I am writing a python script from which I hope to call the Matlab anovan function. I have attempted a basic test of this feature on file test.txt.

This file is imported as array data. In matlab, the anovan function would be called as follows:

anovan(data(:,1),{data(:,2),data(:,3)})

In python, I have attempted to call the function like this:

import matlab.engine
eng = matlab.engine.start_matlab()
data = np.genfromtxt('test.txt')
eng.anovan(matlab.double(data[:,0]),matlab.int8(data[:,1:2]))

Unfortunately, this gives the following error:

ValueError: initializer must be a rectangular nested sequence

I can see that there is some issue in passing the last two array columns to the function, but am unsure of the solution. Any suggestions would be appreciated.


I have now worked this out. The issue was in the format of the data passed to the function.

#convert grouping columns to integer lists
list1 = data[:,1].tolist()
for i in range(0,len(list1)):
list1[i] = int(list1[i])
list2 = data[:,2].tolist()
for i in range(0,len(list2)):
list2[i] = int(list2[i])
#The following command now works
eng.anovan(matlab.double(data[:,0].tolist()),[matlab.int8(list1),matlab.int8(list2)])

Calling Matlab function from python: “initializer must be a rectangular nested sequence”的更多相关文章

  1. Libsvm:脚本(subset.py、grid.py、checkdata.py) | MATLAB/OCTAVE interface | Python interface

    1.脚本 This directory includes some useful codes: 1. subset selection tools. (子集抽取工具) subset.py 2. par ...

  2. Python的扩展接口[3] -> Matlab引擎 -> 使用 Python 调用 Matlab 程序

    Python - Matlab 目录 Python-Matlab 引擎 Python-Matlab 数组 Python-Matlab 基本操作 Python-Matlab 调用 m 文件 Matlab ...

  3. initialize myObject by calling a function that returns an object literal

    w作用域控制变量的可见范围. JavaScript: The Good Parts Instead of initializing myObject with an object literal, w ...

  4. [CentOS Server] Bug when calling matlab in bash

    尝试了好几遍,仍然不能用简写命令调用matlab,这里把过程记录如下. (1). 登录 server [She@She ~]$ ssh shecl@xx.xx.xx.xx Last :: from x ...

  5. Matlab function lorenzgui

    function lorenzgui %LORENZGUI Plot the orbit around the Lorenz chaotic attractor. % This function an ...

  6. TypeError: 'encoding' is an invalid keyword argument for this function 解决Python 2.7

    在python2.7中这样调用代码 open('file/name.txt','r',encoding= 'utf-8').read() 会出现 TypeError: 'encoding' is an ...

  7. 解决方法:loadrunner 场景下执行webservice脚本是---报错10492 Error: Exception was raised when calling per-process-init function in extens

    在vug下执行时,脚本无异常,但是在controller下执行时报下面错误,网上查了下,解决方法千奇百怪,但无一可行. 分析了下错误,似乎是初始化进程有关.想到rts中的设置习惯时以线程方式执行. 遂 ...

  8. [Python-MATLAB] 在Python中调用MATLAB的API

    可以参考官方的说明文档: http://cn.mathworks.com/help/matlab/matlab_external/get-started-with-matlab-engine-for- ...

  9. Python调用Matlab2014b引擎

    用惯Python的你,是不是早已无法忍受matplotlib那丑陋无比的图以及蛋疼无比部署依赖? 当当当当,Matlab2014b的Python Engine API现已加入豪华午餐. 上次写了一篇文 ...

随机推荐

  1. mysql 开发进阶篇系列 41 mysql日志之慢查询日志

    一.概述 慢查询日志记录了所有的超过sql语句( 超时参数long_query_time单位 秒),获得表锁定的时间不算作执行时间.慢日志默认写入到参数datadir(数据目录)指定的路径下.默认文件 ...

  2. Python多进程库multiprocessing中进程池Pool类的使用

    问题起因 最近要将一个文本分割成好几个topic,每个topic设计一个regressor,各regressor是相互独立的,最后汇总所有topic的regressor得到总得预测结果.没错!类似ba ...

  3. listview监听组件内容变化

    package com.meizu.ui.gifts; import android.app.Activity; import android.content.Context; import andr ...

  4. 使用crypt配置Basic Auth登录认证

    简介 Basic Auth用于服务端简单的登录认证,通常使用服务器Nginx.Apache本身即可完成.比如我们要限定某个域名或者页面必须输入用户名.密码才能登录,但又不想使用后端开发语言,此时Bas ...

  5. SpringBoot+Mybatis+Pagehelper分页

    1.pom.xml <!-- mybatis分页插件 --> <dependency> <groupId>com.github.pagehelper</gro ...

  6. process_begin: CreateProcess(NULL,......) make (e=87): 参数错误。

    在编译 trinity-android 的过程中,总是报 process_begin: CreateProcess(NULL,......) make (e=87): 参数错误 原因是.MK文件中包含 ...

  7. S0到S5状态讲解

    ACPI(高级配置和电源管理接口)的六种工作状态Advanced Configuration and Power Management InterfaceACPI表示高级配置和电源管理接口( Adva ...

  8. SpringMVC+jquery.uploadify 上传文件

    前言 以前用Asp.net MVC+uploadify上传文件,最近学习SpringMVC,所以就用SpringMVC+uploadify做个上传文件的demo. 刚开始用form表单的方式提交,在C ...

  9. ppt提取文字

    ALT+F11调出开发窗口 加入引用 插入模块 输入代码运行 Sub Main() On Error Resume Next Dim temp As New Word.Document, tmpSha ...

  10. HibernateTemplate的用法以及作用

    HibernateTemplate作用:从字面上意思我们就知道他是一个模板,然后我们又知道hibernate是一个对象关系映射的框架,所以我们很容易联想到他的功能就是将Hibernate 的持久层访问 ...