r脚本画带有bar的柱状图

6、R语言绘制带errorbar 的柱状图

转载:http://www.cnblogs.com/xudongliang/p/7283733.html data <- data.frame(mean = c(10, 15), sd = c(12, 17))rownames(data) <- c("case", "control") par(lwd = 2) b <- barplot(data$mean, names.arg = rownames(data), col = c("red

R语言画全基因组关联分析中的曼哈顿图（manhattan plot）

1.在linux中安装好R 2.准备好画曼哈顿图的R脚本即manhattan.r,manhattan.r内容如下: #!/usr/bin/Rscript #example : Rscript plot_manhatom.r XXX.assoc XXX.pdf argv <- commandArgs() #define the function to plot the manhatton and quantitle-quantitle plot plot_manhatton<-function(

Rscripts的使用，以及如何为R脚本传参数

一.在windows下使用Rscript: 1.进入cmd.exe下,将当前工作目录转到Rscript.exe所在目录下面,然后调用Rscript **.R文件即可.但是所调用的.R文件必须是在R的工作目录下,也就是和Rscript.exe在同一个文件夹内(Rscript默认情况下是不保存工作空间的).还可以将这些命令写成一个bat文件,然后将该文件放置在cmd.exe的工作目录下,直接在cmd.exe中输入该bat文件名即可运行.bat文件中包含了Rscript命令.2.进入cmd.exe下

如何在cluster上跑R脚本

R 是一个比较不错但是有时候操蛋的语言,不错是因为用着爽的时候真的很爽,操蛋是因为这种爽不是什么时候都可以的,比如说在cluster上批处理跑R脚本. 当然说这话有些在上面跑过的各种不服气,你丫傻逼吧这么简单都不会,呵呵,别急,我今天就是来看看怎么在cluster上提交R脚本的. R有几种命令行处理模式,典型的是 R COMMAND BATCH "--args arg1 arg2.." *.r *.out R --vanilla --args arg1 arg2 ... <*.r

编写运行R脚本

1.在后台运行R 1.1 创建file.R文件 1.2 在文件首行键入: #! /path/to/Rscript 1.3 在下面的行中,键入R代码 1.4 保存(记得有png(),jpeg(),...等函数的代码最后一定要有dev.off()) 1.5 在file.R的工作目录下,在终端中输入以下命令: R CMD BATCH --args file.R 1.6 file.R被运行了!!! 优点: R命令行下打错命令后回车,之前的所有相关命令几乎全军覆没.如果不想发生这种情况,请写一个file.

R(二): http与R脚本通讯环境安装

结合实际的工作环境,在开始R研究的时候,首先着手收集的就是能以Web方式发布R运行结果的基础框架,无耐的是,R一直以来常使用于个人电脑的客户端程序上,大家习惯性的下载R安装包,在自己的电脑上安装 --> 写算法 --> 运行 --> 以贴图或者文档的形式发表自己的作品.花了较长时间,终于找着了一套框架基本满足要求,即FastRWeb (Fast Interactive Web Framework for Data Mining Using R),参考 (http://www.rforge

VS中使用QT调用R脚本

一开始想直接把R编译成库然后调用R,后来查了n多资料,发现VS中是无法办到的,官方也给出了一句话,大概意思就是没可能在VS中使用R提供的C++接口,大概是涉及到了底层的ABI的原因,具体也不太清楚. 于是就想到了直接采用新建文件然后写成.R脚本的方式来调用R,这种使用方式必须安装R,然后从程序内部调用RScript.exe以及相应脚本. QFile Rfile("C:\\temp\\RScript\\heatmap.R"); Rfile.open(QIODevice::WriteOnl

R语言笔记2--循环、R脚本

1.循环语句 for语句 while语句 2.R脚本 source()函数 print()函数

Linux系统 awk sed R脚本 python脚本传入变量

sed 传入变量: chrI="chr2";sed -n "/$chrI/p" clippointpos.csv #变量用$var表示,把sed的单引号变为双引号即可 awk 传入变量: chrI="chr2";awk '/"'$chrI'"/{print $0}' clippointpos.csv #变量用$var表示,变量两边再加上"' R脚本传入变量: arg <- commandArgs(T) fi

PowerBI开发第十篇：R 脚本

R是一种专门用于数据分析和统计的脚本语言,广泛应用在每一个需要统计和数据分析的领域.PowerBI支持R脚本,只不过,PowerBI Desktop默认没有安装R.在使用R脚本之前,必须向PowerBI Desktop中安装R引擎.用户可以使用R脚本加载数据.对数据进行转换和处理.使用R脚本图形化显示数据,以发现数据中隐藏的insight.PowerBI可以直接调用R外部IDE,提供更好的编程体验. 一,安装R 在使用R之前,用户必须向本地主机中安装R引擎.安装的过程非常简单,只需要点击File

