Bowtie2
如何使用Bowtie2

相似功能的有:

创建索引
创建索引bowtie2-build使用的命令。 -f指定要索引文件后,再给予索引的名称。名称可以连接到任何。
bowtie2 build-f reference_dna.fa INDEX_NA
转载:https://translate.google.co.jp/translate?hl=zh-CN&sl=ja&u=http://bi.biopapyrus.net/transcriptome/map/bowtie2.html&prev=search
Bowtie2的更多相关文章
- bowtie1和bowtie2的比较
1.对于长度大于50bp的reads,bowtie2更精确:而小于50bp的reads,bowtie1更精确更快速 2.bowtie2支持的reads长度没有上限,当然reads长度在50~1000b ...
- 安装生物信息学软件-bowtie2
好吧,这是本周(2016.10.21-28)的学习任务之一:安装bowtie2并学习其使用方法&参数设置 所以,啃文档咯,官方文档Version 2.2.9 http://bowtie-bio ...
- 生物信息学工具--bowtie&bowtie2
Bowtie和Bowtie2使用 [怪毛匠子整理] Source URL: http://www.bbioo.com/lifesciences/40-112837-1.html Bowtie和Bowt ...
- bowtie2 Linux安装
目前最新版本为2.3.2,网址为:https://sourceforge.net/projects/bowtie-bio/files/bowtie2/2.3.2 安装分为简单的下载可执行文件和源编译安 ...
- Hisat2 bowtie2比对结果解读(Hisat2 Alignment summary)
RNA-seq数据的比对结果怎么解读?网上有很多人问,这里做一个大致的总结. Hisat2和bowtie2比对后产生的Alignment summary的格式是一样的,如下: Alignment su ...
- Bowtie2的安装与使用
Bowtie2的安装与使用 2017-06-15 18:58:52 342 0 0 Bowtie2用来快速比对短reads(50-100bp)与参考基因组,与常规的比对软件不 ...
- bowtie2-inspect 根据bowtie2的索引取得fasta 序列
今天运行tophat2的时候看到下面这条记录: [2016-02-27 11:40:03] Checking for reference FASTA file Warning: Could not f ...
- bowtie2用法
bowtie2的功能:短序列的比对 用法:bowtie2 [options]* -x <bt2-idx> {-1 <m1> -2 <m2> | -U <r&g ...
- 30、 bowtie和bowtie2使用条件区别及用法
转载:http://blog.csdn.net/soyabean555999/article/details/62235577 一.转录组还是基因组? map常用的工具有bowtie/bowtie2, ...
随机推荐
- Apache Solr 访问权限控制
Current state of affairs SSL support was added in version 4.2 (SolrCloud v4.7). Protection of Zookee ...
- Linux 日常命令
命令 介绍说明 pwd 打印出当前所在目录 mkdir 创建一个目录 rmdir 删除一个目录 rm 删除文件或目录 -r:删除目录时必须加上 cp 复制一个文件或目录 -r:复制 ...
- 各版本Office办公软件下载
各版本Office办公软件下载:http://pan.baidu.com/share/home?uk=1174874628
- 《BI项目笔记》创建时间维度(2)
创建步骤: 序号 选择的属性 重命名后的名称 属性类别 1 DateKey DateKey 常规 2 Month Key Month Key 月份 3 English Month Name Eng ...
- DuiLib 自定义识别控件
遇到一个断点无法识别自定义的控件,运气比较好,一搜就搜出来了: 参考地址:http://www.bkjia.com/ASPjc/992050.html 主要是这个函数: CControlUI* CDi ...
- git的一些常用方法
1.撤销add但未commit的文件: git rm -r --cached path/file 2.git 撤销commit: 2.1).git log-显示提交的历史 commit ee50348 ...
- lamp centos虚拟主机配置
1.基于不同端口的虚拟主机配置 [root@lamp~]# vi /etc/httpd/conf/httpd.conf Listen 80 #设置监听不同的虚拟主机需要使用的端口 Liste ...
- 从零搭建mongo分片集群的简洁方法
一.目录 1.mongo路径,config数据路径,shard数据路径
- 张艾迪(创始人):创始人故事无限N个
世界第一女孩+世界第一互联网女孩 创始人故事无限N个 全球第一互联网女孩EidyZhang艾迪.张 The World No.1 Girl :Eidyzhang The World No.1 Inte ...
- css实现一段不够一行时居中显示,多于一行时两端对齐
今天有遇到这个问题,不够一行要居中才好看,多于一行居中又很难看: 居中 两端对齐 一开始想用text-align-last:center; 可是这样结果是这样的: 单行的居中了 可是多行的最后一行也居 ...
