fold change

英文简称 : FC

中文全称 : 倍性变化

所属分类 : 生物科学

词条简介 : 一种用于描述两个用于相比的对象数量差异的方法。例如,第一个样本和第二个样本的量是50/10,那么FC(Ratio)就是5,反之就是0.2。

用这种方法分析微阵列的数据可以说明:

1)从基因表达的绝对值而来的表达变化是有意义的;

2)这种方法可以说明基因表达变化是否显著;

3)可以利用这种模型用于有效数据的筛选。

fold change(ratio)的更多相关文章

  1. 差异基因分析:fold change(差异倍数), P-value(差异的显著性)

    在做基因表达分析时必然会要做差异分析(DE) DE的方法主要有两种: Fold change t-test fold change的意思是样本质检表达量的差异倍数,log2 fold change的意 ...

  2. Fold Change和t分布

    基因表达谱数据 基因表达谱可以用一个矩阵来表示,每一行代表一个基因,每一列代表一个样本(如图1).所有基因的表达谱数据在“gene_exp.txt”文件中存储,第一列为基因的entrez geneid ...

  3. fold change的意义[转载]

    转自:https://zhidao.baidu.com/question/2052933434631672387.html 1.解释 解释:表达值倍数变化 ,分析,消除可能的混杂因素,必要时可以用读段 ...

  4. cuffdiff 和 edgeR 对差异表达基因的描述

    ASE又走到了关键的一步  要生成能决定是否有差异表达的table. 准备借鉴一下cuffdiff和edgeR 的结果 cuffdiff对差异表达基因的描述: 一共十四列: 第一列, test_id ...

  5. DEXSeq

    1)Introduction DEXSeq是一种在多个比较RNA-seq实验中,检验差异外显子使用情况的方法. 通过差异外显子使用(DEU),我们指的是由实验条件引起的外显子相对使用的变化. 外显子的 ...

  6. Analyzing Microarray Data with R

    1) 熟悉CEL file 从 NCBI GEO (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE24460)下载GSE24460. 将得到 ...

  7. airway之workflow

    1)airway简介 在该workflow中,所用的数据集来自RNA-seq,气道平滑肌细胞(airway  smooth muscle cells )用氟美松(糖皮质激素,抗炎药)处理.例如,哮喘患 ...

  8. DESeq2包

    1)简介: DESeq2-package: for differential analysis of count data(对count data 做差异分析) 2)安装 if("DESeq ...

  9. TCGA系列--GDCRNATools

    https://github.com/Jialab-UCR/GDCRNATools GDCRNATools - An R package for downloading, organizing, an ...

随机推荐

  1. iptables配置vsftp访问

    一.FTP服务简介    FTP服务器有两种工作模式:主动模式和被动模式.这两种方式的特点如下:  (1)主动模式下:  tcp, 20(20号端口用于数据传输),21(21号端口用于控制连接) (2 ...

  2. 任意2个io直接驱动LCD1602,并且不需外加芯片(转)

    http://www.amobbs.com/thread-4301955-1-1.html *此处只摘录部分内容,详细内容请关注原贴. 这就是电路,细心的朋友会发现实物图中有几个贴片的阻容件,秘密就在 ...

  3. 为图片存储而作——记一次UEditor源码的修改

    本文版权归博客园和作者吴双本人共同所有.  写在前面 这是一个数据爆发的网络时代,大家习惯于浏览图文直观带给我们的快速信息.大图片的存储和浏览经常会成为Web服务器的瓶颈.试想如果你的Web服务器依然 ...

  4. 半透命opacity:(0-1),对于IE6版本不支持需要用filter:alpha(opacity=0-100)

    <!DOCTYPE html> <html> <head> <meta charset="utf-8"> <title> ...

  5. C# devExpress GridControl 行中行 子行 多级行

    在工作中经常会碰到需要做行中行,多级行的情况,不熟的情况下,我也只能试着实现. 命名空间 using DevExpress.XtraEditors.Repository; using System.D ...

  6. ubuntu14.04英文环境下安装中文输入法

    ubuntu14.04英文环境下安装中文输入法 发表于1年前(2014-07-12 20:12)   阅读(4478) | 评论(0) 3人收藏此文章, 我要收藏 赞1 9月19日成都 OSC 源创会 ...

  7. localStorage、sessionStorages 使用

    html5中的Web Storage包括了两种存储方式:sessionStorage和localStorage.sessionStorage用于本地存储一个会话(session)中的数据,这些数据只有 ...

  8. paramiko 模块安装

    windows版本: 所需软件有:PyCrypto.ecdsa.paramiko. 一.软件下载地址 1.PyCrypto下载地址:  http://www.voidspace.org.uk/pyth ...

  9. hearbeart

    Heartbeat(Linux-HA工程的一个组件) Heartbeat 项目是 Linux-HA 工程的一个组成部分,它实现了一个高可用集群系统.心跳服务和集群通信是高可用集群的两个关键组件,在 H ...

  10. Cannot call sendError() after the response has been committed - baiyangliu - 博客频道 - CSDN.NET

    body{ font-family: "Microsoft YaHei UI","Microsoft YaHei",SimSun,"Segoe UI& ...