胸片和CT断层图像是怎么来的？

本文作者系医科大学青年教师,关注公众号"计算机视觉life"菜单栏回复"医学" 进群交流如何得到CT断层图像? 相信小伙伴体检的时候都拍过胸片,假如哪个不幸的小伙伴胸片有点"小问题"的话呢,还要再拍个CT图像让医生仔细看一下,那么这些图像有什么区别呢?又是如何得到的呢?今天我给大家简单介绍一下. 首先,胸片和CT图像长什么样子呢? 左图是我们平常所说的胸片,右边就是CT的断层图像.左边只有一张图片,相当于把人变成透明的,可以看到身体的内部,所以…

五、如何通过CT三维图像得到DRR图像

一.介绍获取DRR图像是医疗图像配准里面的一个重要的前置步骤:它的主要目的是,通过CT三维图像,获取模拟X射线影像,这个过程也被称为数字影响重建. 在2D/3D的配准流程里面,需要首先通过CT三维图像,能够获取任意位置的DRR图像,然后去与已经获取的X光平面图像配准. 配准过程如下(下面的描述是不准确的,我只是描述了一种情况,即基于灰度的图像配准算法的过程,并且可能会有纰漏): 1- 定义一个评价函数:即相似性测度函数,通过这个函数评价当前是否已经达到了配准的要求. 2- 不断通过调整输入参数…

DICOM医学图像窗口变换的加速算法

详见:http://pan.baidu.com/s/1gfFLbJ9 DICOM医学图像窗口变换的加速算法* 张尤赛 ,陈福民 ( 同济大学计算中心, 上海 200092 ) (华东船舶工业学院电子与信息系,江苏镇江 212003) E_mail:yszhang100@sina.com 摘要:研究DICOM医学图像的显示技术,提出了一种图象窗口变换的加速算法,该算法简洁.实用.加速效果理想, 可以在动态连续调节图像窗值的情况下实时地显示DICOM医学图像. 关键词: DICOM: 医学图…

一文带你解读：卷积神经网络自动判读胸部CT图像的机器学习原理

本文介绍了利用机器学习实现胸部CT扫描图像自动判读的任务,这对我来说是一个有趣的课题,因为它是我博士论文研究的重点.这篇文章的主要参考资料是我最近的预印本 “Machine-Learning-Based Multiple Abnormality Prediction with Large-Scale Chest Computed Tomography Volumes.” CT扫描图像是一种大体积图像,大小约为512×512×1000灰度体素,用于描绘心脏.肺和胸部的其他解剖结构.胸部CT扫描图像…

有没有无痛无害的人体成像方法？OCT（光学相干断层扫描）了解一下

关于之前推送的胸片和CT有很多的小伙伴关心射线对人体的伤害的问题,在医学检查射线的强度和剂量已经有严格的标准,偶尔进行一次CT扫描是没有问题的,那么有没有一种完全无害的扫描检查呢?今天小编就给大家介绍一种无害.非介入的新型层析成像技术--光学相干断层扫描技术 (Optical Coherence Tomography,简称 OCT),简而言之就是利用无毒无害的光波进行人体组织的成像,OCT技术近年来发展飞快,特别是生物组织活体检测和成像方面具有诱人的应用前景,已尝试在眼科.牙科和皮肤科的临床诊断…

我所遭遇过的中间件--VTK

我所遭遇过的中间件--VTK Vtk是我接触的第一款软件开发包,它引导我对图形学的入门.我是先学的VTK,后学的OpenGL和D3D.VTK是专为图形学开发,特点是接口清晰,好上手,又含有大量的图像处理算法.从VTK入手3D图形学,要比从OpenGL和D3D容易的多. 最初接触VTK是研一那年暑假,研一时我做医学图像处理.VTK很适合由图像处理转到3D图形学,对做医学图像也很方便.它集成着DICOM图像文件格式的解析器.我看过解析DICOM文件的代码,大约5000多行.这代码量对当时的我来说如同…

