URL:

http://www.ibiomedical.net/

http://103.53.216.7/

Go to aldb database.

(keywords: chicken, cow, pig; lincRNAs; expression; blast)
ALDB: a domestic-animal long noncoding RNA database

Go to miRBond database.

(keywords: pig, chicken, cow, targetscan, miRanda, SNP, interaction, intersection,target)
Genome-scale identification of miRNA–mRNA and miRNA–lncRNA interactions in domestic animals

Go to pigvar database.

(keywords: pig SNP; SV; database; positive selection)
THE PIG VARIATIONS AND POSITIVE SELECTION DATABASE

Go to plek database.

(keywords: identify lncRNAs; predict lncRNAs; long noncoding RNAs;)
Aimin Li,Junying Zhang and Zhongyin Zhou: PLEK: A tool for
predicting long non-coding RNAs and messenger RNAs based on an improved
k-mer scheme. BMC bioinformatics 2014, 15:311.

Go to rattransc database.

(keywords: rat; rat lncRNAs; rat lincRNAs; rat long non-coding RNAs; Methylation;)
RatTransc: a rat long noncoding RNA database
 
 Contact Us: liaiminmail AT gmail.com

keywords: pig, boar, SNP, positive selection, database, db, pigsps

PigVar: THE PIG VARIATIONS AND POSITIVE SELECTION DATABASE的更多相关文章

  1. PigSPS: a database for pig SNPs and signatures of positive selection

    URL: http://www.ibiomedical.net/pigsps/ keywords: pig, boar, SNP, positive selection, database, db, ...

  2. 正向选择（positive selection）、中性选择（neutral selection）、平衡选择（balancing selection）示意图

    正向选择:某一位点逐渐积累,成优势的位点,具体表现为:随着时间延长,该位点的突变allele频率越来越高,远远超过野生型allele: 中性选择:随着时间的延长,总体频率没有改变太多: 平衡选择:位点 ...

  3. 西安理工大学 李爱民 Xi'an University of Technology, Aimin Li

    李爱民-西安理工大学计算机科学与工程学院 ● 简介(Introduction)-> 李爱民(Aimin Li),男,湖北随州人,西安电子科学大学博士(PhD),中共党员.中国计算机学会会员,CS ...

  4. ka/ks

    1. If dN/dS = 1, amino-acid substitutions may be largely neutral. However, there is also the possibi ...

  5. (原创)（三）机器学习笔记之Scikit Learn的线性回归模型初探

    一.Scikit Learn中使用estimator三部曲 1. 构造estimator 2. 训练模型:fit 3. 利用模型进行预测:predict 二.模型评价 模型训练好后,度量模型拟合效果的 ...

  6. soft selective sweeps 下的群体进化

    1.Hard and soft selective sweeps 长期以来,快速适应主要与选择作用于高度多基因的数量性状有关,例如在育种试验期间.这些性状可以通过对大量已经存在的多态性的群体频率的微小 ...

  7. Ab initio methods|Evidence-based methods|maximum-likelihood|branch-site|H1|H0|GO|dS/dN ratio

    (Gene prediction and comparison) 使用基于基因组序列的从头预测方法(Ab initio methods)(同时分别使用头预测软件( GENSCAN和 AUGUSTUS) ...

  8. Ka/ Ks|同义替换的三种路径|kaks_Calculator|

    生命组学 研究old gene 和 young gene CAI选择信号:CGmutation信号 Neutrality plot:CG3与GC1.GC2的关系:平:mutation:正相关:sele ...

  9. Pooled genome sequence strategies |representative genome assembly approaches|Domestication|GERP|selective sweep|Hybridization|Introgression|iHS|SNP genotyping arrays|haplotype

    Design based on biology 通过比较基因组学的方法,将脊椎动物基因组的数据,解决生物学各方面问题.新的调控注释(在脊椎动物的进化过程中的出现的)可以丰富物种树(比如不同功能蛋白质进 ...

随机推荐

  1. ERR_PTR,PTR_ERR还有IS_ERR函数详解

    内核中的函数常常返回指针,问题是如果出错,也希望能够通过返回的指针体现出来. 总体来说,如果内核返回一个指针,那么有三种情况:合法指针,NULL指针和非法指针. 1)合法指针:内核返回的指针一般是指向 ...

  2. Storm-源码分析-Topology Submit-Worker

    1 mk-worker 和其他的daemon一样, 都是通过defserverfn macro来创建worker (defserverfn mk-worker [conf shared-mq-cont ...

  3. 剑指Offer——第一个只出现一次的字符位置

    题目描述: 在一个字符串(1<=字符串长度<=10000,全部由字母组成)中找到第一个只出现一次的字符,并返回它的位置. 分析: 用一个数组统计每个字符出现的次数. 再次扫描数组,如果找到 ...

  4. MapReduce辅助排序

    需求:订单数据 求出每个订单中最贵的商品? 订单id正序,成交金额倒序. 结果文件三个,每个结果文件只要一条数据. 1.Mapper类 package com.css.order.mr; import ...

  5. Celery（一个懂得 异步任务、定时任务、周期任务 的"芹菜"）

    一.什么是Celery? Celery 是基于Python实现的模块,用于执行异步.定时.周期任务的,其结构的组成是: - 用户任务 app - 管道 broker 用于存储任务(官方推荐 redis ...

  6. C#建WindowForm调用R可视化

    众所周知R软件功能非常强大,可以很好的进行各类统计,并能输出图形.下面介绍一种R语言和C#进行通信的方法,并将R绘图结果显示到WinForm UI界面上的方法,文中介绍的很详细,需要的朋友可以参考下. ...

  7. 使用Robomongo连接数据库不成功：没有启动MongoDB

    启动MongoDB ➜ ~ mongod --07T16:: I CONTROL [initandlisten] MongoDB starting : pid= port= dbpath=/data/ ...

  8. ambari关于ranger的一个大坑----端口永远是3306，需要手动修改

    ambari关于ranger的一个大坑----端口永远是3306 这个坑是我在搭建ambari环境的时候发现的,我并没有找到原因,求助同事,然后一步步循着蛛丝马迹和试探,终于解决了,然而也揭露了amb ...

  9. UVA+POJ中大数实现的题目，持续更新（JAVA实现）

    UVA10494:If We Were a Child Again 大数除法加取余 import java.util.Arrays; import java.util.Scanner; import ...

  10. #pragma 的用法

    它的作用是设定编译器的状态或者是指示编译器完成一些特定的动作.#pragma指令对每个编译器给出了一个方法,在保持与C和C++语言完全兼容的情况下,给出主机或操作系统专有的特征.依据定义,编译指示是机 ...