功能的显著性分析——GO Enrichment Analysis
Gene Ontology(GO)是基因功能国际标准分类体系。GO富集分析是对差异基因等按GO分类,并对分类结果进行基于离散分布的显著性分析、错判率分析、富集度分析,得到与实验目的有显著联系的、低误判率的、靶向性的基因功能分类,该分类即导致样本性状差异的最重要的功能差别。在芯片的数据分析中,研究者可以找出哪些变化基因属于一个共同的GO功能分支,并用统计学方法检定结果是否具有统计学意义,从而得出变化基因主要参与了哪些生物功能。

2. 对富集得到的显著性功能以柱状图的形式展示。(功能柱状图)

3. 对富集得到的显著性功能以点图的形式展示。(功能点图)

功能的显著性分析——GO Enrichment Analysis的更多相关文章
- GSEA - Gene set enrichment analysis 基因集富集 | ORA - Over-Representation Analysis 分析原理与应用
RNA-seq是利器,大部分做实验的老板手下都有大量转录组数据,所以RNA-seq的分析需求应该是很大的(大部分的生信从业人员应该都差不多要沾边吧). 普通的转录组套路并不多,差异表达基因.富集分析. ...
- [protocol]GO enrichment analysis
[protocol]GO enrichment analysis 背景: 什么是富集分析,自己可以百度.我到目前也没发现一个比较通俗易懂的介绍.直接理解为一种统计学方法就可以了. 用于查看显著 ...
- BABOK - 企业分析(Enterprise Analysis)
BABOK - 企业分析(Enterprise Analysis)概要 发表于2013年10月9日由周金根 描述 企业分析描述我们如何捕捉.提炼并明晰业务需要,并定义一个可能实现这些业务需要的一个方案 ...
- 帕累托分析法(Pareto Analysis)(柏拉图分析)
帕累托分析法(Pareto Analysis)(柏拉图分析) ABC分类法是由意大利经济学家帕雷托首创的.1879年,帕累托研究个人收入的分布状态图是地,发现少数人收入占全部人口收入的大部分,而多数人 ...
- 【Cocos游戏实战】功夫小子第七课之游戏主功能场景逻辑功能和暂停功能场景的分析和实现
CSDN的markdown编辑器是吃屎了么! !.什么玩意.!写了一半写不了东西还全没了,搞个毛线! 本节课的视频教程地址是:第七课在此 假设本教程有帮助到您,希望您能点击进去观看一下,并且如今注冊成 ...
- Java安全(权限)框架 - Shiro 功能讲解 架构分析
Java安全(权限)框架 - Shiro 功能讲解 架构分析 作者 : Stanley 罗昊 [转载请注明出处和署名,谢谢!] 简述Shiro Shiro出自公司Apache(阿帕奇),是java的一 ...
- GWAS条件分析(conditional analysis)
一.为什么要做GWAS的条件分析(conditional analysis) 我们做GWAS的时候,经常扫出一堆显著的信号,假设rs121是我们扫出来与某表型最显著相关的位点(P=1.351e-36) ...
- 论坛:设计实体-->分析功能-->实现功能 之 《分析功能》
其中 管理文章 的功能没有做,以下做的设计 浏览与参与 功能的步骤 分析功能 5个功能. 7个请求. 实现功能 Action, 7个方法 Service Dao Jsp For ...
- BMDP为常规的统计分析提供了大量的完备的函数系统,如:方差分析(ANOVA)、回归分析(Regression)、非参数分析(Nonparametric Analysis)、时间序列(Times Series)等等。此外,BMDP特别擅于进行出色的生存分析(Survival Analysis )。许多年来,一大批世界范围内顶级的统计学家都曾今参与过BMDP的开发工作。这不仅使得BMDP的权威性得到
BMDP是Bio Medical Data Processing的缩写,是世界级的统计工具软件,至今已经有40多年的历史.目前在国际上与SAS.SPSS被并称为三大统计软件包.BMDP是一个大 ...
随机推荐
- 【pyqtgraph】pyqtgraph-鼠标互动
pyqtgraph绘图库官方文档学习-鼠标互动(mouse interaction) 鼠标互动 大多数使用pyqtgraph数据可视化的应用程序都会生成可以使用鼠标进行交互式缩放,平移和配置的小部件. ...
- Python Mock的入门(转)
原文:https://segmentfault.com/a/1190000002965620 Mock是什么 Mock这个词在英语中有模拟的这个意思,因此我们可以猜测出这个库的主要功能是模拟一些东西. ...
- 分布式文档系统_document查询内部原理
1.客户端发送请求到任意一个node,成为coordinate node2.coordinate node对document进行路由,将请求转发到对应的node,此时会使用round-robin随机轮 ...
- (4.28)for xml path 在合并拆分上的作用演示
for xml path 用于合并与拆分 1.合并 很多时候需要在SQL Server中创建逗号分隔列表.这可以使用SQL Server的DOR XML PATH功能完成.与select语句一起使用时 ...
- Github上Laravel开源排行榜Star数31-60名
Github上Laravel开源排行榜Star数31-60名,罗列所有 Laravel 开源扩展包,含 Github Star 数量,下载数量和项目简介.默认排序是按Star数量从多到少来排 31.c ...
- Java基础知识(JAVA集合框架之List与Set)
List和Set概述数组必须存放同一种元素.StringBuffer必须转换成字符串才能使用,如果想拿出单独的一个元素几乎不可能.数据有很多使用对象存,对象有很多,使用集合存. 集合容器因为内部的数据 ...
- Replication主要配置项
八.Replication主要配置项(配置文件) 1.log_bin:指定binlog文件的名称,同时也表示开启binlog功能,在replication模式下,master上必须开启log_bin, ...
- vue中less的使用
1.安装:npm install less less-loader --save 2.修改webpack.config.js文件,配置loader加载依赖,让其支持外部的less,在原来的代码上添加 ...
- 万恶之源 - Python包的应用
包的简介 你们听到的包,可不是女同胞疯狂喜欢的那个包,我们来看看这个是啥包 官方解释: Packages are a way of structuring Python’s module namesp ...
- DataFrame修改列名
把Dataframe格式的列名'class1'修改为'class_label' data.rename(columns={"label":"true_label" ...