Image Processing and Analysis_15_Image Registration：A survey of medical image registration——1998

此主要讨论图像处理与分析.虽然计算机视觉部分的有些内容比如特征提取等也可以归结到图像分析中来,但鉴于它们与计算机视觉的紧密联系,以及它们的出处,没有把它们纳入到图像处理与分析中来.同样,这里面也有一些也可以划归到计算机视觉中去.这都不重要,只要知道有这么个方法,能为自己所用,或者从中得到灵感,这就够了. 注意:Registration可翻译为“配准”或“匹配”,一般是图像配准,特征匹配(特征点匹配). MIA] Image matching as a diffusion process[…

DICOM设备Raw Data与重建

DICOM设备Raw Data与重建现在的医疗影像设备基本都已DICOM为标准.但现在许多医院的技术人员都以为只要支持DICOM就一切OK,其实不然.DICOM中有Storage.Print.Worklist.Storage Commitment等很多部分.影像传输其实只用到了Storage部分. 分清楚了不同DICOM功能,每一个功能中还分SCU/SCP.U是User,P是Provider.某项功能动作的发起者就是User,反之是Provider.例如:Storage.设备要往其…

从《三体》到“中美科技战”，3分钟理解“网络”D丝为什么要迎娶“算力”白富美

摘要:在多维的世界里,高维的文明对于低维文明具有碾压的优势,而网络也正在从二维走向三维!网络硬件的竞争主要是“芯片+算法”. 从三体到中美科技战,理解网络与算力深度融合助力高维度竞争 1:对抗封锁,需要云天明.面壁人和执剑人早在奥巴马时代,白宫就对<三体>表现出了极大的兴趣:“奥巴马读了<三体1>和<三体2>,然后就痴迷于刘慈欣的作品,一心等着<三体3>的出版.<三体3>的中文版出了之后,奥巴马就让白宫里的工作人员给刘慈欣发电子邮件,想尽快看到…

fMRI数据分析处理原理及方法（转载）

原文地址:http://www.cnblogs.com/minks/p/4889497.html 近年来,血氧水平依赖性磁共振脑功能成像(Blood oxygenation level-dependent functional magnetic resonance imaging, BOLD-fMRI)技术得到极快的发展,除了与扫描硬件.扫描技术的进步有关外,更得力于以图形图像等计算机科学为核心的相关学科的支持:图像数据的后处理技术成为fMRI中的关键环节一.功能图像数据的性质功能磁共振数据…

fMRI数据分析处理原理及方法

来源: 整理文件的时候翻到的,来源已经找不到了囧感觉写得还是不错,贴在这里保存. 近年来,血氧水平依赖性磁共振脑功能成像(Blood oxygenation level-dependent functional magnetic resonance imaging, BOLD-fMRI)技术得到极快的发展,除了与扫描硬件.扫描技术的进步有关外,更得力于以图形图像等计算机科学为核心的相关学科的支持:图像数据的后处理技术成为fMRI中的关键环节一.功能图像数据的性质功能磁共振数据包括解剖(结构)…

3D Slicer Programmatically Set Slice Offset and Intersections 用代码修改Slicer中的切片偏移和交叉点显示

在3D Slicer中,当我们导入.mha/.mhd等格式的volume文件后,那么我们就可以在Axial, Sagittal, Coronal三个方向来观察我们的MRI或者CT的图像了.3D Slicer界面提供了很多交互的功能,比如正上方就有一个滑动条slider,可以用来滑动切片观察,如果我们不想手动来滑动slider,而是通过事件触发,或者其他功能来触发时,那么我们就是要通过代码来对切片进行交互.Slicer的用户界面是Qt写的,所有我们能通过用户交互触发的功能,都可以通过代码来触发.我…

