今天在使用muscle 软件进行多序列比对时,发现输出的结果全部为gap, 而且还没有明显的报错信息 找了很久之后,终于发现了问题 muscle 为了追求速度,对输入序列的个数和长度进行了限制 下面是官方说明文档中的原话: 我的输入序列长度为5k 左右, 最终输出的结果全部为gap 经过测试,我发现序列数大于50 的时候,只要长度没有太长,结果也是正常的 所以,muscle 的缺陷就是对于太长的输入序列,没办法正常比对,这个时候推荐使用mafft 这个多序列比对工具

序列图      序列图主要用于按照交互发生的一系列顺序,显示对象之间的这些交互.显示不同的业务对象如何交互,对于交流当前业务如何进行很有用.序列图是一个用来记录系统需求,和整理系统设计的好图.序列图是如此好用的理由是,因为它按照交互发生的时间顺序,显示了系统中对象间的交互逻辑.      序列图的主要目的是定义事件序列,产生一些希望的输出.重点不是消息本身,而是消息产生的顺序:不过,大多数序列图会表示一个系统的对象之间传递的什么消息,以及它们发生的顺序.图按照水平和垂直的维度传递信息:垂直维度

现在是二月,而且到如今你或许已经读到.或听到人们谈论UML 2.0 —— 包括若干进步的 UML 的新规范,所做的变化.考虑到新规范的重要性,我们也正在修改这个文章系列的基础,把我们的注意力从 OMG 的 UML 1.4 规范,转移到 OMG 的已采纳 UML 2.0草案规范(又名 UML 2).我不喜欢在一系列文章的中间,把重点从 1.4 变为 2.0 ,但是 UML 2.0 草案规范是前进的重要一步,我感觉需要扩充文字. 由于一些理由,OMG 改良了 UML .主要的理由是,他们希望 UML

mVISTA可对2个或者多个DNA序列进行比较,可以对比对结果进行可视化. 详情请大力戳这里 0 输入文件说明 mVISTA 需要输入的文件有如下几类 必须文件 邮箱 fasta格式序列文件(或者GENBANK identifier) 上传文件不得> 10 Mb 可选文件 比对程序 (一般选第3个即可) a. AVID b. LAGAN c. Shuffle-LAGAN 序列名称(序列名称会显示在结果图片中) 注释文件 (添加注释文件,可显示在结果图片中) 注释文件格式如下 < 106481

1251: 序列终结者 Time Limit: 20 Sec  Memory Limit: 162 MBSubmit: 3778  Solved: 1583[Submit][Status][Discuss] Description 网上有许多题,就是给定一个序列,要你支持几种操作:A.B.C.D.一看另一道题,又是一个序列 要支持几种操作:D.C.B.A.尤其是我们这里的某人,出模拟试题,居然还出了一道这样的,真是没技术含量……这样 我也出一道题,我出这一道的目的是为了让大家以后做这种题目有一个

1798: [Ahoi2009]Seq 维护序列seq Time Limit: 30 Sec  Memory Limit: 64 MBSubmit: 5504  Solved: 1937[Submit][Status][Discuss] Description 老师交给小可可一个维护数列的任务,现在小可可希望你来帮他完成. 有长为N的数列,不妨设为a1,a2,…,aN .有如下三种操作形式: (1)把数列中的一段数全部乘一个值; (2)把数列中的一段数全部加一个值; (3)询问数列中的一段数的和

1798: [Ahoi2009]Seq 维护序列seq Time Limit: 30 Sec  Memory Limit: 64 MB Description 老师交给小可可一个维护数列的任务,现在小可可希望你来帮他完成. 有长为N的数列,不妨设为a1,a2,-,aN .有如下三种操作形式: (1)把数列中的一段数全部乘一个值; (2)把数列中的一段数全部加一个值; (3)询问数列中的一段数的和,由于答案可能很大,你只需输出这个数模P的值. Input 第一行两个整数N和P(1≤P≤100000

1251: 序列终结者 Time Limit: 20 Sec  Memory Limit: 162 MB Submit: 3773  Solved: 1579 [Submit][Status][Discuss] Description 网上有许多题,就是给定一个序列,要你支持几种操作:A.B.C.D.一看另一道题,又是一个序列 要支持几种操作:D.C.B.A.尤其是我们这里的某人,出模拟试题,居然还出了一道这样的,真是没技术含量……这样 我也出一道题,我出这一道的目的是为了让大家以后做这种题目有

2962: 序列操作 Time Limit: 50 Sec  Memory Limit: 256 MBSubmit: 678  Solved: 246[Submit][Status][Discuss] Description 有一个长度为n的序列,有三个操作1.I a b c表示将[a,b]这一段区间的元素集体增加c,2.R a b表示将[a,b]区间内所有元素变成相反数,3.Q a b c表示询问[a,b]这一段区间中选择c个数相乘的所有方案的和mod 19940417的值. Input 第一

