参考资料：

【cfDNA专题】cell-free DNA在非肿瘤疾病中的临床价值（好）

ctDNA, cfDNA和CTCs有什么区别吗？

cfDNA你懂多少？

新发现 | 基因是否表达,做个cfDNA全基因组测序就可揭晓

游离DNA

Cell-Free DNA (cfDNA) Isolation

游离DNA (circulating cell free DNA，cfDNA)，是一种在细胞外呈现游离状态且无细胞状态的的DNA，广泛存在于动植物及人类的血清、血浆、脑脊液、尿液、痰液或粪便当中。过去，有许多文献证实，肿瘤患者的血浆和血清中检测到了癌基因突变，并且与原发肿瘤相一致[1.2.3]，因此cfDNA逐渐受到重视。如今，游离在血液中DNA的研究促成了「非侵入性检测」技术的发展。除肿瘤检测(tumor gene screening) 与监控外，还发展其他应用，胎儿产前诊断(prenatal screening)。这些应用，皆可透过次世代定序技术来进行检测，同时为非侵入性，风险低且准确率高。

适用研究目的：1.非侵入性产前染色体检测；2.肿瘤检测监控。

基本分析：Quality trimmed, Mapping to reference genome, SNP/INDEL detection, SNP/INDEL annotation by VEP

cfDNA（circulating cell free DNA）全基因组测序的更多相关文章

  1. 全基因组测序 Whole Genome Sequencing

    全基因组测序 Whole Genome Sequencing 全基因组测序(Whole Genome Sequencing,WGS)是利用高通量测序平台对一种生物的基因组中的全部基因进行测序,测定其 ...

  2. PacBio全基因组测序和组装

    PacBio公司的业务范围也就5个(官网): Whole Genome Sequencing Targeted Sequencing Complex Populations RNA Sequencin ...

  3. 全基因组测序 从头测序(de novo sequencing) 重测序(re-sequencing)

    全基因组测序 全基因组测序分为从头测序(de novo sequencing)和重测序(re-sequencing). 从头测序(de novo)不需要任何参考基因组信息即可对某个物种的基因组进行测序 ...

  4. WGS 全基因组测序数据分析

    1. DNA测序技术 https://www.jianshu.com/p/6122cecec54a 2.FASTA和FASTQ文件格式 https://www.jianshu.com/p/50ff30 ...

  5. 利用ONT测序检测真核生物全基因组甲基化状态

    摘要 甲基化在真核生物基因组序列中广泛存在,其中5mC最为普遍,在真核生物基因组中也有发现6mA.捕获基因组中的甲基化状态的常用技术是全基因组甲基化测序(WGBS)和简化甲基化测序(RRBS),而随着 ...

  6. 如何鉴定全基因组加倍事件（WGD）

    目前鉴定全基因组加倍(whole-genome duplication events)有3种 通过染色体共线性(synteny) 方法是比较两个基因组的序列,并将同源序列的位置绘制成点状图,如果能在点 ...

  7. GWAS | 全基因组关联分析 | Linkage disequilibrium (LD)连锁不平衡 | 曼哈顿图 Manhattan_plot | QQ_plot | haplotype phasing

    现在GWAS已经属于比较古老的技术了,主要是碰到严重的瓶颈了,单纯的snp与表现的关联已经不够,需要具体的生物学解释,这些snp是如何具体导致疾病的发生的. 而且,大多数病找到的都不是个别显著的snp ...

  8. 柳叶刀重磅出击！全外显子测序在胎儿结构异常的评估Whole-exome sequencing in the evaluation of fetal structural anomalies: a prospective cohort study

    柳叶刀发表的文献解读:Whole-exome sequencing in the evaluation of fetal structural anomalies: a prospective coh ...

  9. 【GWAS文献解读】疟原虫青蒿素抗药性的全基因组关联分析

    英文名:Genetic architecture of artemisinin-resistant Plasmodium falciparum 中文名:疟原虫青蒿素抗药性的全基因组关联分析 期刊:Na ...

随机推荐

  1. Fiddler 常用文档

    时间飞逝,已经俩月有余没写东西了(本来写的就不多,(^▽^)),最近俩月的苦闷,此处省略 1W 字.... 闲言碎语不多讲,使用 Fiddler 有一小段时间了,今天在这里总结下,一来做个笔记,二来可 ...

  2. tensorflow 学习笔记

    tensorflow一些函数: 1.tf.ones(shape,type=tf.float32,name=None)      tf.ones([2, 3], int32) ==> [[1, 1 ...

  3. memcache基础知识

    memcached的内存存储机制 Memcached默认情况下采用了名为Slab Allocator的机制分配.管理内存.在该机制出现以前,内存的分配是通过对所有记录简单地进行malloc和free来 ...

  4. Linux下取代top的进程管理工具 htop

    一.htop 简介 This is htop, an interactive process viewer for Linux. It is a text-mode application (for ...

  5. ubuntu vim8.0源码安装

    安装篇 从https://github.com/vim/vim下载相应zip源码文件,利用unzip vim-master.zip 命令解压到当前用户目录,即~: 解压后进入vim的src目录,首先, ...

  6. Android从assets目录下读取文件相关

    有一个需求是app的帮助文档是word格式,ios可以直接用webview加载word显示,Android不行.而美工不配合转换成图片,前端没时间把word写成html 没办法,自己搞. 步骤: 1. ...

  7. Fuel UX wizard example

    <!DOCTYPE html> <html class="no-js fuelux"> <head> <meta charset=&quo ...

  8. libevent源码分析：http-server例子

    http-server例子是libevent提供的一个简单web服务器,实现了对静态网页的处理功能. /* * gcc -g -o http-server http-server.c -levent ...

  9. easyUI-combobox 动态绑定数据源

    前台 <link rel="stylesheet" type="text/css" href="../css/easyui.css"/ ...

  10. FTP命令

    linux下常用FTP命令 1. 连接ftp服务器   1. 连接ftp服务器 格式:ftp [hostname| ip-address]a)在linux命令行下输入: ftp 192.168.1.1 ...