昨天去北大生命科学院听了一场魏文胜教授关于基因方面的讲座.会场人不算太多,比起上次听城市规划,场面略显冷清.也能从一个侧面反映,关注基础科学领域的人虽然有,但是不是很多. 开场魏教授用了宣传海报作为导引,癌症可以被攻克吗,HIV有方法抑制吗.目前来说,还是做不到. 从这里他引出了最近三十年关于基因方面的国际层面的研究成果.虽然基因编辑的概念大概已经有三四十年了,但是最近两年有一些突破性的研究成果,还是非常值得欣慰的. 他提到,去年奥巴马提出的精准医疗计划(http://www.biomart.c…
微软发布云端基因服务:推动AI驱动的精准医疗 2018年03月07日 00:00:00 微软研究院AI头条 阅读数:117    版权声明:本文为博主原创文章,未经博主允许不得转载. https://blog.csdn.net/Y2c8YpZC15p/article/details/79479171 编者按:儿童癌症是很多研究者十分关注的问题,对相关数据的利用和处理无疑是解决问题的关键. 近日,微软宣布推出Microsoft Genomics服务,该服务通过帮助研究者利用和处理基因数据来取得治疗…
2007年,一家酸奶公司发现一种细菌拥有抵御病毒的特殊防御机制.2012年,细菌的这种机制就被科学家阐述清楚,2013年这一领域快速增长.它被视为分子生物学的一个奇迹,事实上,它并非仅对生物学家产生革命的影响,这个世界同样也会随之而改变.这就是基于CRISPR系统的基因编辑技术. 早在2012年和2013年,<科学>杂志就已将CRISPR纳入到年度10大科学发现的榜单中,不过它属于陪跑"角色".随着近些年来一系列的重要科学发现,CRISPR基因编辑技术备受注目,其中最重要的…
作为天池上的新手,第一次参加天池阿里云线上的比赛,糖尿病预测, 一般的数据挖掘比赛,流程:数据清洗,特征工程(找特征,特征组合),不断的尝试的不同算法,不断调参,也可以考虑将多个模型进行线性组合 大赛初赛数据共包含两个文件,训练文件d_train.csv和测试文件d_test.csv,每个文件第一行是字段名,之后每一行代表一个个体.文件共包含42个字段,包含数值型.字符型.日期型等众多数据类型,部分字段内容在部分人群中有缺失,其中第一列为个体ID号.训练文件的最后一列为标签列,既需要预测的目标血…
编程界的新宠 Julia 发布 1.0 正式版本,多种优势集于一身2018-08-14 14:14 公司Julia 的累积下载次数超过 200 万,已被应用于自动驾驶汽车.机器人.3D 打印.精准医疗.增强现实.基因组学.能源交易.机器学习.金融风控和太空任务设计等多个领域. 此次 Julia 1.0 版本的发布,更是将商业用户越来越看重的稳定性与原有的快速.高生产力的特性结合起来,足以媲美 Python,R,C++和 Java 等编程语言. 众多来自科技.咨询和金融等行业的公司都有采用 Jul…
生物医学大数据 精准医疗 研发药物:特异性靶点&过表达靶点 Encode &roadmap找组织特异性的表观遗传学标记.TF.DNA甲基化的动态变化等信息. 生物大数据的标准化与整合----降维分析---聚类和功能分析----多组学----结合临床病理分型----生物信息学可视化分析(描述&预测) Regulation network:Multiple&dynamic&balance 单细胞测序:single-cell RNA-seq 大数据应用:将基础研究与临床医…
基因测序,作为“下一个能够改变世界”的技术,已经由实验室研究演变到临床使用,为人类预测罹患多种疾病的可能性,提前预防和治疗疾病提供了一套可靠的方法和手段.而基于基因测序在预防和治疗疾病方面的准确和可靠,基因测序也因此成为了精准医疗的基础.据预测,基因测序市场未来五年复合增长率在35%左右,2022年有望突破300亿美元. 基因测序的难题 然而,虽然基因测序市场火爆异常,但实际上,对于基因测序厂商来说,目前面临着很多的困难和挑战,具体而言,最主要的就是成本高.效率低.门槛高. 成本高 所谓成本高,…
摘要: 一家大型基因测序功能公司每日会产生 10TB 到 100TB 的下机数据,大数据生信分析平台需要达到 PB 级别的数据处理能力.这背后是生物科技和计算机科技的双向支撑:测序应用从科研逐步走向临床应用,计算模式从离线向在线演进,交付效率越来越重要. 作者李鹏,原文首发于InfoQ,<容器混合云,Kubernetes 助力基因分析> 引言 James Watson 和 Francis Crick 于 1953 年发现了 DNA 的双螺旋结构,从此揭开了物种进化和遗传的神秘面纱,开启了人类对…