自适应注意力机制在Image Caption中的应用

在碎片化阅读充斥眼球的时代,越来越少的人会去关注每篇论文背后的探索和思考. 在这个栏目里,你会快速 get 每篇精选论文的亮点和痛点,时刻紧跟 AI 前沿成果. 点击本文底部的「阅读原文」即刻加入社区,查看更多最新论文推荐. 这是 PaperDaily 的第 71 篇文章本期推荐的论文笔记来自 PaperWeekly 社区用户 @jamiechoi.本文主要讨论自适应的注意力机制在 Image Caption 中的应用.作者提出了带有视觉标记的自适应 Attention 模型,在每一个 tim…

lung 分割论文

<4D Lung Tumor Segmentation via Shape Prior and Motion Cues > Abstract— Lung tumor segmentation is important for therapy in the radiation treatment of patients with thoracic malignancies. In this paper, we describe a 4D image segmentation method bas…

fMRI数据分析处理原理及方法————转自网络

fMRI数据分析处理原理及方法来源: 整理文件的时候翻到的,来源已经找不到了囧感觉写得还是不错,贴在这里保存. 近年来,血氧水平依赖性磁共振脑功能成像(Blood oxygenation level-dependent functional magnetic resonance imaging, BOLD-fMRI)技术得到极快的发展,除了与扫描硬件.扫描技术的进步有关外,更得力于以图形图像等计算机科学为核心的相关学科的支持:图像数据的后处理技术成为fMRI中的关键环节一.功能图像数据的性质…

Candidate Generation and LUNA16 preprocessing

在这个kernel中,我们将讨论有助于更好地理解问题陈述和数据可视化的方法. 我还将提供有用的资源和信息的链接. 此脚本是用Python编写的. 我建议人们在桌面上安装anaconda,因为here提到了它的优点. 本教程中用于读取,处理和可视化数据的库是matplotlib,numpy,skimage和pydicom.. 图像大小(z,512,512),其中z是CT扫描中的切片数量,取决于扫描仪的分辨率. 由于计算能力的限制,这样的大图像不能直接送到卷积网络中. 因此,我们将不得不找到更可能患…

blob斑点检测

目录 1. 可选算法 1.1. Laplacian of Gaussian (LoG) 1.2. Difference of Gaussian (DoG) 1.3. Determinant of Hessian (DoH) 2. skimage 代码实现 3. 基于 OpenCV 3.1. 过滤斑点 blob 或者叫斑点,就是在一幅图像上,暗背景上的亮区域,或者亮背景上的暗区域.由于斑点代表的是一个区域,相比单纯的角点,它的稳定性要好,抗噪声能力要强,所以它在图像配准上扮演了很重要的角色. 同时…

医学CT图像特征提取算法(matlab实现)

本科毕设做的是医学CT图像特征提取方法研究,主要是肺部CT图像的特征提取.由于医学图像基本为灰度图像,因此我将特征主要分为三类:纹理特征,形态特征以及代数特征,每种特征都有对应的算法进行特征提取. 如上图所示,三类特征都有对应方法进行特征提取,在毕设中,利用matlab编程实现了三类算法,并且利用matlab的GUI做出了一个简单的界面系统,用于特征提取.…

DICOM图像像素值（灰度值）转换为CT值

CT值的单位是Hounsfield,简称为Hu,范围是-1024-3071.用于衡量人体组织对X射线的吸收率,设定水的吸收率为0Hu. 在DICOM图像读取的过程中,我们会发现图像的像素值有可能不是这个范围,通常是0-4096,这是我们常见到的像素值或者灰度值,这就需要我们在图像像素值(灰度值)转换为CT值. 首先,需要读取两个DICOM Tag信息,(0028|1052):rescale intercept和(0028|1053):rescale slope. 然后通过公式: Hu = pix…

