在octave语言中K-means聚类算法求聚类中心的向量化计算
使用octave编程的时候,一定要注意使用向量化编程的思想,下面我就说说我今天做题遇到的一个K-means聚类问题,如何使用octave中的函数向量计算聚类中心centroids。
octave几个函数:
bsxfun:
二元操作函数,调用方式: bsxfun (F, A, B),A为 向量、二维矩阵或多维矩阵,B也为 向量、二维矩阵或多维矩阵,F为二元操作函数。如果 A 和 B 维度数不一样,或者 对应维度长度不一样,此函数会首先尝试把 A 和 B 都broadcast 到相同维度,且对应维度长度相同的两个向量。然后,再把A和B中一一的两个元素使用二元函数F做计算,返回的结果是与broadcast之后的A和B相同维度、对应维度相同长度的一个向量。
例如:
A = [1, 2, 3]; #这里A 可以看做是行向量
B = [1, 2, 3]; #这里B 可以看做是行向量
C = bsxfun(@plus, A, B);
则 C = [2, 4, 6]
因为它天生支持broadcast,所以如果必须要broadcast,系统不会产生 “warning: operator +: automatic broadcasting operation applied”
警告。
例如:
A2 = A'; # 这里表示 撇号的作用就是求转置。即C是A向量的转置 ,即C是列向量。
D = bsxfun(@plus, A2, B);
则 D = [ 2, 3, 4,
3, 4, 5,
4, 5, 6]
解释:
发现A2是3×1,B是1×3,于是将A2 broadcast 到3×3,其他两列拷贝第一列的值;B 也broadcast到3×3,
其他两行拷贝第一行的值;接着,将A2与B对应位置的元素,进行plus操作,这里是求和操作,于是得到结果D。
accumarray:
分组计算函数,调用方式: accumarray (SUBS, VALS, SZ, FUNC, FILLVAL, ISSPARSE),SUBS为一个数组,
其元素内容为新的数组下标值,VALS为一个数组,其元素为要进行操作的数值,缺省的动作是 sum 求和操作。
例如:
A = [1, 2, 3, 4]' #注意A为列向量
B = [1, 2, 1, 2]' #注意B为列向量
C = accumarray(B, A)
则 C = [4, 6]' #注意C为列向量。
解释:
B的值对应分配到新的数组的对应下标,由于B(1) = B(3) = 2,于是A(1),A(3) 的值分到C(1),且缺省FUNC是求和操作,
于是C(1)=A(1)+A(3) = 4,同理C(2) = A(2) + A(4) = 6
accumarray函数调用,返回的结果是一维向量,如果想返回矩阵呢,那就必须用到下面的accumdim函数。
accumdim:
分组计算函数,调用方式:accumdim (SUBS, VALS, DIM, N, FUNC, FILLVAL)
例如:
A = [1, 1, 1; 2, 2, 2; 3, 3, 3; 4, 4, 4] #A为4×3矩阵
B = [1, 2, 1, 2]' #B为列向量
C = accumdim(B, A)
则 C = [ 4, 4, 4; 6, 6, 6] #2×3矩阵。
解释,简单的说,就是将A矩阵中的行向量,按B下标分组,每组中的向量对应列求和,得到新的一个向量。
假设,X为样本点矩阵,m×n,表示m个样本点,n个特征;idx为一维列向量,其值为m个样本点对应的聚类下标,取值(1..K),即K个聚类。
centroids即为K个聚类中心,为K×n矩阵,每一行表示一个中心,第k行表示第k个聚类的中心。现在要求新的聚类中心。
代码如下:
position = unique(idx) cmeans = accumdim(idx, X, 1, 0, @mean) centroids(position, :) = cmeans
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