生物信息学 Sanger采用链终止法进行测序 带有荧光基团的ddXTP+其他四种普通的脱氧核苷酸放入同一个培养皿中,例如带有荧光基团的ddATP+普通的脱氧核苷酸A.T.C.G放入同一个培养皿,以此类推,存在4种不同类型碱基的识别机制,同时,该ddXTP一旦结合在互补链上则会迫使复制停止. 高通量测序是二代测序,先建库后测序: 建库方法: 单末端测序:将DNA双链打碎并接上接头序列,通过改变条件使双链变单链,将待测的单链固定在flowcell上,再加入游离的脱氧核苷酸,采用边合成边测序方法比配并…
10月7日,诺贝尔化学奖颁给了法国美国生物学家Jennifer Doudna和生物化学家Emmanuelle Charpentier,以表彰她们对新一代基因技术CRISPR的贡献,全网沸腾. CRISPR-Cas9又被称为"基因魔剪"的革命性技术,它的诞生,不仅是对基因技术的提高,同时也可能修改生命的说明书. 关于基因魔剪的出现,生物科技公司Techme INC(公司编号:20151524696 )对此作出了解读.Techme INC在2015年成立,是美国一家创新的生物科技公司,专注…
CRISPR/Cas9基因敲除原理及实验建议   CRISPR Cas9已经成为了最受欢迎的基因编辑技术之一,在2016年的国自然基金中也有很多项目是关于 CRISPR Cas9的.目前在市场上已经有很多Cas9的基因敲除试剂盒,这些试剂盒的操作流程较为简单,客户可让公司直接帮忙设计gRNA,乃至最后的载体验证全包.公司会根据您的要求收取不同的费用,如果只是合成载体,不验证,那么会便宜些.如果要合成载体同时又验证,那么价格又会贵一些.下面是对Cas9基因敲除试剂盒的一个详细说明,我们可以从中了解…
Nature Biotechnology:人类基因研究走近平民 数据是基础解读更重要 5万美元可以做什么?最近,美国斯坦福大学教授斯蒂芬·夸克在国际著名学术期刊<自然·生物技术>发表论文宣布,只用3个人.4周.1台已经上市的仪器,花费不到5万美元,就绘制出了自己的全基因组图谱.虽然价格还有些高,但比起去年的25万美金,显然离走近平民,又近了一大步. 5万美元可以做什么?最近,美国斯坦福大学教授斯蒂芬·夸克在国际著名学术期刊<自然·生物技术>发表论文宣布,只用3个人.4周.1台已经上…
目录 说明 1.前言 2.植物GS瓶颈 3.提高GS预测的准确性 4.GS与现代育种技术结合 5.GS开源育种网络 说明 Enhancing Genetic Gain through Genomic Selection: From Livestock to Plants 这篇是徐云碧老师2019年发表在<Plant Communications>上的综述.徐老师是农科院作科所以及CIMMYT的分子育种专家,著有<分子数量遗传学>和<分子植物育种>,提出环境型.遗传增益等…
单细胞测序技术(single cell sequencing) 2018-03-02 11:02   来源: 一呼百诺  点击次数:6587关键词:   前言 单细胞生物学最近几年是非常热门的研究方向.在这一领域中,最前沿的则是单细胞测序技术.传统测序方法一次处理成千上万个细胞,得到的变异水平也是成千上万个细胞的平均后水平.但是,就如同世界上没有完全相同的两片树叶一样,没有两个细胞是完全相同的.所以,单细胞测序对于研究单个细胞就显得至关重要. 单细胞测序可以揭示出每个细胞独特的微妙变化,甚至可以…
耳熟能详的人工智能   深蓝Deep Blue是美国IBM公司生产的一台超级国际象棋电脑,重1270公斤,有32个大脑(微处理器),每秒钟可以计算2亿步."深蓝”输入了一百多年来优秀棋手的对局两百多万局.   Siri是一款内建在苹果iOS系统中的人工智能助理软件.此软件使用自然语言处理技术,使用者可以使用自然的对话与手机进行互动,完成搜寻资料.查询天气.设定手机日历.设定闹铃等许多服务. 在全球四大语音助手中,微软的Cortana和苹果Siri目前处于落后水平,谷歌助手和亚马逊Alexa已经进…
