安装生物信息学软件-HUMAnN2】的更多相关文章

先挖坑 因为这个软件需要memory>16G,所以应该要安装在服务器上…
上周20161021-20161028的任务还没有搞完,所以今天来填坑(微笑脸) ××××××××××××××××××××我是萌萌哒分割线××××××××××××××××××××××××××××××× 本文参考:https://bitbucket.org/biobakery/biobakery/wiki/metaphlan2 MetaPhlAn2是使用宏基因组鸟枪法测序数据描绘微生物群落组成的工具. ps: 与系统发育相关的图的表示 安装: 1. 下载并解压 2. 修改/etc/profile,…
好吧,这是本周(2016.10.21-28)的学习任务之一:安装bowtie2并学习其使用方法&参数设置 所以,啃文档咯,官方文档Version 2.2.9 http://bowtie-bio.sourceforge.net/bowtie2/manual.shtml 以下是我的整理.我不生产文档,我只是文档的搬运工么么哒- Bowtie2适合将长度50-1000bp的reads比对到长的参考序列上.Bowtie 2 indexes the genome with an FM Index (bas…
主要参考http://www.3fwork.com/b211/000091MYM021616/ Step 1 : sudo gedit /etc/apt/sources.list 添加到末尾 deb http://mirrors.xmu.edu.cn/CRAN/bin/linux/ubuntu xenial/ 保存退出 Step 2: 下载公钥并更新 sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys 51716619E08…
装完Bowtie2,官方文档给出的栗子说可以玩一玩samtools,所以我入个坑 参考这篇http://m.010lm.com/roll/2016/0620/2343389.html Step 1: 安装libncurses5库(貌似和字符多色显示有关?生信人会玩=.=) sudo apt-get install libncurses5 libncurses5-dev Step 2: 安装zlib(压缩与解压,有教程说不装会报错=.=) sudo apt-get install zlib1g-d…
其实好多东西装过好多次,然而每次都要翻文档,经常掉进前面掉进过的坑...所以这里重新写一份指南,以防下次再装又忘了(魂淡我并不想再装了啊不要立flag) 1. 安装biopython 1.1 因为biopython目前支持的是python2,所以我先把python调到2 1.2 安装numpy (http://www.numpy.org/) NumPy is the fundamental package for scientific computing with Python. It cont…
环境:RHEL 6.4 + Oracle 11.2.0.4 需求:单机静默安装GI软件并创建ASM实例和ASM磁盘组,为后续迁移数据库文件到ASM做准备 1. 安装配置GI软件 2. 创建ASM实例 3. 创建ASM磁盘组DATA1 1. 安装配置GI软件 1.1 创建grid用户和相关组,创建目录,确认ASM磁盘权限,配置环境变量 -- 创建grid用户和相关组 groupadd asmadmin groupadd asmdba groupadd asmoper useradd -g oins…
我们都知道安装软件最简单的方法是apt-get install,但是卸载就不常用了,如何卸载呢?1.sudo apt-get remove xxxxxsudo apt-get autoremove2.对于用命令sudo aptitude install xxx安装的软件可以用sudo aptitude remove xxx卸载即可. 补充一点使用方法:一是从命令行启动 kchmviewer 二是让chm文件自动关联,这个在chm文件右键里选择一下就可以了.选择的名字是 kchmviewer.其实…
        Linux 中如何卸载已安装的软件. Linux软件的安装和卸载一直是困扰许多新用户的难题.在Windows中,我们可以使用软件自带的安装卸载程序或在控制面板中的“添加/删除程序”来实现.与其相类似,在Linux下有一个功能强大的软件安装卸载工具,名为RPM.它可以用来建立.安装.查询.更新.卸载软件.该工具是在命令行下使用的.在Shell的提示符后输入rpm,就可获得该命令的帮助信息. 软件的安装 Linux下软件的安装主要有两种不同的形式.第一种安装文件名为xxx.tar.g…
安装ubuntu 老毛桃进入win pe修复启动项 在win pe下面制作ubuntu的安装盘,只用的软件是ultraISO 参考博客下面的分区的那篇文章  http://jingyan.baidu.com/article/60ccbceb18624464cab197ea.html 此时win pe的启动盘成为了ubuntu的启动盘 在安装ubuntu的时候,原来装有win7的硬盘的格式是ntfs,就不要动那些盘了 其他的参考分区下面安装ubuntu的那个链接 安装ubuntu后要安装的软件,解…
