同为降维工具,二者的主要区别在于,

  • 所在的包不同(也即机制和原理不同)

    • from sklearn.decomposition import PCA
    • from sklearn.manifold import TSNE
  • 因为原理不同,导致,tsne 保留下的属性信息,更具代表性,也即最能体现样本间的差异;
  • TSNE 运行极慢,PCA 则相对较快;

因此更为一般的处理,尤其在展示(可视化)高维数据时,常常先用 PCA 进行降维,再使用 tsne:

data_pca = PCA(n_components=50).fit_transform(data)
data_pca_tsne = TSNE(n_components=2).fit_transform(data_pca)

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