Bowtie2
如何使用Bowtie2

相似功能的有:

创建索引
创建索引bowtie2-build使用的命令。 -f指定要索引文件后,再给予索引的名称。名称可以连接到任何。
bowtie2 build-f reference_dna.fa INDEX_NA
转载:https://translate.google.co.jp/translate?hl=zh-CN&sl=ja&u=http://bi.biopapyrus.net/transcriptome/map/bowtie2.html&prev=search
Bowtie2的更多相关文章
- bowtie1和bowtie2的比较
1.对于长度大于50bp的reads,bowtie2更精确:而小于50bp的reads,bowtie1更精确更快速 2.bowtie2支持的reads长度没有上限,当然reads长度在50~1000b ...
- 安装生物信息学软件-bowtie2
好吧,这是本周(2016.10.21-28)的学习任务之一:安装bowtie2并学习其使用方法&参数设置 所以,啃文档咯,官方文档Version 2.2.9 http://bowtie-bio ...
- 生物信息学工具--bowtie&bowtie2
Bowtie和Bowtie2使用 [怪毛匠子整理] Source URL: http://www.bbioo.com/lifesciences/40-112837-1.html Bowtie和Bowt ...
- bowtie2 Linux安装
目前最新版本为2.3.2,网址为:https://sourceforge.net/projects/bowtie-bio/files/bowtie2/2.3.2 安装分为简单的下载可执行文件和源编译安 ...
- Hisat2 bowtie2比对结果解读(Hisat2 Alignment summary)
RNA-seq数据的比对结果怎么解读?网上有很多人问,这里做一个大致的总结. Hisat2和bowtie2比对后产生的Alignment summary的格式是一样的,如下: Alignment su ...
- Bowtie2的安装与使用
Bowtie2的安装与使用 2017-06-15 18:58:52 342 0 0 Bowtie2用来快速比对短reads(50-100bp)与参考基因组,与常规的比对软件不 ...
- bowtie2-inspect 根据bowtie2的索引取得fasta 序列
今天运行tophat2的时候看到下面这条记录: [2016-02-27 11:40:03] Checking for reference FASTA file Warning: Could not f ...
- bowtie2用法
bowtie2的功能:短序列的比对 用法:bowtie2 [options]* -x <bt2-idx> {-1 <m1> -2 <m2> | -U <r&g ...
- 30、 bowtie和bowtie2使用条件区别及用法
转载:http://blog.csdn.net/soyabean555999/article/details/62235577 一.转录组还是基因组? map常用的工具有bowtie/bowtie2, ...
随机推荐
- XML学习笔记(四)-- 修饰XML文档的CSS
标签(空格分隔): 学习笔记 XML为存储结构化数据提供了强大的方法,但是它没有提供关于数据如何显示地信息,(数据的结构与数据表示无关).可以使用CSS来控制XML文档中各元素的呈现方式. CSS语法 ...
- CentOS----使用yum命令出现“could not retrieve mirrorlist http://mirrorlist.centos.org ***” - ybq155”
无聊安装了个mini版的32位的CentOS 6.5,进来想安装个东西,yum install emacs 提示什么 Loaded plugins: fastestmirror, refresh-pa ...
- Can’t connect to local MySQL server through socket ‘/var/lib/mysql/mysql.sock’解决方法 + Linux启动/停止/重启Mysql数据库的方法
启动mysql 报错: ERROR 2002 (HY000): Can’t connect to local MySQL server through socket ‘/var/lib/mysql/m ...
- easyui combotree 只能选择子节点
//区号只能选子节点 $("#quhao").combotree({ onBeforeSelect: function (node) { //返回树对象 var tree = $( ...
- es6箭头函数中this
普通函数: $scope.$on('$stateChangeSuccess',function(){this.list = this.getList();}); 箭头函数: $scope.$on('$ ...
- ASCII十进制字符集
<script> for(var i=33;i<=6000;i++){ document.write(" "+i+"  ...
- 加强型无穷集合:InfiniteList<T>,可指定遍历方向和偏移量,只要集合有元素并且偏移量不为 0,将永远遍历下去。
主类: public class InfiniteList<T> : IEnumerable<T> { public List<T> SourceList { ge ...
- 树(一)——线段树
问题 现在有1~30这30个数,数N被抽上的概率正比于1/sqrt(N+1),求满足这个概率分布的随机数发生器. 思路 第一,如何解决这个"概率正比"问题. 第二,如何产生满足条件 ...
- oracle修改序列
Oracle 序列(Sequence)主要用于生成流水号,在应用中经常会用到,特别是作为ID值,拿来做表主键使用较多. 但是,有时需要修改序列初始值(START WITH)时,有同仁使用这个语句来 ...
- 解决Centos7安装后无法联网的问题
1.进入目录/etc/sysconfig/network-scripts/ $ cd /etc/sysconfig/network-scripts/ 2.找到编辑ifcfg-enoxxxx文件,后面的 ...