肺结节CT影像特征提取（二）——肺结节CT图像特征提取算法描述

摘自本人毕业论文<肺结节CT影像特征提取算法研究> 医学图像特征提取可以认为是基于图像内容提取必要特征,医学图像中需要什么特征基于研究需要,提取合适的特征.相对来说,医学图像特征提取要求更加高,因为对医生的辅助诊断起着至关重要的作用,所以需要严谨可靠的特征.肺结节CT影像特征提取也是属于医学图像特征提取领域的一个部分,有着医学图像特征提取的基本要求.既有其他医学图像特征提取的方法,也有针对肺结节的特定特征提取方法.本小节主要对一些常用的肺结节CT影像医学图像特征提取方法进行介绍,主要可以分为灰…

肺结节CT影像特征提取（一）——肺结节CT图像特征概要

图像数据到网格数据-1——MarchingCubes算法

原文:http://blog.csdn.net/u013339596/article/details/19167907 概述之前的博文已经完整的介绍了三维图像数据和三角形网格数据.在实际应用中,利用遥感硬件或者各种探测仪器,可以获得表征现实世界中物体的三维图像.比如利用CT机扫描人体得到人体断层扫描图像,就是一个表征人体内部组织器官形状的一个三维图像.其中的感兴趣的组织器官通过体素的颜色和背景加以区别.如下图的人体足骨扫描图像.医生通过观察这样的图像可以分析病人足骨的特征,从而对症下药. 这类…

基于面绘制的MC算法以及基于体绘制的 Ray-casting 实现Dicom图像的三维重建(python实现)

加入实验室后,经过张老师的介绍,有幸与某公司合共共同完成某个项目,在此项目中我主要负责的是三维 pdf 报告生成.Dicom图像上亮度.对比度调整以及 Dicom图像三维重建.今天主要介绍一下完成Dicom图像三维重建的过程以及自己的心得体会.实现Dicom三维图像重建最主要用的VTK(Visualization Toolkit,也就是可视化工具包),由于今天的主题不是有关VTK,所以有关VTK的学习(包括VTK介绍.使用.实列),可以参考此链接:https://blog.csdn.net/wi…

图像数据到网格数据-1——Marching Cubes算法的一种实现

概述之前的博文已经完整的介绍了三维图像数据和三角形网格数据.在实际应用中,利用遥感硬件或者各种探测仪器,可以获得表征现实世界中物体的三维图像.比如利用CT机扫描人体得到人体断层扫描图像,就是一个表征人体内部组织器官形状的一个三维图像.其中的感兴趣的组织器官通过体素的颜色和背景加以区别.如下图的人体足骨扫描图像.医生通过观察这样的图像可以分析病人足骨的特征,从而对症下药. 这类应用在计算机领域叫做科学可视化.由于本文主要不是讨论可视化这个大的命题,所以只是简要的讲述一下三维可视化的两大类实现方式…

关于统计变换（CT/MCT/RMCT）算法的学习和实现

原文地址http://blog.sina.com.cn/s/blog_684c8d630100turx.html 刚开会每周的例会,最讨厌开会了,不过为了能顺利毕业,只能忍了.闲话不多说了,下面把上周学习的一个简单的算法总结一下,以备后面写毕业论文的时候可以参考一下. 一.Census Transform(CT)算法的学习 Census Transform 算法是Ramin Zabih 和 John Woodfill 于1994年在他们的论文<Non-parametric LocalTr…

VTK序列图像的读取[转][改]

医学图像处理的应用程序中,经常会碰到读取一个序列图像的操作.比如CT.MR等所成的图像都是一个切面一个切面地存储的,医学图像处理程序要处理这些数据,第一步当然是把这些数据从磁盘等外部存储介质中导入内存. 利用VTK可以读取多种格式的图像文件,支持读取单个的二维图像(比如*.BMP.*.JPEG.*.PNG等)或者三维图像文件(*.VTK.*.mhd.*.mha等),也支持序列图像文件的导入.下面我们详细地讲解如何在VTK里实现序列图像文件的读取(我们以美国可视人的数据做为测试数据,数据可以从这里…