MEME(Motif-based sequence analysis tools)使用说明 2011-05-27 ~ ADMIN MEME是用于从一堆序列中搜索功能结构域的工具.比如说当你拿到了许多CHIP-chip或者CHIP-seq的数据,当分析出峰所处的位置之后可以得到一些这些峰所代表的序列,这就是蛋白质与DNA相到作用所保护下来的片段.所以使用MEME搜索其中非常相似的序列片段就可能是有一定功能的结构域. 所以,MEME的输入必须至少有一个Pearson/FASTA格式的序列文件. 命令

关于前端和后端的解释 详细链接见:http://wiki.ubuntu.org.cn/Qref/Apps Linux下程序通常不需要作为一个整体,而是模块化,于是有了可选的前端和后端——这种情况下:前端可以搭配不同后端,后端也可以搭配不同前端.前端(界面):图形和命令均可后端(执行) [编辑]工具 [编辑]输入法平台 每个输入法平台都能加装很多种类输入法引擎sunpinyin rime 等.输入法(如二笔.五笔.拼音)   IBus 官网 (K)Ubuntu 9.10之后预设输入法平台,为取代停

          题记:毕业一年多天天coding,好久没写paper了.在这动荡的日子里,也希望写点东西让自己静一静.恰好前段时间用python做了一点时间序列方面的东西,有一丁点心得体会想和大家分享下.在此也要特别感谢顾志耐和散沙,让我喜欢上了python. 什么是时间序列 时间序列简单的说就是各时间点上形成的数值序列,时间序列分析就是通过观察历史数据预测未来的值.在这里需要强调一点的是,时间序列分析并不是关于时间的回归,它主要是研究自身的变化规律的(这里不考虑含外生变量的时间序列). 为

Finding Enriched Motifs in Genomic Regions (findMotifsGenome.pl) 在指定区域做motif enrichment,大大降低了假阳性. MEME也可以做,但是设定更加复杂. 转录因子的表达具有高度的组织特异性,而且已知的TF只有1000多个,基因有30000多个,所以一个TF的靶基因可能有几百个,而且具有高度的时空组织特异性. 实验的方法就不说了,可靠.成本高.耗费劳力. 以下只说高通量数据的预测方法. 最简单的预测就是基于基因表达,c

1 时间序列与时间序列分析 在生产和科学研究中,对某一个或者一组变量  进行观察测量,将在一系列时刻  所得到的离散数字组成的序列集合,称之为时间序列. 时间序列分析是根据系统观察得到的时间序列数据,通过曲线拟合和参数估计来建立数学模型的理论和方法.时间序列分析常用于国民宏观经济控制.市场潜力预测.气象预测.农作物害虫灾害预报等各个方面. 2 时间序列建模基本步骤 获取被观测系统时间序列数据: 对数据绘图,观测是否为平稳时间序列:对于非平稳时间序列要先进行d阶差分运算,化为平稳时间序列: 经过第

https://www.zhihu.com/topic/19582125/top-answershttps://wenku.baidu.com/search?word=spss&ie=utf-8&lm=0&od=0 SPSS 18.0由17个功能模组组成: Base System 基础程式 Advanced Models 高等统计模组(GEE/GLM/存活分析) Regression Models 进阶回归模组 Custom Tables 多变量表格 Forecasting 时间序

Minitab软件是现代质量管理统计的领先者,全球六西格玛实施的共同语言,以无可比拟的强大功能和简易的可视化操作深受广大质量学者和统计专家的青睐. MINITAB 功能菜单包括:基础和高级统计工具: 假设检验 (参数检验和非参数检验) 回归分析(一元回归和多元回归.线性回归和非线性回归) 方差分析(单因子.多因子.一般线性模型等) 时间序列分析 图表(散点图.点图.矩阵图.直方图.茎叶图.箱线图.概率图.概率分布图.边际图.矩阵图.单值图.饼图.区间图.Pareto.Fishbone.运行图等)

先看效果:截图1 截图2: 实现思路: 1.界面UI设计 2.功能点 : a 打开文件进行比较    b 粘贴内容进去比较   c 提示帮助  d 窗口可以任意拖动 3.文本比较算法  java类 : MainUI 类实现界面设计       Read_File 类实现文件读取      DNASequence 类文本比较算法   项目结构: 源代码: Star.java import javax.swing.text.BadLocationException; import javax.swi

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DBImport V3.7介绍: 1:先上图,再介绍亮点功能: 主要的升级功能为: 1:增加(Truncate Table)清表再插入功能: 清掉再插,可以保证两个库的数据一致,自己很喜欢这个功能. 2:信息栏增加红色部分: 黑色的信息太多,有时候错误信息被淹陌,分拆出来单独红色块标识错误信息,清晰一些. 3:增加保存所有的配置及配置还原: 之前只保存数据库链接的配置,为了第4点,包起了所有的配置,包括表名等. 4:增加自启动参数,用于定时功能的开机启动: 自启动参数为 - true 或 - 1

第0.1节 HTML5和桌面软件开发的碰撞 当我们谈论桌面软件开发技术的时候,你会想到什么?如果不对技术本身进行更为深入的探讨,在我的世界里,有这么多技术概念可以被罗列出来(请原谅我本质上是一个Windows程序员的事实). 操作系统 API.操作系统发展到今日,几乎桌面应用的所有功能,都是基于系统API构建的.调用API和语言及技术无关,哪怕是使用汇编.例如(代码来源于网络,本地重新编译): ;我的第一个win32汇编程序 ;一个经典的hello world !程序 ;>>>>&