1.sudo apt-get remove xxxxx  sudo apt-get autoremove2.对于用命令sudo aptitude install xxx安装的软件可以用sudo aptitude remove xxx卸载即可…
Linux 中如何卸载已安装的软件. Linux软件的安装和卸载一直是困扰许多新用户的难题.在Windows中,我们可以使用软件自带的安装卸载程序或在控制面板中的“添加/删除程序”来实现.与其相类似,在Linux下有一个功能强大的软件安装卸载工具,名为RPM.它可以用来建立.安装.查询.更新.卸载软件.该工具是在命令行下使用的.在Shell的提示符后输入rpm,就可获得该命令的帮助信息. 软件的安装 Linux下软件的安装主要有两种不同的形式.第一种安装文件名为xxx.tar.gz:另一种安装文…
在redhat的client版本中自带有办公软件libreoffice,而在server版的redhat中却没有自带的办公软件,那么,如何在redhat的server版下安装办公软件呢? 方法一:配置redhat的client版的yum源进行安装libreoffice(此处不做详细说明) 方法二:自己安装办公软件(本文以openoffice为例) 首先介绍下什么是libreoffice和openoffice 1.openoffice OpenOffice.org 是一套跨平台的办公室软件套件,能…
安装PHP软件 ① tar -zxvf php-5.2.5.tar.gz ② cd php-5.2.5 ③ 使用configure配置安装信息(最重要) ./configure \ --prefix=/usr/local/php --with-apxs2=/usr/local/apache/bin/apxs :指定Apache目录 --with-mysql=/usr/local/mysql         :指定MySQL目录 ④ make ⑤ make install 安装完成后,在虚拟主机h…
安装MySQL软件(绿色版) ① 解压软件包 ② 更改文件夹名称为mysql并复制到/usr/local文件夹下 ③ 使用cd指令进入/usr/local/mysql文件夹,使用ls –l查看 查看后发现,文件中的文件拥有者与文件的所属组都显示8972,为什么呢? 答:因为开发者在打包mysql时,系统会自动保存文件的拥有者与所属组,如果这个拥有者和所属组在当前Linux操作系统中找不到,则自动显示8972. ④ mysql安装详细步骤 第一步:groupadd mysql ,添加mysql组…
当前关于12c的中文资料比较少,本人将关于DBA的一部分官方文档翻译为中文,很多地方为了帮助中国网友看懂文章,没有按照原文句式翻译,翻译不足之处难免,望多多指正. 2.2 安装数据库软件 这部分简短讲述了桌面类型安装的步骤.对于所有的平台,大部分步骤都是一样的,都涉及到运行Oracle Universal Installer. 执行一个基本的安装: (1)  以管理组成员身份登录计算机,这个身份需要有权按照Oracle数据库,也有权创建和运行数据库: (2)  执行下面的一个: 1)如果你从分布…
相信大家看到这边博客时,应该也是遇到类似的问题,这个可能是win8的一个bug.最直接的解决方法是,将目前语言环境由中文改为英文,再安装运行软件应该就不会有问题了. 但是,我们下次在安装应用程序时依然会出现相似的问题,下面介绍一个一劳永逸的方法:进入Control Panel→All Control Panel Items→Region,将其中的“Location”和“Aministrative→Current Language for non-Unicode programs”分别改成“Chi…
参考网址:http://wiki.ubuntu.org.cn/UbuntuSkills 一般的安装程序用三种: .deb 和.rpm 这两种安装文件 .bundle 这是二进制的安装文件 而 tar.gz 这类的只是压缩包(相当于 .rar,.zip 压缩包一样),如果此类文件是程序的话,得先解压. 用户手动选择安装目录是不必要的.这一套系统更了解什么软件应该放什么地方,根本不用操心,事实上安装时也不没有提示安装目录通常情况下,linux 会这样放软件的组件:程序文档: /usr/share/d…
从此步骤开始,我们正式安装oracle软件: ① 以oracle用户登录图形界面,执行/home/oracle/database/runInstaller,进入OUI的图形安装界面: ② 进入OUI安装界面后,选择第3项,跳过软件更新,Next: ③ 选择第2项,只安装oracle软件,Next: ④ 选择第2项,安装oracle RAC,选择所有节点,Next: ⑤ 语言选择默认,English,Next: ⑥ 选择第1项,安装企业版软件,Next: ⑦ 选择oracle软件的安装路径,其中O…
<1>在linux下如何判断是否已经安装某个软件? ++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++ rpm -qa|grep 软件包 ++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++ <2>linux下如何查看某个软件安装在哪个目录啊? ++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++ rpm -ql 软件名 ++++++++++++++++++++++++++++++++…
