每个物种都有一个对应的Taxonomy ID：

9606 :人类

10090 ：小鼠

基因id的更多相关文章

  1. org.Hs.eg.db包简介(转换NCBI、ensemble等数据库中基因ID，symbol等之间的转换)

    1)安装载入 ------------------------------------------- if("org.Hs.eg.db" %in% rownames(install ...

  2. 基因id转换

    DAVID网站提供了id转换的功能 1 选择上传gene list文件 2 选择上传ID的类型,我们ID-list.txt中的是Ensembl Gene ID,所以这里选ENSEMBL_GENE_ID ...

  3. 有基因ID或者基因名，如何拿到对应的KEGG通路图？

    1.https://www.kegg.jp/kegg/tool/map_pathway2.html 2.如下图,筛选出基因所在的通路,并标上不同的颜色. 3.结果页面如下,有些基因会找不到对应的通路, ...

  4. 10、差异基因topGO富集

    参考:http://www.biotrainee.com/thread-558-1-1.html http://bioconductor.org/packages/3.7/bioc/ http://w ...

  5. 下载STRING数据库检索互作关系结果为空，但是在STRING网站却能检索出互作关系，为什么呢？？？关键词用的是蛋白ID（ENSP开头）

    首先介绍下两种方法: 一.本地分析 1.在STRING数据库下载人的互作文件,如下图,第一个文件 https://string-db.org/cgi/download.pl?sessionId=HGr ...

  6. 【基因组预测】braker2基因结构注释要点记录

    目录 流程使用 问题 记录下braker2的使用要点,以备忘记. 流程使用 braker2有很多流程,根据你的数据:组装的基因组.转录组.蛋白(同源,包括近缘或远缘)选择不同流程,官网有说明: htt ...

  7. 关于基因GO分析的DAVID简单使用

    利用DAVID简单的进行GO富集度分析(这里只做简单的分析,即看基因是否存在在GO的三个过程里面) 比如我们有一组要分析的基因:TRPV6    CXADR    PROM1    GRAMD2   ...

  8. KEGG数据库的使用方法与介绍

    KEGG数据库的使用方法与介绍 KEGG的数据 KEGG中的pathway是根据相关知识手绘的,这里的手绘的意思可能是指人工以特定的语言格式来确定通路各组件的联系:基因组信息主要是从NCBI等数据库中 ...

  9. KEGG and Gene Ontology Mapping in Bioinformatic Method

    使用KOBAS进行KEGG pathway和Gene Ontology分析 Article from Blog of Alfred-Feng http://blog.sina.com.cn/u/170 ...

随机推荐

  1. 13 October

    树链剖分 http://www.lydsy.com/JudgeOnline/problem.php?id=1036 https://oi.men.ci/tree-chain-split-notes/. ...

  2. React准备工作

    一.环境准备 使用react官方推荐的脚手架create-react-app 1.安装nodejs 2.npm install -g create-react-app  //全局安装脚手架 3.cre ...

  3. Java网络编程与NIO详解2：JAVA NIO 一步步构建IO多路复用的请求模型

    本文转载自:https://github.com/jasonGeng88/blog 本系列文章将整理到我在GitHub上的<Java面试指南>仓库,更多精彩内容请到我的仓库里查看 http ...

  4. spash和selenium浅析

    Splash是什么: Splash是一个Javascript渲染服务.它是一个实现了HTTP API的轻量级浏览器,Splash是用Python实现的,同时使用Twisted和QT.Twisted(Q ...

  5. 004-URL编码转换函数：escape()、encodeURI()、encodeURIComponent()

    一.概述 函数出现时间:                     escape()                                javascript 1.0             ...

  6. Jmeter从数据库中读取数据

    Jmeter从数据库中读取数据 1.测试计划中添加Mysql Jar包 2.添加线程组 3.添加 jdbc connection configuration 4.添加JDBC Request,从数据库 ...

  7. Git/SVN相关

    svn配置不当: svn1.6之前的版本,通过访问.svn/.entries metasploit auxiliary/scanner/http/svn_scanner 在svn1.7之后的版本,通过 ...

  8. Ubuntu12.04安装MariaDB并修改字符集为UTF-8

    其实按照MariaDB官网的步骤来安装MariaDB特别的简单,只要按照步骤来做,很容易就搞定了. 首先,到MariaDB官网: https://downloads.mariadb.org/maria ...

  9. Codeforces Round #521 (Div. 3) E. Thematic Contests（思维）

    Codeforces Round #521 (Div. 3)  E. Thematic Contests 题目传送门 题意: 现在有n个题目,每种题目有自己的类型要举办一次考试,考试的原则是每天只有一 ...

  10. C# 引用类型的深度拷贝帮助类

    using System; using System.Collections.Generic; using System.IO; using System.Linq; using System.Lin ...