DNA repair - HDU 2457(自动机+dp)】的更多相关文章

题意:给你几个模式串,问你主串最少改几个字符能够使主串不包含模式串 思路:从昨天中午开始研究,研究到现在终于看懂了.既然是多模匹配,我们是要用到AC自动机的.我们把主串放到AC自动机上跑,并保证不出现模式串,这里对AC自动机的创建有所改动,我们需要修改不存在但是符合要求的节点,如果某节点的某一子节点不存在,我们就把这个子节点指向他父辈节点存在的该节点(比如k->next[1]不存在,k->fail->next[1]存在,我们就把他改为k->next[1] = k->fail-…
DNA repair Time Limit: 5000/2000 MS (Java/Others)    Memory Limit: 32768/32768 K (Java/Others)Total Submission(s): 940    Accepted Submission(s): 500 Problem Description Biologists finally invent techniques of repairing DNA that contains segments cau…
DNA repair Time Limit: 2000MS Memory Limit: 65536KB 64bit IO Format: %I64d & %I64u Description Biologists finally invent techniques of repairing DNA that contains segments causing kinds of inherited diseases. For the sake of simplicity, a DNA is repr…
题目一串DNA最少需要修改几个基因使其不包含一些致病DNA片段. 这道题应该是AC自动机+DP的入门题了,有POJ2778基础不难写出来. dp[i][j]表示原DNA前i位(在AC自动机上转移i步)且后缀状态为AC自动机结点j的最少需要修改的基因数 转移我为人人型,从dp[i][j]向ATCG四个方向转移到dp[i+1][j'],如果结点被标记包含致病基因就不能转移. #include<cstdio> #include<cstring> #include<queue>…
题目大意:给你N个DNA的串,也就是至包含'A','T','G','C'四种碱基的,这些给定的串都是带有遗传病的,然后给你一个不会超过1000的串,问你至少几个地方才能让这个串不包含遗传病,如果不论怎么修改都没用,输出'-1'   分析:用dp[Ni][nNode],表示长度为i时候到达第n个节点修改的最小次数,然后统计最后一层次最小次数就行了.   代码如下: ===================================================================…
题意: 给你N个模板串,并且给你一个文本串, 现在问你这个文本串最少需要改变几个字符才能使得它不包含任何模板串. (以上字符只由A,T,G,C构成) 题解: 刚开始做这一题的时候表示很懵逼,好像没有学过这种类型的问题. 后面仔细想想,在之前的题目中,学会了求出不包含任何模板串的方案数. 这题可以转化下,求出所有不包含任何模板串的方案中与原串最少的不同数目. 根据这个DP dp[i][j] 表示走到长度为 i 的时候,在AC自动机 j 这个节点上最多与原串不同的个数. 然后这题就变成SB题了. #…
题意: 生物课上我们学到,DNA序列中只有A, C, T和G四种片段. 经科学发现,DNA序列中,包含某些片段会产生不好的基因,如片段"ATC"是不好片段,则"AGATCC", "CATCAA", "ATCATC"都是不好的DNA序列,这些不好片段我们可以称为病毒片段. 现在已知m个病毒片段, 然后给定一个DNA串,问如果使用最少的修改(将DNA中的某个字母,变为其他字母,比如A变T,但变的字母也只能是"ACTG&q…
题意:给n个病毒DNA序列,再给一个DNA序列,问该序列至少修改多少个碱基能不含任何病毒DNA.病毒DNA序列一共不超过1000,询问的DNA长度不超过1000. 题解:DP:d[l][p]表示询问到第l位.当前在AC自动机上的位置为p时的最少修改数,用d[l][p]推d[l+1][x].本来打的是递归,结果递归死循环了..于是改成递推了. 不想清楚的话递归真的好容易死掉TAT //poj3691 #include<cstdio> #include<cstdlib> #includ…
传送门 AC自动机加DP就不说了 注意到 m <= 10,所以模式串很少. 而 n 很大就需要 log 的算法,很容易想到矩阵. 但是该怎么构建? 还是矩阵 A(i,j) = ∑A(i,k) * A(k,j),那么i到j的方案数就是j到k的方案数称k到j的方案数,那么直接矩阵快速幂即可 #include <queue> #include <cstdio> #include <cstring> #define N 100001 #define p 100000 #d…
链接 从开始节点往下走,不能走到病毒节点,如果当前状态与原始串不一样就+1,取一个最小值. #include <iostream> #include<cstdio> #include<cstring> #include<algorithm> #include<stdlib.h> #include<vector> #include<cmath> #include<queue> #include<set>…