1858: [Scoi2010]序列操作 Time Limit: 10 Sec  Memory Limit: 64 MBSubmit: 1961  Solved: 991[Submit][Status][Discuss] Description lxhgww最近收到了一个01序列,序列里面包含了n个数,这些数要么是0,要么是1,现在对于这个序列有五种变换操作和询问操作: 0 a b 把[a, b]区间内的所有数全变成0 1 a b 把[a, b]区间内的所有数全变成1 2 a b 把[a,b]区

3675: [Apio2014]序列分割 Time Limit: 40 Sec  Memory Limit: 128 MBSubmit: 1420  Solved: 583[Submit][Status][Discuss] Description 小H最近迷上了一个分隔序列的游戏.在这个游戏里,小H需要将一个长度为n的非负整数序列分割成k+1个非空的子序列.为了得到k+1个子序列,小H需要重复k次以下的步骤: 1.小H首先选择一个长度超过1的序列(一开始小H只有一个长度为n的序列——也就是一开始

1858: [Scoi2010]序列操作 Time Limit: 10 Sec  Memory Limit: 64 MB 线段树,对于每个区间需要分别维护左右和中间的1和0连续个数,并在op=4时特殊处理一下. Description lxhgww最近收到了一个01序列,序列里面包含了n个数,这些数要么是0,要么是1,现在对于这个序列有五种变换操作和询问操作: 0 a b 把[a, b]区间内的所有数全变成0 1 a b 把[a, b]区间内的所有数全变成1 2 a b 把[a,b]区间内的所有

3675: [Apio2014]序列分割 Time Limit: 40 Sec  Memory Limit: 128 MBSubmit: 1066  Solved: 427[Submit][Status][Discuss] Description 小H最近迷上了一个分割序列的游戏.在这个游戏里,小H需要将一个长 度为N的非负整数序列分割成k+l个非空的子序列.为了得到k+l个子序列, 小H将重复进行七次以下的步骤: 1．小H首先选择一个长度超过1的序列(一开始小H只有一个长度为n的 序列一一也就

4403: 序列统计 Time Limit: 3 Sec  Memory Limit: 128 MBSubmit: 328  Solved: 162[Submit][Status][Discuss] Description 给定三个正整数N.L和R,统计长度在1到N之间,元素大小都在L到R之间的单调不降序列的数量.输出答案对10^6+3取模的结果. Input 输入第一行包含一个整数T,表示数据组数.第2到第T+1行每行包含三个整数N.L和R,N.L和R的意义如题所述. Output 输出包含T

Seq 维护序列seq Time Limit: 30 Sec  Memory Limit: 64 MBSubmit: 4184  Solved: 1518[Submit][Status][Discuss] Description 老师交给小可可一个维护数列的任务,现在小可可希望你来帮他完成. 有长为N的数列,不妨设为a1,a2,…,aN .有如下三种操作形式: (1)把数列中的一段数全部乘一个值; (2)把数列中的一段数全部加一个值; (3)询问数列中的一段数的和,由于答案可能很大,你只需输出这

WA了一版... 切点确定的话, 顺序是不会影响结果的..所以可以dp dp(i, k) = max(dp(j, k-1) + (sumn - sumi) * (sumi - sumj)) 然后斜率优化就可以了... -------------------------------------------------------------------------------- #include<cstdio> #include<algorithm> #include<cstr

线段树.. 打个 mul , add 的标记就好了.. 这个速度好像还挺快的...( 相比我其他代码 = = ) 好像是#35.. --------------------------------------------------------------- #include<cstdio> #include<algorithm> #include<cstring> #include<iostream> #include<vector>   #d

略恶心的线段树...不过只要弄清楚了AC应该不难.... ---------------------------------------------------------------- #include<cstdio> #include<cstring> #include<algorithm> #include<iostream>   #define rep( i , n ) for( int i = 0 ; i < n ; i++ ) #defin

1798: [Ahoi2009]Seq 维护序列seq Time Limit: 30 Sec  Memory Limit: 64 MBSubmit: 2930  Solved: 1087[Submit][Status] Description 老师交给小可可一个维护数列的任务,现在小可可希望你来帮他完成. 有长为N的数列,不妨设为a1,a2,…,aN .有如下三种操作形式: (1)把数列中的一段数全部乘一个值; (2)把数列中的一段数全部加一个值; (3)询问数列中的一段数的和,由于答案可能很大

3675: [Apio2014]序列分割 Time Limit: 40 Sec  Memory Limit: 128 MB Description 小H最近迷上了一个分隔序列的游戏.在这个游戏里,小H需要将一个长度为n的非负整数序列分割成k+1个非空的子序列.为了得到k+1个子序列,小H需要重复k次以下的步骤: 1.小H首先选择一个长度超过1的序列(一开始小H只有一个长度为n的序列--也就是一开始得到的整个序列): 2.选择一个位置,并通过这个位置将这个序列分割成连续的两个非空的新序列.   每