Calling Matlab function from python: “initializer must be a rectangular nested sequence”
I am writing a python script from which I hope to call the Matlab anovan function. I have attempted a basic test of this feature on file test.txt.
This file is imported as array data. In matlab, the anovan function would be called as follows:
anovan(data(:,1),{data(:,2),data(:,3)})
In python, I have attempted to call the function like this:
import matlab.engine
eng = matlab.engine.start_matlab()
data = np.genfromtxt('test.txt')
eng.anovan(matlab.double(data[:,0]),matlab.int8(data[:,1:2]))
Unfortunately, this gives the following error:
ValueError: initializer must be a rectangular nested sequence
I can see that there is some issue in passing the last two array columns to the function, but am unsure of the solution. Any suggestions would be appreciated.
I have now worked this out. The issue was in the format of the data passed to the function.
#convert grouping columns to integer lists
list1 = data[:,1].tolist()
for i in range(0,len(list1)):
list1[i] = int(list1[i])
list2 = data[:,2].tolist()
for i in range(0,len(list2)):
list2[i] = int(list2[i])
#The following command now works
eng.anovan(matlab.double(data[:,0].tolist()),[matlab.int8(list1),matlab.int8(list2)])
Calling Matlab function from python: “initializer must be a rectangular nested sequence”的更多相关文章
- Libsvm:脚本(subset.py、grid.py、checkdata.py) | MATLAB/OCTAVE interface | Python interface
1.脚本 This directory includes some useful codes: 1. subset selection tools. (子集抽取工具) subset.py 2. par ...
- Python的扩展接口[3] -> Matlab引擎 -> 使用 Python 调用 Matlab 程序
Python - Matlab 目录 Python-Matlab 引擎 Python-Matlab 数组 Python-Matlab 基本操作 Python-Matlab 调用 m 文件 Matlab ...
- initialize myObject by calling a function that returns an object literal
w作用域控制变量的可见范围. JavaScript: The Good Parts Instead of initializing myObject with an object literal, w ...
- [CentOS Server] Bug when calling matlab in bash
尝试了好几遍,仍然不能用简写命令调用matlab,这里把过程记录如下. (1). 登录 server [She@She ~]$ ssh shecl@xx.xx.xx.xx Last :: from x ...
- Matlab function lorenzgui
function lorenzgui %LORENZGUI Plot the orbit around the Lorenz chaotic attractor. % This function an ...
- TypeError: 'encoding' is an invalid keyword argument for this function 解决Python 2.7
在python2.7中这样调用代码 open('file/name.txt','r',encoding= 'utf-8').read() 会出现 TypeError: 'encoding' is an ...
- 解决方法:loadrunner 场景下执行webservice脚本是---报错10492 Error: Exception was raised when calling per-process-init function in extens
在vug下执行时,脚本无异常,但是在controller下执行时报下面错误,网上查了下,解决方法千奇百怪,但无一可行. 分析了下错误,似乎是初始化进程有关.想到rts中的设置习惯时以线程方式执行. 遂 ...
- [Python-MATLAB] 在Python中调用MATLAB的API
可以参考官方的说明文档: http://cn.mathworks.com/help/matlab/matlab_external/get-started-with-matlab-engine-for- ...
- Python调用Matlab2014b引擎
用惯Python的你,是不是早已无法忍受matplotlib那丑陋无比的图以及蛋疼无比部署依赖? 当当当当,Matlab2014b的Python Engine API现已加入豪华午餐. 上次写了一篇文 ...
随机推荐
- 希尔排序——Shell Sort
前言: 数据序列1: 13-17-20-42-28 利用插入排序,13-17-20-28-42. Number of swap:1;数据序列2: 13-17-20-42-14 利用插入排序,13-14 ...
- wxformbuilder在python如何使用
1使用builder 创建界面并进行布局 2选择python选项 得到相应代码 将代码保存在 一个py文件里面 创建一个新的入口文件 main.py import wx import UIfile c ...
- SQL 必知必会·笔记<7>汇总数据——使用聚合函数
有时候我们需要对表中的数据进行汇总,而不需要数据本身,为了方便这些类型的检索,SQL给出了5个聚合函数,SQL聚合函数在各主要的SQL实现中得到了相当一致的支持.如下: 1.1 AVG()函数 AVG ...
- 按值传递 vs. 按指针传递
按值传递还是指针传递? 变量赋值有两种方式:按值传递.按"指针"传递(指针也常称为"引用").不同的编程语言赋值的方式不一样,例如Python是按"指 ...
- Java语法之反射
一.反射机制 在前面Java语法之注解自定义注解时我们也有提到反射,要获取类方法和字段的注解信息,必须通过Java的反射技术来获取 Annotation对象.那什么是反射呢?JAVA反射机制是在运行状 ...
- c#执行sql语句的问题
var sql = "UPDATE dbo.Purchase_Order SET StatusID = 14,StatusText='已合并', Remark=isnull(Remark, ...
- www.jqhtml.com 前端框架特效
www.jqhtml.com * 请选择课程 初级班 (PS.HTML.CSS.静态网站项目实战) 中级班 JavaScript基础.JavaScript DOM.jQuery.JS进阶.HTML5和 ...
- vue-cli脚手架搭建项目简单入门一
搭建系统: Windows系统 简单了解Node.js.npm,安装Node.js,下载网址:http://nodejs.cn/download/ 查看node,npm安装成功与否.打开cmd命令行, ...
- linux部分常见指令
游走指令 cd: 进入指定位置 cd / 进入到根目录 cd /home 进入到home文件夹 cd - 进入上次所在文件夹 比如 在 / 时 cd /usr/local到loca ...
- C code example for strdup
#include <stdlib.h> #include <stdio.h> #include <string.h> #include <malloc.h&g ...