Objectives: •Describe your role as a database administrator (DBA) and explain typical tasks and tools The approach for designing, implementing, and maintaining an Oracle database involves the following tasks:1. Evaluating the database server hardware…
CentOS5.6下安装Oracle10G ******************************************************************************** *目标:在Centos系统下,安装Oracle10g软件 *步骤: *                1.安装包 *                2.域名解析设置及网络配置 *                3.创建用户.组 *                4.配置内核參数.改动环境变量…
昨天.使用openfiler创建nas存储系统,安装oracle软件,在所有正面最好,要创建一个数据库时报ora错,原来使用nfs安装oracle数据库,mount选项有特殊要求,如以下.以备查: RAC In the table below Binaries is the shared mount points where the Oracle Home and CRS_HOME is installed. Datafiles includes Online Logs, Controlfile…
Linux下Oracle11G RAC报错:在安装oracle软件时报file notfound一例 1.现象 之前安装一切都比較顺利,安装oracle软件时,进度到30%时报错:file not found(/u01/app/oracle/product/11.2.0/db_1/owb/external/oc4j_applications/applications/WFMLRSVCApp.ear) 2.应对策略 1.  改变选择语言处.仅仅选择"English": 2.  又一次解压…
在安装数据库软件时,只能检测到一个节点 650) this.width=650;" title="捕获.JPG" src="http://s3.51cto.com/wyfs02/M01/76/D3/wKioL1ZdRL_wD9pLAAFQ3jz4EPI185.jpg" alt="wKioL1ZdRL_wD9pLAAFQ3jz4EPI185.jpg" /> 解决办法:重启rac1节点…
在上一篇我们在本地的虚拟服务器上安装好CentOS7后,我们的python web服务.自定义的python service或python脚本需要在服务器上运行,还需要在服务器安装各种相关的软件才行,一般来说,想要实现自动化部署需求,还需要安装nginx.svn.uwsgi.python3.0(系统自带python2.7.5).supervisor.postgresql.pgbouncer.redis(nosql缓存根据自己代码的需要而定). PS:本人不是专业的运维,只能根据自己的研究弄弄单机…
vs2015 制作安装包额外需要安装的软件VSI_bundle 下载地址:http://files.cnblogs.com/files/sdner/VSI_bundle.rar…
来自:http://tech.v01.cn/Linuxchangjianwenti/changyongruanjiananzhuangyucao/2012/0119/70.html 一.使用yum安装和卸载软件,有个前提是yum安装的软件包都是rpm格式的. 安装的命令是,yum install ~,yum会查询数据库,有无这一软件包,如果有,则检查其依赖冲突关系,如果没有依赖冲突,那么最好,下载安装;如果有,则会给出提示,询问是否要同时安装依赖,或删除冲突的包,你可以自己作出判断: 删除的命令…
1. 工具包下载地址: Python下载地址: https://www.python.org/downloads/ pip下载地址:https://pypi.org/project/pip/#files Pygame下载地址: pygame-1.9.2-cp35-cp35m-win_amd64.whl 2. 下载的三个文件,看图片,注意解压的文件是否和下载的文件是否一样的 3. Python的安装 安装成功 打开python,安装成功的界面 4.  安装pip软件 切换到pip软件包的目录,记得…
安装截图软件 1.下载安装python-xlib apt-get install python-xlib 2.下载截图软件包 wget http://packages.linuxdeepin.com/deepin/pool/main/d/deepin-scrot/deepin-scrot_2.0-0deepin_all.deb 3.安装软件包 dpkg -i deepin-scrot* 安装不成功可能是需要很多依赖,通过强制执行安装依赖命令 4.下强制安装依赖包 apt-get -f insta…