URL:

http://www.ibiomedical.net/

http://103.53.216.7/

Go to aldb database.

(keywords: chicken, cow, pig; lincRNAs; expression; blast)
ALDB: a domestic-animal long noncoding RNA database

Go to miRBond database.

(keywords: pig, chicken, cow, targetscan, miRanda, SNP, interaction, intersection,target)
Genome-scale identification of miRNA–mRNA and miRNA–lncRNA interactions in domestic animals

Go to pigvar database.

(keywords: pig SNP; SV; database; positive selection)
THE PIG VARIATIONS AND POSITIVE SELECTION DATABASE

Go to plek database.

(keywords: identify lncRNAs; predict lncRNAs; long noncoding RNAs;)
Aimin Li,Junying Zhang and Zhongyin Zhou: PLEK: A tool for
predicting long non-coding RNAs and messenger RNAs based on an improved
k-mer scheme. BMC bioinformatics 2014, 15:311.

Go to rattransc database.

(keywords: rat; rat lncRNAs; rat lincRNAs; rat long non-coding RNAs; Methylation;)
RatTransc: a rat long noncoding RNA database

 
 Contact Us: liaiminmail AT gmail.com

keywords: pig, boar, SNP, positive selection, database, db, pigsps

PigVar: THE PIG VARIATIONS AND POSITIVE SELECTION DATABASE的更多相关文章

  1. PigSPS: a database for pig SNPs and signatures of positive selection

    URL: http://www.ibiomedical.net/pigsps/ keywords: pig, boar, SNP, positive selection, database, db, ...

  2. 正向选择(positive selection)、中性选择(neutral selection)、平衡选择(balancing selection)示意图

    正向选择:某一位点逐渐积累,成优势的位点,具体表现为:随着时间延长,该位点的突变allele频率越来越高,远远超过野生型allele: 中性选择:随着时间的延长,总体频率没有改变太多: 平衡选择:位点 ...

  3. 西安理工大学 李爱民 Xi'an University of Technology, Aimin Li

    李爱民-西安理工大学计算机科学与工程学院 ● 简介(Introduction)-> 李爱民(Aimin Li),男,湖北随州人,西安电子科学大学博士(PhD),中共党员.中国计算机学会会员,CS ...

  4. ka/ks

    1. If dN/dS = 1, amino-acid substitutions may be largely neutral. However, there is also the possibi ...

  5. (原创)(三)机器学习笔记之Scikit Learn的线性回归模型初探

    一.Scikit Learn中使用estimator三部曲 1. 构造estimator 2. 训练模型:fit 3. 利用模型进行预测:predict 二.模型评价 模型训练好后,度量模型拟合效果的 ...

  6. soft selective sweeps 下的群体进化

    1.Hard and soft selective sweeps 长期以来,快速适应主要与选择作用于高度多基因的数量性状有关,例如在育种试验期间.这些性状可以通过对大量已经存在的多态性的群体频率的微小 ...

  7. Ab initio methods|Evidence-based methods|maximum-likelihood|branch-site|H1|H0|GO|dS/dN ratio

    (Gene prediction and comparison) 使用基于基因组序列的从头预测方法(Ab initio methods)(同时分别使用头预测软件( GENSCAN和 AUGUSTUS) ...

  8. Ka/ Ks|同义替换的三种路径|kaks_Calculator|

    生命组学 研究old gene 和 young gene CAI选择信号:CGmutation信号 Neutrality plot:CG3与GC1.GC2的关系:平:mutation:正相关:sele ...

  9. Pooled genome sequence strategies |representative genome assembly approaches|Domestication|GERP|selective sweep|Hybridization|Introgression|iHS|SNP genotyping arrays|haplotype

    Design based on biology 通过比较基因组学的方法,将脊椎动物基因组的数据,解决生物学各方面问题.新的调控注释(在脊椎动物的进化过程中的出现的)可以丰富物种树(比如不同功能蛋白质进 ...

随机推荐

  1. 在nginx启动后,如果我们要操作nginx,要怎么做呢 别增加无谓的上下文切换 异步非阻塞的方式来处理请求 worker的个数为cpu的核数 红黑树

    nginx平台初探(100%) — Nginx开发从入门到精通 http://ten 众所周知,nginx性能高,而nginx的高性能与其架构是分不开的.那么nginx究竟是怎么样的呢?这一节我们先来 ...

  2. netty 网关 http请求 请求转发

    https://netty.io/4.1/xref/io/netty/example/proxy/package-summary.html https://netty.io/4.1/xref/io/n ...

  3. DtypeWarning: Columns (1,5,7,16,......) have mixed types. Specify dtype option on import or set low_memory=False.

    DtypeWarning: Columns (1,5,7,16,......) have mixed types. Specify dtype option on import or set low_ ...

  4. Python慢,为啥还有大公司用?

    PyCon 是全世界最大的以 Python 编程语言 为主题的技术大会,大会由 Python 社区组织,每年举办一次.在 Python 2017 上,Instagram 的工程师们带来了一个有关 Py ...

  5. springMvc异常之 For input string: "show"

    异常提示: For input string: "show" 异常原因: 使用@PathVariable方式获取值,返回类型为String return "redirec ...

  6. 【spring学习】中文乱码问题

    问题: 在这样的一个控制器中: 返回字符串中文部分全是问号. 解决方案: 在spring-mvc.xml文件中加入以下代码: <!-- 支持spring3.0新的mvc注解 ,解决json中的中 ...

  7. gbdt调参的小结

    关键部分转自http://www.cnblogs.com/pinard/p/6143927.html 第一次知道网格搜索这个方法,不知道在工业中是不是用这种方式 1.首先从步长和迭代次数入手,选择一个 ...

  8. (C++) Assertion failed: !"Bad error code", file VMem.c, line 715

    (C++) Assertion failed: !"Bad error code", file VMem.c, line 715 Misc error. myInterface F ...

  9. Delphi锁定鼠标 模拟左右键 静止一会自动隐藏鼠标

    unit Unit1; interface uses Windows, Messages, SysUtils, Variants, Classes, Graphics, Controls, Forms ...

  10. 关联规则之Apriori

    1.关联规则原理 1.关联规则概述 关联规则(Association Rules)是反映一个事物与其他事物之间的相互依存性和关联性,如果两个或多个事物之间存在一定的关联关系,那么,其中一个事物就能通过 ...