参考资料：

【cfDNA专题】cell-free DNA在非肿瘤疾病中的临床价值（好）

ctDNA, cfDNA和CTCs有什么区别吗？

cfDNA你懂多少？

新发现 | 基因是否表达,做个cfDNA全基因组测序就可揭晓

游离DNA

Cell-Free DNA (cfDNA) Isolation

游离DNA (circulating cell free DNA，cfDNA)，是一种在细胞外呈现游离状态且无细胞状态的的DNA，广泛存在于动植物及人类的血清、血浆、脑脊液、尿液、痰液或粪便当中。过去，有许多文献证实，肿瘤患者的血浆和血清中检测到了癌基因突变，并且与原发肿瘤相一致[1.2.3]，因此cfDNA逐渐受到重视。如今，游离在血液中DNA的研究促成了「非侵入性检测」技术的发展。除肿瘤检测(tumor gene screening) 与监控外，还发展其他应用，胎儿产前诊断(prenatal screening)。这些应用，皆可透过次世代定序技术来进行检测，同时为非侵入性，风险低且准确率高。

适用研究目的：1.非侵入性产前染色体检测；2.肿瘤检测监控。

基本分析：Quality trimmed, Mapping to reference genome, SNP/INDEL detection, SNP/INDEL annotation by VEP

cfDNA（circulating cell free DNA）全基因组测序的更多相关文章

  1. 全基因组测序 Whole Genome Sequencing

    全基因组测序 Whole Genome Sequencing 全基因组测序(Whole Genome Sequencing,WGS)是利用高通量测序平台对一种生物的基因组中的全部基因进行测序,测定其 ...

  2. PacBio全基因组测序和组装

    PacBio公司的业务范围也就5个(官网): Whole Genome Sequencing Targeted Sequencing Complex Populations RNA Sequencin ...

  3. 全基因组测序 从头测序(de novo sequencing) 重测序(re-sequencing)

    全基因组测序 全基因组测序分为从头测序(de novo sequencing)和重测序(re-sequencing). 从头测序(de novo)不需要任何参考基因组信息即可对某个物种的基因组进行测序 ...

  4. WGS 全基因组测序数据分析

    1. DNA测序技术 https://www.jianshu.com/p/6122cecec54a 2.FASTA和FASTQ文件格式 https://www.jianshu.com/p/50ff30 ...

  5. 利用ONT测序检测真核生物全基因组甲基化状态

    摘要 甲基化在真核生物基因组序列中广泛存在,其中5mC最为普遍,在真核生物基因组中也有发现6mA.捕获基因组中的甲基化状态的常用技术是全基因组甲基化测序(WGBS)和简化甲基化测序(RRBS),而随着 ...

  6. 如何鉴定全基因组加倍事件（WGD）

    目前鉴定全基因组加倍(whole-genome duplication events)有3种 通过染色体共线性(synteny) 方法是比较两个基因组的序列,并将同源序列的位置绘制成点状图,如果能在点 ...

  7. GWAS | 全基因组关联分析 | Linkage disequilibrium (LD)连锁不平衡 | 曼哈顿图 Manhattan_plot | QQ_plot | haplotype phasing

    现在GWAS已经属于比较古老的技术了,主要是碰到严重的瓶颈了,单纯的snp与表现的关联已经不够,需要具体的生物学解释,这些snp是如何具体导致疾病的发生的. 而且,大多数病找到的都不是个别显著的snp ...

  8. 柳叶刀重磅出击！全外显子测序在胎儿结构异常的评估Whole-exome sequencing in the evaluation of fetal structural anomalies: a prospective cohort study

    柳叶刀发表的文献解读:Whole-exome sequencing in the evaluation of fetal structural anomalies: a prospective coh ...

  9. 【GWAS文献解读】疟原虫青蒿素抗药性的全基因组关联分析

    英文名:Genetic architecture of artemisinin-resistant Plasmodium falciparum 中文名:疟原虫青蒿素抗药性的全基因组关联分析 期刊:Na ...

随机推荐

  1. SQL隐式装换消耗过高CPU

    错误参数类型numeric /*100001790*/select uid from voip_userextendcontactinfo with (nolock) where sipid = 11 ...

  2. UI，切图，命名

    APP切图流程和APP切图命名规范详细完整版 http://www.25xt.com/appdesign/7339.html Marketch

  3. DataList删除操作

    <asp:DataList ID="fileList" runat="server" RepeatColumns="1" Repeat ...

  4. Azure Management API 之 利用 Windows Azure Management Libraries 来控制Azure platform

    在此之前,我曾经发过一篇文章讲叙了如何利用Azure power shell team 提供的class library. 而就在这篇文章发布之后不久,我又发现微软发布了一个preview 版本的Wi ...

  5. WebSphere MQ Explorer的sqlserver的jdbc

    一.IBM WebSphere MQ7.0的jdbc支持数据库有: DB2 Informix Informix_With_Date_Format Microsoft_SQL_Server Oracle ...

  6. Css样式基础

    1.Css的语法 CSS的语法主要由两个部分组成,一个是选择器,一个是属性. 选择器又分为以下几种: 1.元素选择器:即Html标签去掉括号的就是元素 2.类选择器:所谓的类就是说class=“名称” ...

  7. error: could not read CFBundleIdentifier from Info.plist (null)解决方法之一

    出现这种错误的原因可能很多,以下是我遇到的一种情况: 项目移植到新的环境 编译报错:  error: could not read CFBundleIdentifier from Info.plist ...

  8. Excel 数据关联

    =INDEX(Sheet2!$A$2:$A$77,MATCH(A4,Sheet2!$C$2:$C$77,0))

  9. selenium-JS点击（项目应用）

    public static JavascriptExecutor jse; 声明一个js public LogoutWebElements(WebDriver driver){        Logo ...

  10. javascript 字符串多行的写法

    多行写法! $('#' +xx ).append ( '<div id="' + file.id + '" class="">\ <div c ...