<Python学习手册>(二) --类型和运算 数字 十六进制 八进制 二进制 0x 0o 0b hex() oct() bin() >>>int('10',2) 2 >>>int('10',16) 16 >>>int(3.14159) 3 >>>float(3) 3.0 about yield: http://www.cnblogs.com/tqsummer/archive/2010/12/27/1917927.html…

# 读取fasta # 解析每条序列的长度 chr1_seq = 'ATATATATAT' chr2_seq = 'ATATATATATCGCGCGCGCG' chr3_seq = 'ATATATATATCGCGCGCGCGATATATATAT' chr4_seq = 'ATATATATATCGCGCGCGCGATATATATATCGCGCGCGCG' chr5_seq = 'ATATATATATCGCGCGCGCGATATATATATCGCGCGCGCGATATATATAT' # 求和 tot…

读取fasta文件genome_test.fa,并计算染色体总长,同时输出最长染色体编号.序列以及长度 fasta文件genom_test.fa的内容如下: >chr1ATATATATAT>chr2ATATATATATCGCGCGCGCG>chr3ATATATATATCGCGCGCGCGATATATATAT>chr4ATATATATATCGCGCGCGCGATATATATATCGCGCGCGCG>chr5ATATATATATCGCGCGCGCGATATATATATCGCGCG…

# 读取fasta # 解析每条序列的长度 chr_len = [10,20,30,40,50] # 求和 # 方法一:通过循环 total_len = 0 #定义total_len的初始长度 for len in chr_len: # 从列表chr_len中每次取一个值交给len total_len += len # 或者total_len = total_len + len # 方法二:通过函数sum() total_len = sum(chr_len) # 求最长染色体编号 max_len…

# 读取fasta # 解析每条序列的长度 chr_len = {'chr1':10,'chr2':20,'chr3':30,'chr4':40,'chr5':15} # 求和 total_len = sum(chr_len.values()) # 获取键用keys for chr in chr_len.keys(): print(chr) # 获取值用values for len in chr_len.values(): print(len) # 获取键值对用items for [chr,le…

# 读取fasta # 解析每条序列的长度 chr1_len = 10 chr2_len = 20 chr3_len = 30 chr4_len = 40 chr5_len = 50 # 求和 total_len = chr1_len + chr2_len + chr3_len + chr4_len + chr5_len # 输出结果 print(total_len)…

目录: 数据库介绍 mysql 数据库安装使用 mysql管理 mysql 数据类型 常用mysql命令事务 索引 创建数据库 外键 增删改查表 权限 python 操作mysql  ORM sqlachemy学习 内容: 1.数据库介绍 什么是数据库? 数据库是按照数据结构来组织.存储和管理数据的仓库,每个数据库都有一个或多个不同的API用于创建.访问.管理.搜索和复制所保存的数据,我们也可以将数据存储在文件中,但是文件读写数据速度相对较慢,所以现在我们使用关系型数据库管理系统RDBMS来存储…

# 传递命令行参数 # 导入sys模块 import sys print(sys.argv)   命令行操作 python argv.py 10 20 30 40 50 回车输出 ['argv.py', '10', '20', '30', '40', '50']   # 方法一,删掉第0个元素 del(sys.argv[0]) print(sys.argv)   命令行操作 python argv.py 10 20 30 40 50 回车输出 ['10', '20', '30', '40', '…

含有染色体长的文件chr_len.txt chr1 10chr2 20chr3 30chr4 40chr5 50 python脚本 #传递命令行参数 import sys # 导入模块 # 从命令行获取文件名称 f_chr_len = sys.argv[1] # 定义命令行参数,1表示变量1 # 打开文件 open('文件路径') f = open(f_chr_len) # 逐行读取 total_len = 0 lines = f.readlines() # 是一个列表 for line in…

序列化 1.什么是python序列化? 把变量从内存中变成可存储或传输的过程称之为序列化,在Python中叫pickling 序列化就是将python的数据类型转换成字符串 反序列化就是将字符串转换成python的数据类型 2.Python中用于序列化的两个模块 json     用于[字符串]和 [python基本数据类型] 间进行转换 pickle   用于[python特有的类型] 和 [python基本数据类型]间进行转换 Json模块提供了四个功能:dumps.dump.loads.l…

转载自:http://www.cnblogs.com/liwenzhou/articles/8305104.html Django的View(视图) 一个视图函数(类),简称视图,是一个简单的Python 函数(类),它接受Web请求并且返回Web响应. 响应可以是一张网页的HTML内容,一个重定向,一个404错误,一个XML文档,或者一张图片. 无论视图本身包含什么逻辑,都要返回响应.代码写在哪里也无所谓,只要它在你当前项目目录下面.除此之外没有更多的要求了——可以说“没有什么神奇的地方”.为…

