1.下载安装bcftools. 2.准备样本ID文件,这里命名为samplelistname.txt,一个样本一行,如下所示: sample1 sample2 sample3 3.输入命令: bcftools view -S samplelistname.txt /1000genomes/ALL.chr16.phase3_shapeit2_mvncall_integrated_v5a.20130502.genotypes.vcf.gz -Ov > samplelist_1000Genomes.v

org.apache.tika.sax.WriteOutContentHandler$WriteLimitReachedException: Your document contained more than 100000 characters, and so your requested limit has been reached. To receive the full text of the document, increase your limit. (Text up to the l

java 反射提取类信息, 动态代理 和过滤某些方法演示 package org.rui.classts.reflects; import java.lang.reflect.Constructor; import java.lang.reflect.Method; import java.util.regex.Pattern; /** * 提取 类的 方法 构造器 * @author lenovo * */ //{args:ShowMethods} //查看一个类的全部方法和构造器 publi

论文系统Step1:从日志记录中提取特定信息 前言 论文数据需要,需要实现从服务器日志中提取出用户的特定交互行为信息.日志内容如下: 自己需要获取"请求数据包一行的信息"及"OUTSTR"下一行的信息. 思路 考虑使用正则表达式提取特定信息. 示例代码: Pattern pattern = Pattern.compile("请求数据包信息:\"(.+?)\""); Matcher matcher = pattern.match

写了2个脚本,分别是v1版本和v2版本 都是python调用mediainfo工具提取视频元数据信息 v1版本是使用pycharm中测试运行的,指定了视频路径 v2版本是最终交付给运营运行的,会把v2版本打成exe运行 先看v1版本 import os,subprocess,json,re,locale,sys import xlwt,time,shutil #获取当前文件所在绝对目录路径 # this_path=os.path.abspath('.') # print('当前路径为----',

JDBC程序优化--提取配置信息放到属性文件中 此处仅仅优化JDBC连接部分,代码如下: public class ConnectionFactory { private static String driver; private static String dburl; private static String user; private static String password; private static final ConnectionFactory factory=new Co

public function tt(){ $param = array( array ( 'hykno' => '2222222-CB', 'tcdk_fid' => '458B6D70-FB7F-47AE-8356-777777777777', ', 'offsetamount' => '90.0', ', 'hysyamout' => '10.0', ', ), array ( 'hykno' => '2222222-CB', 'tcdk_fid' => '458

说明: ①Elm格式: PLMD ID    Uniprot Accession    Position     Type     Sequence   Species    PMIDsPlMD编号 Uniprot数据库编号         位点 翻译后修饰类型 序列信息 物种 PMID PLMD-1   O00115     52     Ubiquitination  MIPLLLAALLCVPAGALTC Homo sapiens   21963094;23266961 ②代码说明:从上述

从APNIC提取IP信息 https://blog.csdn.net/nullzeng/article/details/17538009 Apnic介绍简而言之,Apnic是全球5个地区级的Internet注册机构(RIR)之一,负责亚太地区的以下一些事务:(1)分配IPv4和IPv6地址空间,AS号(2)为亚太地区维护Whois数据库(3)反向DNS指派(4)在全球范围内作为亚太地区的Internet社区的代表更详细的Apnic介绍文档请参见:http://www.apnic.net/abou

前一阵子我们介绍了如何启动Scrapy项目以及关于Scrapy爬虫的一些小技巧介绍,没来得及上车的小伙伴可以戳这些文章: 手把手教你如何新建scrapy爬虫框架的第一个项目(上) 手把手教你如何新建scrapy爬虫框架的第一个项目(下) 关于Scrapy爬虫项目运行和调试的小技巧(上篇) 关于Scrapy爬虫项目运行和调试的小技巧(下篇) 今天我们将介绍在Scrapy中如何利用Xpath选择器从HTML中提取目标信息.在Scrapy中,其提供了两种数据提取的方式,一种是Xpath选择器,一种是C

正则匹配汉字提取其它信息剔除demo <?php //提取字符串中的汉字其余信息剔除 $str='te,st 测 .试,.,.?!::·…~&@#,.?!:;.……-&@#“”‘’〝 "〞＇´＇><﹞﹝><><][)(()[] - 1234456789'; preg_match_all('/[\x{4e00}-\x{9fff}]+/u', $str, $matches_one);//只要汉字 preg_match_all('/[a-zA

