【GROMACS】分子动力学模拟①——环境搭建

系统环境

• Win11 22H2 企业版
• 开启虚拟化、window subsystem for liunx等虚拟机相关的功能
• 应用商店中安装WSL2

安装步骤

• 打开Ubuntu，输入sudo apt full-upgrade,并输入设置好的密码
• 安装cmake编译器sudo apt install cmake
• 安装c和c++编译器sudo apt install gcc&g++
• 下载gromacs源码sudo wget ftp://ftp.gromacs.org/gromacs/gromacs-2022.3.tar.gz(最新网址可以去这里查找)
• 根据官网上的步骤进行快速安装
  
  sudo tar xfz gromacs-2022.3.tar.gz

cd gromacs-2022.3

mkdir build

cd build

sudo cmake .. -DGMX_BUILD_OWN_FFTW=ON -DREGRESSIONTEST_DOWNLOAD=ON

sudo make

sudo make check

sudo make install

sudo source /usr/local/gromacs/bin/GMXRC