函数 abs(-20)                                        //结果为:20,绝对值函数 def 函数名称([参数1,参数2,参数3]): 执行语句 return def test(r): s=3.14*r*r return s s=test(1) print s                                            //结果为:3.14 cmp(x,y)                                  …

实际开始看这一章节的时候,觉得都不想看了,因为每种语言都会有控制流,感觉好像我不看就会了似的.快速预览的时候,发现了原来还包含了对函数定义的一些描述,重点讲了3种函数形参的定义方法,章节的最后讲述了PEP8的一些重要的规范,在学习的过程中还是学到了些知识. 2.1  if 语句 if语句就不多说了,经常跟else if .. 和 else ..一起使用,如下所示: >>> x = int(raw_input("Please enter an integer: "))…

Python基础知识(21):IO编程 一.文件读写 读写文件就是请求操作系统打开一个文件对象(文件描述符),然后,通过操作系统提供的接口从这个文件对象中读取数据(读文件),或者把数据写入这个文件对象(写文件) 1.读文件 “r”默认读取文本文件,“rb”读取二进制文件,如图片.视频等 >>> f=open("D:\Python\doit\hello.txt","r") >>> f.read() 'Hello, world!'&g…

Python基础 基础教程参考廖雪峰的官方网站https://www.liaoxuefeng.com/ 一."大数据时代",数据获取的方式 1. 企业生产的用户数据:大型互联网公司有海量用户,所以他们积累数据有天然的优势. 有数据意识的中小型企业,也开始积累的数据. 2. 数据管理咨询公司:通常这样的公司有很庞大的数据采集团队,一般会通过市场调研.问卷调查.固定的样本检测, 和各行各业的公司进行合作.专家对话(数据积累很多年了,最后得出科研结果)来采集数据. 3. 政府/机构提供的公开…

一.基本知识 1.缩进: 2.一行多条语句: 3.断行: 4.注释 # 单行注释 '''这是一段 多行注释''' 5. 变量 1. 变量类型(局部变量.全局变量.系统变量) 2. 变量赋值 多重赋值x=y=z=1 多元赋值x,y = y,x 3. 变量自增 x+=1 x-=1(不支持x++, x--) *******Python3常量用大写表示,例如:PI = 360  表示常量,常量不能修改****** 二.Python的基本数据类型(6种) 1.数字Number 1. 种类 1. 整型int…

声明: 博文参考1:字符编码发展历程(ASCII,Unicode,UTF-8) 博文参考2:Python常见字符编码间的转换 (1)为什么要用字符编码 早期的计算机使用的是通电与否的特性的真空管,如果通电就是1,没有通电就是0,后来沿用至今我们称这种只有0/1的环境为 二进制制,英文称为binary.但是二进制数据(0/1)怎么能表示我们所熟知的英文,数字,字符,汉字呢?所以就有了各种编码,因 为开始计算机只在美国用.八位的字节一共可以组合出256(2的8次方)种不同的状态.(可以涵盖美国人使用…

5.2 序列化模块 ​ 将一种数据结构转换成一种特殊的序列(字符串或bytes)的过程就叫序列化.这个特殊的序列还可以通过命令反解回原来的数据类型. python中有三种序列化的功能模块: json模块: ​ 不同语言间遵循的一种数据转化格式,序列化为不同语言都能使用的特殊字符串:json只支持部分python数据结构(int,str,bool,tuple,float,dict) ​ 使用最多 pickle模块: ​ python独有的一种数据转化格式,支持python所有的数据类型包括实例化对…

python中的变量不需要声明,每个变量中使用前都必须赋值,变量赋值以后该变量才会被创建. 在python中变量就是变量,他没有类型,我们所说的类型是变量所指的内存中对象的类型. python3中有六个标准的数据类型: 1.Numbers-数字: 2.String-字符串: 3.List-列表: 4.Tuple-元组: 5.Sets-集合: 6.Dictionaries-字典. 一.numbers(数字) python3支持int.float.bool和complex(复数) 可以使用type(…

笔记内容: 一.模块 Python越来越被广大程序员使用,越来越火爆的原因是因为Python有非常丰富和强大标准库和第三方库,几乎可以实现你所想要实现的任何功能,并且都有相应的Python库支持,比如用于简单绘图的turtle标准库,网络爬虫的requests请求库.解析库lxml.BeautifulSoup等等的第三方库这些都是Python的模块.这些库也就是我们所说的模块. 标准库:不需要下载安装就可以直接引用的库,都是标准库. 第三方库:需要我们下载安装的库,都是第三方库. 在使用模块时我…

