NetworkX-根据权重画图
load_data = sio.loadmat(load_path)
#阈值处理
mat=np.array(load_data['R'])
mat[mat<0]=0
mat[mat<0.45]=0
#写入txt文件
# np.savetxt(thr_path, mat);
#计算degree
g = nx.Graph()
for i in range(len(mat)):
for j in range(len(mat)):
if(mat[i,j]>0): #删除边的权重小于等于0的边
g.add_edge(i, j,weight=mat[i,j])
# nx.draw(g)
# nx.draw(g,with_labels=True) # 将标号标出来
# plt.show()
# 按权重划分为重权值得边和轻权值的边
elarge = [(u, v) for (u, v, d) in g.edges(data=True) if d['weight'] > 0.5]
esmall = [(u, v) for (u, v, d) in g.edges(data=True) if d['weight'] <= 0.5]
# 节点位置
pos = nx.spring_layout(g) # positions for all nodes
# 首先画出节点位置
# nodes
nx.draw_networkx_nodes(g, pos, node_color='b',node_size=300,alpha=0.4)
# 根据权重,实线为权值大的边,虚线为权值小的边
# edges
nx.draw_networkx_edges(g, pos, edgelist=elarge,
width=3)
nx.draw_networkx_edges(g, pos, edgelist=esmall,
width=1, alpha=0.5, edge_color='g', style='dashed')
# labels标签定义
nx.draw_networkx_labels(g, pos, font_size=13, font_family='sans-serif')
plt.axis('off')
plt.savefig("weighted_graph.png") # save as png
plt.show()
Result:

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