一.公司简介山东森普信息技术有限公司(以下简称森普软件)是一家专门致力于移动互联网产品.企业管理软件定制开发的技术型企业.公司总部设在全国五大软件园之一的济南齐鲁软件园.森普SimPro是由Simple+Professional组成,代表着公司一直秉承"森普,专业让管理更简单"的核心理念,致力于为广大的企业.政府客户提供操作简单.功能全面.技术专业的各种信息化产品及技术咨询服务.公司自2003年成立以来培养出了一支高素质,高水平,高专业,经验丰富的IT团队,并通过ISO9001认证(证

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在信息爆炸时代,如何避免持续性信息过剩,使自己变得专注而不是被纷繁的信息所累?每天会看到各种各样的新闻,各种新潮的技术层出不穷,如何筛选出自己所关心的? 各位看官会想,我们是来看开源软件的,你给我扯什么信息干嘛,别着急,听我慢慢道来. 背景 浏览器收藏夹应该是我们在收藏文章.网站的第一个利器,平时遇到喜欢的网站或者文章很方便的收藏到收藏夹中:很快我们的收藏夹就满了,于是就像我这样,创建文件夹来分组两层.三层都有: 有的也会借助百度首页导航这样的一些功能来整理自己收藏的网站,以前我记得QQ还有一款

近年来,企业级软件开发市场暗流汹涌,呈现出多种态势.软件开发团队规模趋于小型化,工作方式趋于快捷化,超过半数的软件开发者在工作中会选择使用易用的软件开发工具.随着流程管理越来越受到企业的重视,流程开发亦成为近年来炽手可热的软件开发项目之一. 然而,以往的流程项目通常采用开源流程平台或纯代码开发,表面上减少了费用,实际总体成本更高,一般存在项目周期不可控,项目质量不可控,交付产品扩展性差,后期维护难度大等问题.如今,H3 BPM作为优秀的流程开发工具,为软件开发者提供了优秀的解决方案. 易学易用,

随着互联网+.中国制造2025.工业4.0等国家战略的支持与引导,企业在数字经济时代的信息化表现惊人,越来越多企业认识到,对于企业的发展来说,信息自动化远远还不够,企业的战略.业务和IT之间需保持高度一致,在苦练IT外功的同时,强化管理内功,才能大力提升企业运营效率与质量. 如何帮助企业提高管理质量与效率,被誉为架起了企业业务部门与IT部门之间的沟通桥梁的BPM的人气似乎越来越旺.然而,虽然BPM在世界500强企业中已占据半壁江山,国内BPM的市场份额仍不容乐观. BPM到底是哪路神仙 谈到BP

我是小林,一名普通的软件工程师,从事BPM(业务流程管理)软件开发工作.我没有几十年的技术底蕴,无法像大牛们一样高谈阔论,品评BPM开发之道:也不是资深的流程管理专家,能与大家分析流程管理的时弊.我只是一名有着一轮工作经历的软件开发者,更准确说是流程开发者,有那么几次特殊的经历,可以窥探一丝BPM开发的发展轨迹. 2004年,我初入软件行业.当时,国内BPM软件产品大多还处在概念阶段,它们基本都是非常专业的中间件级产品,复杂的状态机.活动.事件等概念充斥其中,只有高水平的开发实施人员才能驾驭.而

敏捷软件开发:又称敏捷开发,是一种从1990年代开始逐渐引起广泛关注的一些新兴软件开发方法,是一种应对快速变化的需求的一种软件开发能力. 与传统软件工程相比,它们的具体名称.理念.过程.术语都不尽相同,相对于"非敏捷",更强调程序员团队与业务专家之间的紧密协作.面对面的沟通(认为比书面的文档更有效).频繁交付新的软件版本.紧凑而自我组织型的团队.能够很好地适应需求变化的代码编写和团队组织方法,也更注重软件开发中"人"的作用. 本文将介绍敏捷软件开发的历史背景与发展,

Atitit.软件开发的三层结构isv金字塔模型 第一层,Implements 层,着重与功能的实现.. 第二次,spec层,理论层,设计规范,接口,等.流程.方法论 顶层,val层,价值观层,原则,法则,定律等. 这一建构应从界定内涵出发,从器物.制度和意识形式三个层面厘定其表征:并结合发展轨迹,通过比较,探索.建构有利于“本土”文化,必须着力追寻能推动这一文化特质生成的进路,并以发挥其实践功效为归宿点和落脚点. 作者::  ★(attilax)>>>   绰号:老哇的爪子 ( 全名:

atitit.attilax的软件 架构 理念.docx 1. 预先规划.1 2. 全体系化1 3. 跨平台2 4. 跨语言2 5. Dsl化2 5.1. 界面ui h5化2 6. 跨架构化2 7. 尽可能的功能为独立组件化,2 8. 独立分布化2 9. Hybrid化,集成化2 10. Vm化,再次封装化2 11. 二次封装化2 1. 预先规划. 不用功能可隐藏,但要预留 2. 全体系化 .避免某一方面核心技术受制于人 3. 跨平台 4. 跨语言 5. Dsl化 作者::  ★(attilax

Atitit.研发管理软件公司的软资产列表指南 1. Isv模型下的软资产1 2. 实现层面implet1 3. 规范spec层1 4. 法则定律等val层的总结2 1. Isv模型下的软资产 Soft assets就是“软资产”,指人力资源(human resources).品牌(brand).技术(technology)及知识储备等资产,研发能力也是软资产 2. 实现层面implet 产品 ,框架,类库 作者::  ★(attilax)>>>   绰号:老哇的爪子 ( 全名::Att