1.编码转换介绍        unicode是最底层.最纯的,会根据终端的编码进行转化展示 一般硬盘存储或传输为utf-8(因为省空间.省带宽),读入内存中为unicode,二者如何转换 a = '你好'              '\xe4\xbd\xa0\xe5\xa5\xbd'     <type 'str'> b = u'你好'             u'\u4f60\u597d'                <type 'unicode'> a.decode('ut…

为了使网站更干净简洁更容易维护,页面的设计和Python的代码必须分离开.我们可以使用Django的 模板系统 (Template System)来实现这种模式. 几个简单的模板标签(tag):    for 标签 {% for item in item_list %}   用于构建简单的循环,允许你遍历循环中的每一项    if 标签 {% if ordered_warranty %}  是用来执行逻辑判断的.在这个例子中标签检测 ordered_warranty 变量值是否为 True .如…

一.QuerySet 可切片 使用Python 的切片语法来限制查询集记录的数目 .它等同于SQL 的LIMIT 和OFFSET 子句. Entry.objects.all()[:5] # (LIMIT 5) 不支持负的索引(例如Entry.objects.all()[-1]).通常,查询集 的切片返回一个新的查询集 —— 它不会执行查询. 可迭代 articleList=models.Article.objects.all() for article in articleList: print…

装饰器(二)&模块 #普通装饰器基本格式 def wrapper(func): def inner(): pass return func() return inner def func(): pass func = wrapper(func) func() #带参数装饰器基本格式 def w(counter): def wrapper(func): def inner(*args,**keargs): lis = [] for i in range(0,counter): a=func(*ar…

Python基础知识(28):常用第三方模块 一.Pillow PIL(Python Imaging Library):提供了强大的图像操作功能,可以通过简单的代码完成复杂的图像处理,是Python平台事实上的图像处理库,支持Python 2.7以及更低的版本 Pillow:在PIL基础上创建的兼容版本,同时加入了更多新特性,支持Python 3.x 1.安装Pillow 如果安装了Anaconda,Pillow就已经可用了.否则,需要在命令行下通过pip安装 2.操作图像 (1)图像缩放 fr…

Python基础知识(27):常用内建模块(Ⅲ) 1.urlblib urllib提供了一系列用于操作URL的功能 url是统一资源定位符,对可以从互联网上得到的资源的位置和访问方法的一种简洁的表示,是互联网上标准资源的地址 互联网上的每个文件都有一个唯一的URL,它包含的信息指出文件的位置以及浏览器应该怎么处理它 (1)GET urllib的request模块可以非常方便地抓取URL内容,也就是发送一个GET请求到指定的页面,然后返回HTTP的响应 #对豆瓣的一个URLhttps://api.…

Python基础知识(26):常用内建模块(Ⅱ) 1.hashlib Python的hashlib提供了常见的摘要算法,如MD5,SHA1等 摘要算法又称哈希算法.散列算法. (1)它通过一个函数,把任意长度的数据转换为一个长度固定的数据串(通常用16进制的字符串表示) (2)摘要算法就是通过摘要函数f()对任意长度的数据data计算出固定长度的摘要digest,目的是为了发现原始数据是否被人篡改过 MD5 MD5是最常见的摘要算法,速度很快,生成结果是固定的128 bit字节,通常用一个32位…

Python基础知识(23):进程和线程(Ⅱ) 一.threadlocal 在多线程环境下,每个线程都有自己的数据 一个线程使用自己的局部变量比使用全局变量好,因为局部变量只有线程自己能看见,不会影响其他线程,而全局变量的修改必须加锁 在函数间一层层调用的时候,使用局部变量很麻烦,使用全局变量无法实现不同对象之间的共享 threadlocal消除了对象在每层函数中的传递问题 ThreadLocal最常用的地方就是为每个线程绑定一个数据库连接,HTTP请求,用户身份信息等,这样一个线程的所有调用到…

Python基础知识(22):进程和线程(Ⅰ) 1.多进程 (1)fork Python的os模块封装了常见的系统调用,其中就包括fork,可以在Python程序中轻松创建子进程 fork可以在Mac的Python上运行,但无法再Windows下运行 (2)multiprocess multiprocessing模块就是跨平台版本的多进程模块 multiprocessing模块提供了一个Process类来代表一个进程对象 #process_1.py from multiprocessing im…

Python基础知识(20):错误.调试和测试 一.错误处理 在运行程序的过程中有可能会出错,一般我们会在添加一段代码在可能出错的地方,返回约定的值,就可以知道会不会出错以及出错的原因 1.使用try......except......finally......错误处理机制 try...可能会出异常的代码 except...如果try后面的代码出错,则运行这里的语句:否则直接运行finally语句 finally...无论try语句是否出错都会运行 try: z=5/0 print("ressu…