是有意义的;
2)这种方法可以说明基因表达变化是否显著;
3)可以利用这种模型用于有效数据的筛选。
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