cfDNA(circulating cell free DNA)全基因组测序
参考资料:
【cfDNA专题】cell-free DNA在非肿瘤疾病中的临床价值(好)
新发现 | 基因是否表达,做个cfDNA全基因组测序就可揭晓
Cell-Free DNA (cfDNA) Isolation
游离DNA (circulating cell free DNA,cfDNA),是一种在细胞外呈现游离状态且无细胞状态的的DNA,广泛存在于动植物及人类的血清、血浆、脑脊液、尿液、痰液或粪便当中。过去,有许多文献证实,肿瘤患者的血浆和血清中检测到了癌基因突变,并且与原发肿瘤相一致[1.2.3],因此cfDNA逐渐受到重视。如今,游离在血液中DNA的研究促成了「非侵入性检测」技术的发展。除肿瘤检测(tumor gene screening) 与监控外,还发展其他应用,胎儿产前诊断(prenatal screening)。这些应用,皆可透过次世代定序技术来进行检测,同时为非侵入性,风险低且准确率高。
适用研究目的:1.非侵入性产前染色体检测;2.肿瘤检测监控。
基本分析:Quality trimmed, Mapping to reference genome, SNP/INDEL detection, SNP/INDEL annotation by VEP
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