JAVA调用R脚本

0 前言R是一种非常方便易用的绘图.统计分析.ML算法设计方面的脚本语言.实际中有这样一种场景:算法工程师用R搭建了机器学习算法模型,想用于javaweb之中但是又不想重新用java写一遍算法模型,那么可以考虑java程序中直接调用R的脚本.JAVA负责系统的构建,R用来做运算引擎,从而实现应用型和分析性相结合的系统. 本文将搞清楚如下几个问题: 1)java调用R的方式有哪些及每种方式如何使用? 2)这些调用方式的有哪些优缺点? 下面开始. 1 java调用R的两种方式1.1 远程调用模式(使

R语言画棒状图（bar chart）和误差棒（error bar）

假设我们现在有CC,CG,GG三种基因型及三种基因型对应的表型,我们现在想要画出不同的基因型对应表型的棒状图及误差棒.整个命令最重要的就是最后一句了,用arrows函数画误差棒.用到的R语言如下: data<-read.csv("E:/model/data.csv",sep=" ",header=T)#导入数据data mean_CC<-mean(data[,1])#计算CC基因型对应的表型的平均值 mean_GG<-mean(data[,2])

Jquery画折线图、柱状图、饼图

1.今天做了一个折线图,首先需要导js文件.这里有一个demo:http://files.cnblogs.com/files/feifeishi/jquery_zhexiantubingtuzhuzhuangtu_demo.rar,里边有要用到的js文件. 我的折线图用这两个文件.这里不能用jquery.js,没有因为,没有所以,那样会出错,主线不会显示. 2.代码 <div style="margin: 0 2em"> <div id="container

Windows环境下 PHP调用R脚本

写在前面的: 由于是windows平台实现的,只要保证脚本命令能在cmd控制台运行,则可以在php中利用system()实现. 注意事项: (1).保证system的路径中无汉字和空格 !! (亲身试验:路径中如果有空格,就得不到结果!!) (2).事先要配置R语言环境,在windows环境变量path中添加路径C:\R\R-3.4.0\bin 程序如下: R 路径:C:\R\R-3.4.0\bin\R.exe test1.R 路径:C:\Rwork\test1.R print(

R语言画点状误差线

现在项目需要R语言做几个线性拟合,画一些点图,突然需要画误差线,网上找了下,可以用代码实现..效果如下 xx1<-c(xxxxxx,xxxx,xxxxx) yy1<-c(xxxxxx,xxxx,xxxxx) std1<-c(xxxxxx,xxxx,xxxxx) std2<-c(xxxxxx,xxxx,xxxxx) plot_stdy <- function(x, y, sd, len = 1, col = "black") { len <- len

R语言-画线图

R语言分高水平作图函数和低水平作图函数高水平作图函数:可以独立绘图,例如plot() 低水平作图函数:必须先运行高水平作图函数绘图,然后再加画在已有的图上面第一种方法:plot()函数 > sales<-read.csv("dailysales.csv", header=TRUE) #读取文件和列名 > plot(sales$units~as.Date(sales$date,"%d/%m/%y"), #修改日期格式 + type="l

R语言-画散点图

plot()函数 plot(cars$dist~cars$speed, # y~x main="XXX", # 画标题 xlab="XXX", #X坐标轴标题 ylab="XXX", #Y坐标轴标题 xlim=c(0,30

HTML5 Canvas 绘制库存变化折线画入库出库柱状图

代码: <!DOCTYPE html> <html lang="utf-8"> <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8"/> <head> <title>显示入库出库柱状图</title> </head> <body onload="draw()"

用R语言画条形图（基于ggplot2包）

1.用qplot(x,data=data,geom.=”bar”,weight=y)+scale_y_continuous("y")画出y关于x的条形. 图中提示binwidth这里是指矩形的宽度,指定之后如下 qplot(x,data=data,geom="bar",weight=y,binwidth=0.2)+scale_y_continuous("y") 2.用qplot(x,data=data,geom.=”bar”)画出来的是频率直方图

JAVA调用R脚本 windwos路径下

RConnection c = new RConnection();// REXP x = c.eval("source('D:\\\\jiaoben\\\\RJava_test.R',encoding = \"UTF-8\")"); REXP x = c.eval("source('D:\\\\jiaoben\\\\Rjava_testx6.R',encoding = \"UTF-8\")");// REXP eval =

Shell脚本传递带有空格的参数

在另一博文<Shell脚本实现DB2数据库表导出到文件>中实现了通过脚本实现将DB2数据库导出到文件,需要传入七个参数,最后一个是一个带有空格字符串,所以传入的时候有点问题,会自动识别空格,默认会将空格前的当作第7个参数,以下是传入的参数: MD duanwf CDR_CALL_YYYYMMDD /home/duanwf/asiainfo/export/T141015001_20141014.avl & fetch first rows only 最后的“fetch first 100

r脚本画带有bar的柱状图

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