前言 今天这篇博文有点意思,它是从一个例子出发,从而体现出在编程中的种种细节和一些知识点的运用.和从前一样,我是人,离成神还有几十万里,所以无可避免的出现不严谨的地方甚至错误,请酌情阅读. 0x00 首先,题目是:读取一个位图文件(xxx.bmp),然后读取前30个字节,从这前三十个字节中提取一些信息. 这里有一些知识要先知道:一个位图的前30位有什么? BMP格式采用小端方式存储数据,文件头的结构按顺序如下: 前两个字节:'BM'表示Windows位图,'BA'表示OS/2位图: 一个4字节整

提取注解信息 使用注解修饰了类.方法.成员变量等成员之后,这些注解不会自己生效,必须由开发者提供相应工具来提取并处理注解信息.   Java使用java.lang.annotation.Annotation接口代表程序元素前面的注解,该接口是所有注解的父接口.Java5在java.lang.reflect包下新增了AnnotatedElement接口,该接口代表程序中可以接受注解程序元素(就是哪些类可以被注解修饰).该接口主要有如下几个实现类. Class: 类定义 Constructor: 构

1.CK+动态表情库介绍 The Extended Cohn-Kanade Dataset(CK+) 下载地址 这个数据库是在 Cohn-Kanade Dataset 的基础上扩展来的,发布于2010年.这个数据库比起JAFFE 要大的多.而且也可以免费获取,包含表情的label和Action Units 的label. 这个数据库包括123个subjects, 593 个 image sequence,每个image sequence的最后一张 Frame 都有action units 的la

一.准备工作: 回到之前SimpleH264Analyzer程序,找到SPS信息,并对其做解析 调整项目目录结构: 修改Global.h文件中代码,添加新数据类型UINT16,之前编写的工程中,UINT8和UINT32都为小写表示,为了更符合编程规范,将其改为全大写(可使用ctrl+H在整个解决方案内进行替换). typedef unsigned char UINT8; typedef unsigned short UINT16; typedef unsigned int UINT32; 之后编

做群体变异检测后,通常会有提取子集的操作,之前没有发现bcftools有这个功能,都是自己写脚本操作,数据量一上来,速度真的是让人无语凝噎.这里记录下提取子vcf文件的用法,软件版本:bcftools-1.5 一.根据个体提取子集 根据样品名提取vcf文件,准备要保留的个体名文件 keep.list,一行一个个体(参考第三步). 无痛处理,速度超快,命令如下: 1 bcftools view -S keep.list test.vcf >sub_indv.vcf 二.根据染色体位置提取子集 注意

网上也有很多的资料,讲述怎么提取肤色的,大致有5种方法.这几种方法转载http://blog.csdn.net/augusdi/article/details/8865275 第一种:RGB color space 第二种:RG color space 第三种:Ycrcb之cr分量+otsu阈值化 第四种:YCrCb中133<=Cr<=173 77<=Cb<=127 第五种:HSV中 7<H<29 我来讲述一下提取肤色的原理. 这几种方法都不外乎一种操作,首先将图像的各

1 BeautifulSoup概述 beautifulSoup是勇python语言编写的一个HTML/XML的解析器,它可以很好地处理不规范标记并将其生成剖析树(parse tree): 它提供简单而又常见的导航(navigating),搜索及修改剖析树,此可以大大节省编程时间 2 BeautifulSoup安装 2.1 安装 pip install beautifuilsoup4 当安装不成功时,首先查看windows的命令提示符是否是以管理员身份打开的. 然后再检查其他因素 2.2 使用 f

一.背景 获取数据中以“|”作为字段间的分隔符,但个别字段中数据也是以“|”作为分隔符.因此,在字段提取时需要保护数据完整性. 二.实现 1.数据以“|”分隔,可以采用递归方式迭代解析.通过尾递归方式降低运行风险: 2.尾递归中使用模式匹配: 3.解析时,根据separator做遍历,“‘”和“’”(一对引号之间的数据作为一个整体cell),引号前数据位head(即使为空,也可以),cell后的数据由下一次迭代解析,则整个结构为:result+head+cell(引号间的数据)+(head+ce

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