geneid/genesymbol/ensemblid等之间的转换
在基因注释时,难免碰到各种GENE在不同数据库之间的ID转换(例如,Ensembl ID 转Entrez ID,或者Entrez ID与GENE Symbol之间的转换)。这里介绍一下常用的三个在线网站, DAVID、bioDBnet、Ensembl Biomart, DAVID访问太慢,Ensembl Biomart参数配置太麻烦,推荐使用bioDBnet。
bioDBnet RESET API
bioDBnet除支持web在线转换外,还提供了RESET API接口,允许程序语言(python、perl、R等)进行访问。
参考资料
geneid/genesymbol/ensemblid等之间的转换的更多相关文章
- org.Hs.eg.db包简介(转换NCBI、ensemble等数据库中基因ID,symbol等之间的转换)
1)安装载入 ------------------------------------------- if("org.Hs.eg.db" %in% rownames(install ...
- JSON字符串和JS对象之间的转换
JSON字符串和JS对象之间的转换 1 json字符串转换为js对象 1.1 标准json格式字符串转换为Js对象 JSON字符串 str JSON.parse(str) eval(str) eva ...
- C# Stream 和 byte[] 之间的转换
一. 二进制转换成图片 MemoryStream ms = new MemoryStream(bytes); ms.Position = ; Image img = Image.FromStream( ...
- Java基础——基本类型和包装类、基本类型和字符串之间的转换
基本类型和包装类之间的转换 基本类型和包装类之间经常需要互相转换,以 Integer 为例(其他几个包装类的操作雷同哦): 在 JDK1.5 引入自动装箱和拆箱的机制后,包装类和基本类型之间的转换就更 ...
- String类型和基本数据类型之间的转换
Java 中基本类型和字符串之间的转换 在程序开发中,我们经常需要在基本数据类型和字符串之间进行转换. 其中,基本类型转换为字符串有三种方法: 1. 使用包装类的 toString() 方法 2. 使 ...
- Json与javaBean之间的转换工具类
/** * Json与javaBean之间的转换工具类 * * {@code 现使用json-lib组件实现 * 需要 * json-lib-2.4-jdk15.jar * ...
- Stream 和 byte[] 之间的转换
Stream 和 byte[] 之间的转换 一. 二进制转换成图片 ? 1 2 3 4 5 MemoryStream ms = new MemoryStream(bytes); ms.Position ...
- 百度坐标(BD09)、国测局坐标(火星坐标,GCJ02)、和WGS84坐标系之间的转换(JS版代码)
/** * Created by Wandergis on 2015/7/8. * 提供了百度坐标(BD09).国测局坐标(火星坐标,GCJ02).和WGS84坐标系之间的转换 */ //定义一些常量 ...
- java中的字符,字符串,数字之间的转换
string 和int之间的转换 string转换成int :Integer.valueOf("12") int转换成string : String.valueOf(12) ch ...
随机推荐
- nginx配置大全
nginx配置大全
- Vim的map
linux系统下.vimrc文件(这个文件可以在家目录新建): 这个文件记录着vim的配置信息: 如: "显示行号 set number "键映射map “如按F5,在word的前 ...
- hadoop-2.0.0-cdh4.6.0、sqoop-1.4.3-cdh4.6.0、mahout-0.7-cdh4.6.0 安装笔记
1. /etc/profile中环境变量配置: export HADOOP_HOME=/usr/local/hadoop/cdh4. export HADOOP_MAPRED_HOME=${HADOO ...
- mysqldump导出格式
#导出大表:mysqldump --add-drop-table --single-transaction --triggers -R -quick --disable-keys -utest -pt ...
- 利用create-react-app从零开始搭建React移动端环境
一 开始 1 全局安装脚手架 npm install -g create-react-app 这有个坑,就是在window下安装一直会报错,报错信息如下: 解决办法:在开始菜单栏里打开cmd的时,右击 ...
- Array对象(一)
Array是JavaScript中的一个事先定义好的对象(也可以称作一个类),可以直接使用. 创建Array对象: var array = new Array(); 创建指定元素个数的Array对象: ...
- linux没有eth0
1.创建ifcfg-eth0 touch /etc/sysconfig/network-scripts/ifcfg-eth0 2.配置ifcfg-eth0 DEVICE=eth0 HWADDR=:0c ...
- linux 替换目录下文件所有关键字
for i in *;do sed -ie 's/_test2/_test3/g' $i; sed -ie 's/_type2/_type3/g' $i; done 539down voteaccep ...
- python习题-产生8位随机密码要包含大小写及数字
# 1.写一个产生密码的程序,# 输入次数,输入多少次就产生多少条数据,# 要求密码必须包含大写字母.小写字母和数字,长度8位,不能重复 #需求分析#1.循环,输入什么就循环多少次#2.随机来取值,是 ...
- eslipse 修改tomcat server location 解决HTTP Status 404 – Not Found
Eclipse中tomcat service设置选择window ----show view---services可以看到服务的面板双击tomcat进入配置界面Service Locations(Sp ...