在基因注释时,难免碰到各种GENE在不同数据库之间的ID转换(例如,Ensembl ID 转Entrez ID,或者Entrez ID与GENE Symbol之间的转换)。这里介绍一下常用的三个在线网站, DAVIDbioDBnetEnsembl BiomartDAVID访问太慢,Ensembl Biomart参数配置太麻烦,推荐使用bioDBnet

bioDBnet RESET API

bioDBnet除支持web在线转换外,还提供了RESET API接口,允许程序语言(python、perl、R等)进行访问。

参考资料

DAVID

bioDBnet

Ensembl Biomart

geneid/genesymbol/ensemblid等之间的转换的更多相关文章

  1. org.Hs.eg.db包简介(转换NCBI、ensemble等数据库中基因ID,symbol等之间的转换)

    1)安装载入 ------------------------------------------- if("org.Hs.eg.db" %in% rownames(install ...

  2. JSON字符串和JS对象之间的转换

    JSON字符串和JS对象之间的转换 1 json字符串转换为js对象 1.1 标准json格式字符串转换为Js对象  JSON字符串 str JSON.parse(str) eval(str) eva ...

  3. C# Stream 和 byte[] 之间的转换

    一. 二进制转换成图片 MemoryStream ms = new MemoryStream(bytes); ms.Position = ; Image img = Image.FromStream( ...

  4. Java基础——基本类型和包装类、基本类型和字符串之间的转换

    基本类型和包装类之间的转换 基本类型和包装类之间经常需要互相转换,以 Integer 为例(其他几个包装类的操作雷同哦): 在 JDK1.5 引入自动装箱和拆箱的机制后,包装类和基本类型之间的转换就更 ...

  5. String类型和基本数据类型之间的转换

    Java 中基本类型和字符串之间的转换 在程序开发中,我们经常需要在基本数据类型和字符串之间进行转换. 其中,基本类型转换为字符串有三种方法: 1. 使用包装类的 toString() 方法 2. 使 ...

  6. Json与javaBean之间的转换工具类

    /**  * Json与javaBean之间的转换工具类  *  * {@code 现使用json-lib组件实现  *    需要  *     json-lib-2.4-jdk15.jar  * ...

  7. Stream 和 byte[] 之间的转换

    Stream 和 byte[] 之间的转换 一. 二进制转换成图片 ? 1 2 3 4 5 MemoryStream ms = new MemoryStream(bytes); ms.Position ...

  8. 百度坐标(BD09)、国测局坐标(火星坐标,GCJ02)、和WGS84坐标系之间的转换(JS版代码)

    /** * Created by Wandergis on 2015/7/8. * 提供了百度坐标(BD09).国测局坐标(火星坐标,GCJ02).和WGS84坐标系之间的转换 */ //定义一些常量 ...

  9. java中的字符,字符串,数字之间的转换

    string 和int之间的转换 string转换成int  :Integer.valueOf("12") int转换成string : String.valueOf(12) ch ...

随机推荐

  1. 【leetcode刷题笔记】Reverse Nodes in k-Group

    Given a linked list, reverse the nodes of a linked list k at a time and return its modified list. If ...

  2. dsp2812 pwm配置

    肚子疼了好几天,今天稍微好点,简单写点东西. 好几个月前做的项目,有些地方已经记不清楚了,但是突然客户又来问关于代码配置的情况,重新查看了代码,把相关的知识也整理一下. dsp2812中有好几个时钟相 ...

  3. 如何用<Enter>键代替<Tab>键实现光标焦点转移?

    1.在主窗体的private中定义过程: procedure doenterastab(var Msg:TMsg;var Handled:Boolean); begin    if Msg.messa ...

  4. [转] 在Mac上搭建React Native开发环境

    原文链接: http://blog.csdn.net/xiangzhihong8/article/details/53914336 概述 前面我们介绍过在window环境下开发React Native ...

  5. linux挂载/卸载优盘

    linux载入优盘 查看优盘 ls /dev/ sdb1 挂载到/mnt/usb目录 mount /dev/sdb1 /mnt/usb ntfs优盘需要安装ntfs-3g mount -t ntfs- ...

  6. 启动Hadoop时DFSZKFailoverController没有启动

    在启动Hadoop成功后,并没有报错信息,jps查看进程,发现DFSZKFailoverController没有启动成功,后来发现是因为防火墙的原因,关掉重试就OK了 systemctl stop f ...

  7. Hibernate和Struts分页查询

    分页查询数据库方法 /** * 分页查询方法 * @param sql,pageNO,maxResult * @return List */ public List<Object> que ...

  8. HTTP- 头部信息

    HTTP 头部信息由众多的头域组成,每个头域由一个域名,冒号(:)和域值三部分组成.域名是大小写无关的,域值前可以添加任何数量的空格符,头域可以被扩展为多行,在自每行开始处,使用至少一个空格或制表符. ...

  9. cmd(或者说DOS窗口)输出内容到文件

    格式是:command >> filefullpath 格式是:DOS命令>>文件名全路径 举例说明: dir *.* >> D:\abc.txt dir *.* ...

  10. hdu-1025 Constructing Roads In JGShining's Kingdom(二分查找)

    题目链接: Constructing Roads In JGShining's Kingdom Time Limit: 2000/1000 MS (Java/Others)     Memory Li ...