柳叶刀重磅出击！全外显子测序在胎儿结构异常的评估Whole-exome sequencing in the evaluation of fetal structural anomalies: a prospective cohort study

柳叶刀发表的文献解读：Whole-exome sequencing in the evaluation of fetal structural anomalies: a prospective cohort study

背景介绍

• 随着超声波在产科护理中的应用，胎儿结构异常的鉴别已成为例行公事。当发现异常时，进一步评估核型、全染色体非整倍体与染色体微阵列（CMA）上较小的微缺失和复制（CNV），则是非常的重要。目前研究发现，大约32%结构异常胎儿具有临床相关的异常核型，6%的结构异常胎儿能找到致病的CNV，这意味着超过60%的孕妇没有明确的基因组诊断方法作为胎儿结构异常的遗传咨询以及指导。
• 当核型检测和染色体微阵列检测均为阴性时，可通过全外显子测序（WES）可诊断无法解释的假定遗传性疾病（如出生缺陷），诊断率在25-35%。
• 目前为止，只有案例系列评价了孕期应用WES的可行性和价值诊断，尽管数据有限，实验室和临床医生已经开始提供产前WES作为评估胎儿畸形的临床护理。

研究方法

• 234 个胎儿结构异常的三口之家被纳入研究（孕11-35周）。

• 排除核型异常和染色体微阵列异常的胎儿。

• 排除父母、胎儿DNA数据缺失的样本。

结果

• 全外显子测序结果：

• 71 (14%) 对父母拒绝参与该项研究，87 (17%)  的家庭缺乏其中一位的DNA数据，69 (13%)  个胎儿存在核型异常和染色体微阵列异常，51 (10%) 个家庭撤回研究，5(1%)个家庭质量不过关，没法分析，被排除。

• 新突变韦恩图结果：

• 产生258个假定的（还没验证）新突变，蓝色为具有生物学意义的新突变，红色为致病性的新突变

  

• 不同异常器官的突变分布：淋巴（24%）异常、骨骼（24%）异常、中枢神经（22%）异常和肾脏（16%）异常的胎儿突变比较多，心脏异常的胎儿突变较少。

  

本文亮点：

• 第一次大规模的进行了胎儿结构异常的三口之家的全外测序研究；

• 第一次用大数据的结果显示，当核型和染色体微阵列正常的情况下，全外显子测序只能解释10%的胎儿结构异常案例；

原文出处：https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0140673618320427