geneid/genesymbol/ensemblid等之间的转换
在基因注释时,难免碰到各种GENE在不同数据库之间的ID转换(例如,Ensembl ID 转Entrez ID,或者Entrez ID与GENE Symbol之间的转换)。这里介绍一下常用的三个在线网站, DAVID、bioDBnet、Ensembl Biomart, DAVID访问太慢,Ensembl Biomart参数配置太麻烦,推荐使用bioDBnet。
bioDBnet RESET API
bioDBnet除支持web在线转换外,还提供了RESET API接口,允许程序语言(python、perl、R等)进行访问。
参考资料
geneid/genesymbol/ensemblid等之间的转换的更多相关文章
- org.Hs.eg.db包简介(转换NCBI、ensemble等数据库中基因ID,symbol等之间的转换)
1)安装载入 ------------------------------------------- if("org.Hs.eg.db" %in% rownames(install ...
- JSON字符串和JS对象之间的转换
JSON字符串和JS对象之间的转换 1 json字符串转换为js对象 1.1 标准json格式字符串转换为Js对象 JSON字符串 str JSON.parse(str) eval(str) eva ...
- C# Stream 和 byte[] 之间的转换
一. 二进制转换成图片 MemoryStream ms = new MemoryStream(bytes); ms.Position = ; Image img = Image.FromStream( ...
- Java基础——基本类型和包装类、基本类型和字符串之间的转换
基本类型和包装类之间的转换 基本类型和包装类之间经常需要互相转换,以 Integer 为例(其他几个包装类的操作雷同哦): 在 JDK1.5 引入自动装箱和拆箱的机制后,包装类和基本类型之间的转换就更 ...
- String类型和基本数据类型之间的转换
Java 中基本类型和字符串之间的转换 在程序开发中,我们经常需要在基本数据类型和字符串之间进行转换. 其中,基本类型转换为字符串有三种方法: 1. 使用包装类的 toString() 方法 2. 使 ...
- Json与javaBean之间的转换工具类
/** * Json与javaBean之间的转换工具类 * * {@code 现使用json-lib组件实现 * 需要 * json-lib-2.4-jdk15.jar * ...
- Stream 和 byte[] 之间的转换
Stream 和 byte[] 之间的转换 一. 二进制转换成图片 ? 1 2 3 4 5 MemoryStream ms = new MemoryStream(bytes); ms.Position ...
- 百度坐标(BD09)、国测局坐标(火星坐标,GCJ02)、和WGS84坐标系之间的转换(JS版代码)
/** * Created by Wandergis on 2015/7/8. * 提供了百度坐标(BD09).国测局坐标(火星坐标,GCJ02).和WGS84坐标系之间的转换 */ //定义一些常量 ...
- java中的字符,字符串,数字之间的转换
string 和int之间的转换 string转换成int :Integer.valueOf("12") int转换成string : String.valueOf(12) ch ...
随机推荐
- bootstrap0
bootstrap模板为使IE6.7.8版本(IE9以下版本)浏览器兼容html5新增的标签,引入下面代码文件即可. <script src="https://oss.maxcdn.c ...
- android 真心话大冒险 摇色子
android 真心话大冒险 摇色子 软件
- 命令行 -- 命令"%cd%"
1. @echo off echo 当前盘符:%~d0 echo 当前盘符和路径:%~dp0 echo 当前批处理全路径:%~f0 echo 当前盘符和路径的短文件名格式:%~sdp0 echo 当前 ...
- 英语发音规则---字母组合oo的发音规律
英语发音规则---字母组合oo的发音规律 一.总结 一句话总结:在英语单词中,字母组合oo多数读长音/u:/,少数读短音/ʊ/.另外,还有极少数的特殊情况读/ʌ/, 在英语单词中,字母组合oo多数读长 ...
- tomcat警告:Setting property 'source' to 'org.eclipse.jst.j2ee.server:ServletPro' did not find a matching property
警告: [SetPropertiesRule]{Server/Service/Engine/Host/Context} Setting property 'source' to 'org.eclips ...
- 封装一个简单的Hibernate SessionFactory
封装Hibernate框架中的session工厂 ,方便很多,免去了很多重复无用的代码 package com.maya.test; import org.hibernate.*; import ...
- hadoop_学习_00_资源帖
一.精品 1.虚无境的博客 随笔分类 - hadoop 二.参考资料 1.大数据学习之路(持续更新中...) 2.Hadoop安装教程_单机/伪分布式配置_CentOS6.4/Hadoop2.6.0 ...
- Tomcat启动分析(我们为什么要配置CATALINA_HOME环境变量)
原文:http://www.cnblogs.com/heshan664754022/archive/2013/03/27/2984357.html Tomcat启动分析(我们为什么要配置CATALIN ...
- stl_queue.h
stl_queue.h // Filename: stl_queue.h // Comment By: 凝霜 // E-mail: mdl2009@vip.qq.com // Blog: http:/ ...
- freeMarker(十一)——模板语言之指令
学习笔记,选自freeMarker中文文档,译自 Email: ddekany at users.sourceforge.net 1.assign 概要 <#assign name1=value ...