这个时代的生信,统计遗传,不懂或不会用这个数据库就说不过去了. 看看10年GWAS里是如何定位和评价UK biobank的: For the near future, the UK Biobank is pushing the barriers further by releasing both genome-wide genotypes and rich phenotypic data on 500,000 people to the international research commun…
Genome-wide gene-environment analyses of depression and reported lifetime traumatic experiences in UK Biobank 全基因组的,基因环境分析,抑郁症和已经报道的终身创伤经历,UKBB Depression is more frequently observed among individuals exposed to traumatic events. The relationship bet…
今天碰到一个问题,就是从UK biobank下载下来的gwas result file是filename.tsv.bgz格式.这东西需要解压才能阅历,可是用zip或者rar都是搞不定,网上搜了一圈,说用zcat解压,可是找不到zcat.于是就上Google上面搜了一圈,尝试了用R语言的R.utils包解压读取数据,但是数据太大,电脑动不了.最后发一下比较可行的办法,就是用linux系统. 第一步,直接进入linux系统,打开文件所在文件夹,打开指令输入框"Ctrl+Alt+T"或者右键…
参考: Hail Hail - Tutorial windows也可以安装:Spark在Windows下的环境搭建 spark-2.2.0-bin-hadoop2.7 - Hail依赖的平台,并行处理 google cloud platform - 云平台 Broad's data cluster set-up tool 对Google cloud SDK的一个简单的wrap,方便操作. cloudtools is a small collection of command line tool…
相关文章: A Unified Framework for Association Analysis with Multiple Related Phenotypes 太重要了,不得不单独拿出来分析一下.本review高度总结了GWAS这10年的成绩.以及现在的局限性.每个搞统计遗传的都必须要好好看看. 第一篇GWAS是什么时候?谁提出的?The first successful GWAS published in 2002 studied myocardial infarction. Ozak…
打算专题训练下DP,做一道帖一道吧~~现在的代码风格完全变了~~大概是懒了.所以.将就着看吧~哈哈 Description The aspiring Roy the Robber has seen a lot of American movies, and knows that the bad guys usually gets caught in the end, often because they become too greedy. He has decided to work in t…
在javascript中,函数可看作是一种数据,可以赋值给变量,可以嵌套在另一个函数中. var fun = function(){ console.log("平底斜"); } function fun(){ var n=10; function son(){ n++; } son(); console.log(n); } fun(); //11 fun(); //11 我们把上面第二段代码稍微修改下: var n=10; function fun(){ function son(){…
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