geneid/genesymbol/ensemblid等之间的转换
在基因注释时,难免碰到各种GENE在不同数据库之间的ID转换(例如,Ensembl ID 转Entrez ID,或者Entrez ID与GENE Symbol之间的转换)。这里介绍一下常用的三个在线网站, DAVID、bioDBnet、Ensembl Biomart, DAVID访问太慢,Ensembl Biomart参数配置太麻烦,推荐使用bioDBnet。
bioDBnet RESET API
bioDBnet除支持web在线转换外,还提供了RESET API接口,允许程序语言(python、perl、R等)进行访问。
参考资料
geneid/genesymbol/ensemblid等之间的转换的更多相关文章
- org.Hs.eg.db包简介(转换NCBI、ensemble等数据库中基因ID,symbol等之间的转换)
1)安装载入 ------------------------------------------- if("org.Hs.eg.db" %in% rownames(install ...
- JSON字符串和JS对象之间的转换
JSON字符串和JS对象之间的转换 1 json字符串转换为js对象 1.1 标准json格式字符串转换为Js对象 JSON字符串 str JSON.parse(str) eval(str) eva ...
- C# Stream 和 byte[] 之间的转换
一. 二进制转换成图片 MemoryStream ms = new MemoryStream(bytes); ms.Position = ; Image img = Image.FromStream( ...
- Java基础——基本类型和包装类、基本类型和字符串之间的转换
基本类型和包装类之间的转换 基本类型和包装类之间经常需要互相转换,以 Integer 为例(其他几个包装类的操作雷同哦): 在 JDK1.5 引入自动装箱和拆箱的机制后,包装类和基本类型之间的转换就更 ...
- String类型和基本数据类型之间的转换
Java 中基本类型和字符串之间的转换 在程序开发中,我们经常需要在基本数据类型和字符串之间进行转换. 其中,基本类型转换为字符串有三种方法: 1. 使用包装类的 toString() 方法 2. 使 ...
- Json与javaBean之间的转换工具类
/** * Json与javaBean之间的转换工具类 * * {@code 现使用json-lib组件实现 * 需要 * json-lib-2.4-jdk15.jar * ...
- Stream 和 byte[] 之间的转换
Stream 和 byte[] 之间的转换 一. 二进制转换成图片 ? 1 2 3 4 5 MemoryStream ms = new MemoryStream(bytes); ms.Position ...
- 百度坐标(BD09)、国测局坐标(火星坐标,GCJ02)、和WGS84坐标系之间的转换(JS版代码)
/** * Created by Wandergis on 2015/7/8. * 提供了百度坐标(BD09).国测局坐标(火星坐标,GCJ02).和WGS84坐标系之间的转换 */ //定义一些常量 ...
- java中的字符,字符串,数字之间的转换
string 和int之间的转换 string转换成int :Integer.valueOf("12") int转换成string : String.valueOf(12) ch ...
随机推荐
- [原创] hadoop学习笔记:重新格式化HDFS文件系统
所谓的重新格式化HDFS文件系统,实际意味着重新的创建一个HDFS文件系统.也就是说,必须将先前的已经有的文件系统配置删除.如下: 笔者采用的是最小化安装 这个是core-site.xml配置 这个是 ...
- python3 函数 二
1.函数嵌套 1.1函数嵌套定义 :在一个函数的内部,又定义另外一个函数. def f1(): x=1 def f2(): print('from f2') f ...
- 剑指offer之 二进制中1的个数
问题描述: 请实现一个函数,输入一个整数,输出该数二进制表示中1的个数.例如把9表示成二进制是1001,有2位是1 因此如果输入9,该函数输出2; package Problem10; public ...
- 关于数组的初始化memset函数
关于数组的初始化memset函数 其实memset复制时按bit8个8个的赋值,有兴趣的可以自己百度.
- 分享知识-快乐自己:mongodb 安装部署(linux)
1):下载 mongodb 包 [root@admin tools]# wget http://fastdl.mongodb.org/linux/mongodb-linux-x86_64-3.0.6. ...
- runtime error 的原因
1. 数组访问越界 2. 分母为 0 3. 括号 做题时偶然发现的! (详见 UVA 10158 War) 代码中出现了这种东西 else if( arefriends(x,y==-1) ) ...
- BEC listen and translation exercise 31
听力练习: All societies have ways of encouraging and enforcing what they view as appropriate behaviour w ...
- pyget-资源与标签(Sprite、Label、Font)
Sprite精灵,是游戏中对具有动画作用功能的图片的爱称. 精灵,图标和字体等资源是不能够处理事件的,因为它们并不是继承自EventDispatcher.但是可以包含一个能够EventDispatch ...
- codeforces 651A A. Joysticks (模拟)
A. Joysticks time limit per test 1 second memory limit per test 256 megabytes input standard input o ...
- ffmpeg处理RTMP流媒体的命令和发送流媒体的命令(UDP,RTP,RTMP)
将文件当做直播送至live ffmpeg -re -i localFile.mp4 -c copy -f flv rtmp://server/live/streamName re限制输出速率, ...