1. 纪录片:非自然选择 1.1 CRISPR-Cas9的出现 1.2 故事1:先天性基因缺陷而失明的小孩 1.3 故事2:基因变异的蚊子 1.4 基因技术应用的现状 1.5 担忧 2. CRISPR基因编辑 2.1 Cas9 2.2 Cas12a(以前称为Cpf1) 2.3 Cas9与Cpf1 2.4 Anti-CRISPR 2.5 CRISPR/Cas工具 3. 基因敲除 4. DNA,RNA,染色体,基因,蛋白质 4.1 概念 4.2 DNA和RNA 4.3 物质关系: 4.4 功能关系:…
HTML基础 HTML不分大小写 1.HTML概述 HTML(HyperText MarkUp Language)"超文本标记语言",他是制作网页的标准语言 1.1 标签--元素 由尖括号包围,比如<title>,通常是成对出现 例如:<title>  百度一下,你就知道  </title> 开始标签                  内容                 结束标签 单独出现的标签:<img   />     图片标签单独…
日前,中国科学院神经科学研究所.中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心.香港科技大学生命科学部和分子神经科学国家重点实验室.中国科技大学自动化研究所在 Cell 上联合发表了一篇概述论文<China Brain Project: Basic Neuroscience, Brain Diseases, and Brain-Inspired Computing>,介绍了「中国脑计划」在基础神经科学.脑疾病和脑启发计算上的研究进展.机器之心对这篇论文进行了完整的编译,读者也可通过以下链接查看原论文.…
目的:如题所示.   那么先试试拷贝一段网页内容,发布后观察各种格式的显示效果如何. 下面的文字来自中国网新闻,地址是http://news.china.com.cn/2015-10/23/content_36870305.htm 大数据时代来临"得数据者得天下"成全球普遍共识 发布时间: 2015-10-23 09:04:19 | 来源: 中国网 | 作者: 张艳玲 | 责任编辑: 肖冰  10月19日,中国行政体制改革研究会.人民出版社举办的"大数据和国家治理现代化&qu…
欢迎大家前往腾讯云社区,获取更多腾讯海量技术实践干货哦~ 张钦坤 腾讯研究院秘书长蔡雄山 腾讯研究院法律研究中心副主任祝林华 腾讯研究院法律研究中心助理研究员曹建峰 腾讯研究院法律研究中心高级研究员 相关推荐:AI 新技术革命将如何重塑就业和全球化格局?深度解读 UN 报告 (中篇)AI 新技术革命将如何重塑就业和全球化格局?深度解读 UN 报告 (下篇) 中国<新一代人工智能发展规划>开篇即表明,人工智能的迅速发展将深刻改变人类社会生活.改变世界.诚然,被视为一种变革性技术的人工智能,有望成…
https://www.jianshu.com/p/6284f57664b9 目前对于variant进行注释的软件主要有4个: Annovar, SnpEff, VEP(variant Effect Predictor), Oncotator, 选择合适的软件注释variants对于下游分析是很关键的, 今天我们来比较下这4种软件在variants 注释上的差异,进而帮助我们选择更合适的注释软件. 首先简要介绍下这4个软件的一些特点: Oncotator: 主要用于癌症特异性突变位点的注释,下面…
超级技术:改变未来社会和商业的技术趋势 多位专家或经济学人编辑关于未来的预测,梅琳达·盖茨写了其中一章.在同类书中属于水平比较高的,专家只写自己熟悉的领域,分析与预测有理有据而不仅仅是畅想性质. 以下是书中一些内容的摘抄,#号后面是kindle电子书中的页码: 1:有人说,新技术将会给世界带来和平,因为沟通能够消除隔阂.团结所有人.这听起来像是20世纪90年代互联网的故事,实际上,却是19世纪中期电报的故事,被人们称为“思想大道”.#159 2:人们经常担心新发明会侵犯他们的隐私.19世纪80年…
