用R的dgCMatrix包来构建稀疏矩阵 | sparse matrix by dgCMatrix
sparse matrix是用来存储大型稀疏矩阵用得,单细胞表达数据基本都用这个格式来存储,因为单细胞很大部分都是0,用普通文本矩阵存储太占空间。
使用也是相当简单:
library("Matrix")
readsCount <- read.csv("data/count.csv", header = T, row.names = 1)
readsCountSM <- as(as.matrix(readsCount), "dgCMatrix")
# str(M1)
想转回去,as.matrix() 就可以了。
参考:
Coercion of matrix tosparsematrix (dgCMatrix) and maintainingdimnames.
用R的dgCMatrix包来构建稀疏矩阵 | sparse matrix by dgCMatrix的更多相关文章
- R语言 ggplot2包
R语言 ggplot2包的学习 分析数据要做的第一件事情,就是观察它.对于每个变量,哪些值是最常见的?值域是大是小?是否有异常观测? ggplot2图形之基本语法: ggplot2的核心理念是将 ...
- R语言rvest包网络爬虫
R语言网络爬虫初学者指南(使用rvest包) 钱亦欣 发表于 今年 06-04 14:50 5228 阅读 作者 SAURAV KAUSHIK 译者 钱亦欣 引言 网上的数据和信息无穷无尽,如 ...
- R语言-神经网络包RSNNS
code{white-space: pre;} pre:not([class]) { background-color: white; }if (window.hljs && docu ...
- R语言-Knitr包的详细使用说明
R语言-Knitr包的详细使用说明 by 扬眉剑 来自数盟[总舵] 群:321311420 1.相关资料 1:自动化报告-谢益辉 https://github.com/yihui/r-ninja/bl ...
- ASP.NET Core的身份认证框架IdentityServer4(5)- 包和构建
包和构建 IdentityServer有许多nuget包 IdentityServer4 nuget | github 包含IdentityServer核心对象模型,服务和中间件. 仅支持内存配置和用 ...
- R语言dplyr包初探
昨天学了一下R语言dplyr包,处理数据框还是很好用的.记录一下免得我忘记了... 先写一篇入门的,以后有空再写一篇详细的用法. #dplyr learning library(dplyr) #fil ...
- R+NLP︱text2vec包——四类文本挖掘相似性指标 RWMD、cosine、Jaccard 、Euclidean (三,相似距离)
要学的东西太多,无笔记不能学~~ 欢迎关注公众号,一起分享学习笔记,记录每一颗"贝壳"~ --------------------------- 在之前的开篇提到了text2vec ...
- IdentityServer4(5)- 包和构建
包和构建 IdentityServer有许多Nuget包组件 IdentityServer4 nuget | github 包含IdentityServer核心对象模型.服务和中间件.默认只包含了基于 ...
- R语言扩展包dplyr——数据清洗和整理
R语言扩展包dplyr——数据清洗和整理 标签: 数据R语言数据清洗数据整理 2015-01-22 18:04 7357人阅读 评论(0) 收藏 举报 分类: R Programming(11) ...
随机推荐
- (6CBIR模拟问题)自己动手,编写神经网络程序,解决Mnist问题,并网络化部署
个方面: 最初的图像检索研究主要集中在如何选择合适的全局特征去描述图像内容和采用什么样的相似性度量方法进行图像匹配. 第二个研究热点是基于区域的图像检索方法,其主要思想是图像分割技术提取出图像中的物体 ...
- 启动Activiti项目报错:org.activiti.engine.ActivitiObjectNotFoundException: no deployed process definition found with id '22501'
背景 启动activiti项目时,出现错误org.activiti.engine.ActivitiObjectNotFoundException: no deployed process defini ...
- #2718. 「NOI2018」归程 kruskal重构树
链接 https://loj.ac/problem/2718 思路 我们希望x所在的连通块尽量的大,而且尽量走高处 离线的话可以询问排序,kruskal过程中更新答案 在线就要用kruskal重构树 ...
- codevs1017乘积最大
codevs1017 乘积最大 题目描述 Description 今年是国际数学联盟确定的“2000——世界数学年”,又恰逢我国著名数学家华罗庚先生诞辰90周年.在华罗庚先生的家乡江苏金坛,组织了一场 ...
- 如何查看sonarqube的版本
Server Logs & System Info The System Info page is found at Administration > System. It gives ...
- html 之 padding,margin
margin:对象挤压外界 padding:对象挤压自身 例如: td使用margin 对table而言没有任何效果,但使用padding是对table内部的挤压,若是table空间不够,则会扩大ta ...
- 给大家分享两套WordPress收费主题
主题一:No.7 – 极简 by 大当家 1.主题网址:http://qzhai.net/2016-03-546.html 2.主题预览:http://qzhai.net/000/?theme=No. ...
- Cas单点登录配置数据查询用户
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?> <beans xmlns="http://www.sp ...
- MS-Windows中的Git命令行
Git command line for MS-Windows Inhalt 1 Download and install, or copy the git command line suite fo ...
- 1、My Scripts
1.写一个包含命令.变量和流程控制的语句来清除/var/log的messages日志文件的shell脚本.(P26)(11-21) 2.利用$0和(dirname.basename)取出当前路径的目录 ...