fold change的意义[转载]
转自:https://zhidao.baidu.com/question/2052933434631672387.html
1.解释
解释:表达值倍数变化 ,分析,消除可能的混杂因素,必要时可以用读段 的绝对表达值倍数变化(fold-change)来作为补充。
Fold change 用于描述一个初始值到一个最终值的变化程度。
1、例如,若初始值为30,最终值为60,则相应的fold change为2,或者可以描述为一个2折的增长。fold change仅仅靠最终值与初始值的比率计算即可得到。
2、例如,若初始值为A,最终值为B,则fold change为B/A。
3、再举一个例子,从80变到20,则fold change为0.25,反之,20变到80的fold change为4。一些开发值将小于1的fold change替换为对应的负数。
4、例如,从80变到20时,认为fold change为-4(即负4折)。
fold change经常用于微阵列芯片和RNA序列实验的基因表达数据分析,用来度量基因的表达水平。

fold change的意义[转载]的更多相关文章
- Fold Change和t分布
基因表达谱数据 基因表达谱可以用一个矩阵来表示,每一行代表一个基因,每一列代表一个样本(如图1).所有基因的表达谱数据在“gene_exp.txt”文件中存储,第一列为基因的entrez geneid ...
- fold change(ratio)
fold change 英文简称 : FC 中文全称 : 倍性变化 所属分类 : 生物科学 词条简介 : 一种用于描述两个用于相比的对象数量差异的方法.例如,第一个样本和第二个样本的量是50/10,那 ...
- 差异基因分析:fold change(差异倍数), P-value(差异的显著性)
在做基因表达分析时必然会要做差异分析(DE) DE的方法主要有两种: Fold change t-test fold change的意思是样本质检表达量的差异倍数,log2 fold change的意 ...
- FFT的物理意义(转载)
文章转载自: http://blog.sina.com.cn/s/blog_640029b301010xkv.html FFT是离散傅立叶变换的快速算法,可以将一个信号变换到频域.有些信号在时域上是很 ...
- Z-score(Z值)的意义--转载
http://blog.sina.com.cn/s/blog_72208a6a0101cdt1.html http://www.docin.com/p-350677620.html http://we ...
- 对CCLE数据库可以做的分析--转载
转载:http://www.bio-info-trainee.com/1327.html 收集了那么多的癌症细胞系的表达数据,拷贝数变异数据,突变数据,总不能放着让它发霉吧! 这些数据可以利用的地方非 ...
- 关于BETA、RC、ALPHA、Release、GA等版本号的意义
关于BETA.RC.ALPHA.Release.GA等版本号的意义 转载 2016年06月19日 00:04:00 2049 0 1 . 最近由于工作需要经常要去SVN上拉开源项目的源码,对项目 ...
- 使用Trinity拼接以及分析差异表达一个小例子
使用Trinity拼接以及分析差异表达一个小例子 2017-06-12 09:42:47 293 0 0 Trinity 将测序数据分为许多独立的de Brujin grap ...
- 使用limma、Glimma和edgeR,RNA-seq数据分析易如反掌
使用limma.Glimma和edgeR,RNA-seq数据分析易如反掌 Charity Law1, Monther Alhamdoosh2, Shian Su3, Xueyi Dong3, Luyi ...
随机推荐
- parameter "timeout" in socketchannel does not work
// Accept the connection and make it non-blocking SocketChannel socketChannel = serverSocketChannel. ...
- nginx 杂谈
http://blog.sina.com.cn/s/articlelist_1834459124_0_1.html
- 超全面的JavaWeb笔记day22<文件上传>
文件上传概述 1 文件上传的作用 例如网络硬盘!就是用来上传下载文件的. 在智联招聘上填写一个完整的简历还需要上传照片呢. 2 文件上传对页面的要求 上传文件的要求比较多,需要记一下: 1. 必须使用 ...
- POJ 2392 Space Elevator(多重背包变形)
Q: 额外添加了最大高度限制, 需要根据 alt 对数据进行预处理么? A: 是的, 需要根据 alt 对数组排序 Description The cows are going to space! T ...
- GIS-012-ArcGIS JS API 绘图
Name Description ARROW Draws an arrow. CIRCLE Draws a circle. DOWN_ARROW Draws an arrow that points ...
- 设置MySQL的字符编码
前言 这里我已经将MySQL的数据库编码设置为UTF-8,所以下面现实的都是UTF-8. 设置MySQL数据库的编码方式有三种,分别是基于session会话的.基于全局gloable的.永久性改变的. ...
- Zookeeper异常org.apache.zookeeper.KeeperException$ConnectionLossException
在虚拟机上安装了CenOS Linux系统,然后配置好了 zookeeper的集群环境,在本地写了一个Zookeeper测试程序,如下: package com.xbq.zookeeper; impo ...
- 解决Xcode "The selected destination does not support the architecture " 错误错误
XCODE编译运行项目后,发现工程编译后无法运行,出现:"The selected destination does not support the architecture for whi ...
- Docker源码分析(三):Docker Daemon启动
1 前言 Docker诞生以来,便引领了轻量级虚拟化容器领域的技术热潮.在这一潮流下,Google.IBM.Redhat等业界翘楚纷纷加入Docker阵营.虽然目前Docker仍然主要基于Linux平 ...
- JZOJ.5287【NOIP2017模拟8.16】最短路
Description