CBC2019-day1 25 August 2019 on 学术前沿huyujia 8月24日上午,CBC2019正式开幕.主持人首先对大会情况以及与会嘉宾做了简要介绍:紧接着,校领导.大会主席以及CCF专委工委委员致辞:与会来宾合照之后,会议正式开始.特邀报告来自中科院上海马普计算生物学研究所的研究员兼首席科学家李亦学教授带来了题为“肝癌的生物信息学以及多组学研究”的精彩报告.生命科学和医学进入了大数据驱动的颠覆性变革时代,生物医学大数据的来源与类型更是丰富多样.在这样的数据驱动下,教授向我…
可打电话的 2G.能够上网的 3G.满足移动互联网用户需求的 4G 相比,逐步可以商用的 5G 在多重性能上更胜一筹,如 高数据率: 低延迟: 更节能: 有效地降低通信成本: 具备更高的系统容量: 更可靠的连接: 平均下载速度 1GBps,最高 20GBps ...... 物联网: 智慧城市 从垃圾管理.交通监控到逐渐智能化的医疗设施. 自动驾驶汽车 未来,自动驾驶将是人工智能.物联网相结合发展的一个重要方向. 医疗保健 随着各种医疗设备成为物联网应用的一环,医疗领域的服务也将得到改善. 物流…
封面: 中国人工智能学会重磅发布 <2018 人工智能产业创新评估白皮书> < 2018 人工智能产业创新评估白皮书>由中国人工智能学会.国家工信安全中心.华夏幸福产业研究院.思保环球联合发布. 白皮书聚焦人工智能的使能技术与应用场景两个层面,基于论文.专利.人才.行业壁垒等多个维度,创新性地构建了人工智能产业创新评估体系,客观评价了当前人工智能产业的创新发展水平,为政府.企业.投资机构布局人工智能提供了借鉴和参考. 研究范围和评价体系随着人工智能迎来第三次发展浪潮,在全球主要国家…
原创: 灵魂工作室 速石科技 我猜,我们是最早和你说春天来了的人. 一年前,我们还在小心谨慎地定义着Cloud HPC,一脸娇羞地拿Novartis 诺华制药在5年前做的案例当作标杆. 不久前,Hyperion Research正式宣布2019年是Cloud HPC的转折年. 暴风哭泣,云端高性能计算终于有了姓名. HPC:HighPerformance Computing高性能计算,换句话说,对算力要求高 这一年,我们帮不少用户落地了云端算力解决方案.像我们老板说的,对用户来说,最重要的是提供…
生物医疗大数据 安吉丽娜朱莉发现抑癌基因事件,BRCA突变与乳腺癌关联. 个体化测序商品23 and me 多组学数据研究:eg:太空和地球双胞胎发现生化指标差不多. 研究模式和工业模式相结合. 研究模式: 工业模式: 热点:量子计算其实没有研究成果. 未来方向: 传染病预警的技术,eg:flu tracking 抗生素危机 自免疫挑战 微生物群落和健康.eg:iHMP 新生儿/早产儿微生物群落失调,导致慢性疾病,可以使用移植的方法治疗. Cancer:eg:CAR-T 健康的衰老:衰老的迹象…
概念 利用蛋白质组学数据,结合基因组数据(DNA).转录组数据(RNA)来研究基因组注释问题,被称为蛋白质基因组学."蛋白质基因组学"一词由Jaffe 等于2004 年首次提出,作者采用串联质谱数据匹配DNA翻译得到氨基酸序列的方法,在仅有810 kb 大小的细菌基因组上直接鉴定开放阅读框(open reading frame,ORF),验证并补充.修订了约10%的ORF.后来这种质谱数据结合DNA 和RNA 数据的分析方法被应用到注释病毒基因组.原核生物基因组以及真核生物基因组. 本…
如果想取出面包屑导航的url那么就必须在model层里面进行多取一个了: <?php namespace Home\Model; use Think\Model; class CategoryModel extends Model{ public function getparent($cateid){ $res = array(); //循环找出当前栏目的信息,如果为0退出循环 while($cateid){ $cates = $this -> where("cate_id=$ca…
2016年12月8日-10日,由中国计算机学会(CCF)主办,CCF大数据专家委员会承办,中国科学院计算技术研究所和CSDN共同协办的2016中国大数据技术大会(Big Data Technology Conference 2015,BDTC 2016)将在北京新云南皇冠假日酒店隆重举办. 图片描述 中国大数据技术大会(BDTC)的前身是Hadoop中国云计算大会(Hadoop in China,HiC).从2008年仅60余人参加的技术沙龙到当下数千人的技术盛宴,目前已成为国内最具影响力.规模…