从以下几个方面:

1、存储结构 
每个MyISAM在磁盘上存储成三个文件。第一个文件的名字以表的名字开始,扩展名指出文件类型。 
.frm文件存储表定义。 
数据文件的扩展名为.MYD (MYData)。 
索引文件的扩展名是.MYI (MYIndex)。

2、存储空间 
MyISAM:可被压缩,存储空间较小。 
InnoDB:需要更多的内存和存储,它会在主内存中建立其专用的缓冲池用于高速缓冲数据和索引。 
MyISAM的索引和数据是分开的,并且索引是有压缩的,内存使用率就对应提高了不少。能加载更多索引,而Innodb是索引和数据是紧密捆绑的,没有使用压缩从而会造成Innodb比MyISAM体积庞大不小

3、事务处理 
MyISAM类型的表强调的是性能,其执行数度比InnoDB类型更快,但是不支持外键、不提供事务支持。 
InnoDB提供事务支持事务,外部键(foreign key)等高级数据库功能。

SELECT、UPDATE、INSERT、Delete操作 
如果执行大量的SELECT,MyISAM是更好的选择。 
如果你的数据执行大量的INSERT或UPDATE,出于性能方面的考虑,应该使用InnoDB表。 
DELETE FROM table时,InnoDB不会重新建立表,而是一行一行的删除。而MyISAM则是重新建立表。在innodb上如果要清空保存有大量数据的表,最好使用truncate table这个命令。

AUTO_INCREMENT 
MyISAM:可以和其他字段一起建立联合索引。引擎的自动增长列必须是索引,如果是组合索引,自动增长可以不是第一列,他可以根据前面几列进行排序后递增。 
InnoDB:InnoDB中必须包含只有该字段的索引。引擎的自动增长列必须是索引,如果是组合索引也必须是组合索引的第一列。

4、表的具体行数 
MyISAM:保存有表的总行数,如果select count(*) from table;会直接取出该值。 
InnoDB:没有保存表的总行数,如果使用select count(*) from table;就会遍历整个表,消耗相当大,但是在加了where后,myisam和innodb处理的方式都一样。

5、全文索引 
MyISAM:支持 FULLTEXT类型的全文索引。不支持中文。 
InnoDB:不支持FULLTEXT类型的全文索引,但是innodb可以使用sphinx插件支持全文索引,并且效果更好。

6、表锁差异 
MyISAM:只支持表级锁,只支持表级锁,用户在操作myisam表时,select,update,delete,insert语句都会给表自动加锁。 
InnoDB:支持事务和行级锁,是innodb的最大特色。行锁大幅度提高了多用户并发操作的新能。但是InnoDB的行锁也不是绝对的,如果在执行一个SQL语句时MySQL不能确定要扫描的范围,InnoDB表同样会锁全表, 例如update table set num=1 where name like “%aaa%”

一般来说: 
MyISAM适合: 
(1)做很多count 的计算; 
(2)插入不频繁,查询非常频繁; 
(3)没有事务。 
InnoDB适合: 
(1)可靠性要求比较高,或者要求事务; 
(2)表更新和查询都相当的频繁,并且表锁定的机会比较大的情况。

 两种类型最主要的差别就是Innodb 支持事务处理与外键和行级锁。而MyISAM不支持.所以MyISAM往往就容易被人认为只适合在小项目中使用。

  作为使用MySQL的用户角度出发,Innodb和MyISAM都是比较喜欢的,如果数据库平台要达到需求:99.9%的稳定性,方便的扩展性和高可用性来说的话,MyISAM绝对是首选。

  原因如下:

  1、平台上承载的大部分项目是读多写少的项目,而MyISAM的读性能是比Innodb强不少的。

  2、MyISAM的索引和数据是分开的,并且索引是有压缩的,内存使用率就对应提高了不少。能加载更多索引,而Innodb是索引和数据是紧密捆绑的,没有使用压缩从而会造成Innodb比MyISAM体积庞大不小。

  3、经常隔1,2个月就会发生应用开发人员不小心update一个表where写的范围不对,导致这个表没法正常用了,这个时候MyISAM的优越性就体现出来了,随便从当天拷贝的压缩包取出对应表的文件,随便放到一个数据库目录下,然后dump成sql再导回到主库,并把对应的binlog补上。如果是Innodb,恐怕不可能有这么快速度,别和我说让Innodb定期用导出xxx.sql机制备份,因为最小的一个数据库实例的数据量基本都是几十G大小。

  4、从接触的应用逻辑来说,select count(*) 和order by 是最频繁的,大概能占了整个sql总语句的60%以上的操作,而这种操作Innodb其实也是会锁表的,很多人以为Innodb是行级锁,那个只是where对它主键是有效,非主键的都会锁全表的。

  5、还有就是经常有很多应用部门需要我给他们定期某些表的数据,MyISAM的话很方便,只要发给他们对应那表的frm.MYD,MYI的文件,让他们自己在对应版本的数据库启动就行,而Innodb就需要导出xxx.sql了,因为光给别人文件,受字典数据文件的影响,对方是无法使用的。

  6、如果和MyISAM比insert写操作的话,Innodb还达不到MyISAM的写性能,如果是针对基于索引的update操作,虽然MyISAM可能会逊色Innodb,但是那么高并发的写,从库能否追的上也是一个问题,还不如通过多实例分库分表架构来解决。

  7、如果是用MyISAM的话,merge引擎可以大大加快应用部门的开发速度,他们只要对这个merge表做一些select count(*)操作,非常适合大项目总量约几亿的rows某一类型(如日志,调查统计)的业务表。

  当然Innodb也不是绝对不用,用事务的项目就用Innodb的。另外,可能有人会说你MyISAM无法抗太多写操作,但是可以通过架构来弥补。

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