Bowtie2
如何使用Bowtie2

相似功能的有:

创建索引
创建索引bowtie2-build使用的命令。 -f指定要索引文件后,再给予索引的名称。名称可以连接到任何。
bowtie2 build-f reference_dna.fa INDEX_NA
转载:https://translate.google.co.jp/translate?hl=zh-CN&sl=ja&u=http://bi.biopapyrus.net/transcriptome/map/bowtie2.html&prev=search
Bowtie2的更多相关文章
- bowtie1和bowtie2的比较
1.对于长度大于50bp的reads,bowtie2更精确:而小于50bp的reads,bowtie1更精确更快速 2.bowtie2支持的reads长度没有上限,当然reads长度在50~1000b ...
- 安装生物信息学软件-bowtie2
好吧,这是本周(2016.10.21-28)的学习任务之一:安装bowtie2并学习其使用方法&参数设置 所以,啃文档咯,官方文档Version 2.2.9 http://bowtie-bio ...
- 生物信息学工具--bowtie&bowtie2
Bowtie和Bowtie2使用 [怪毛匠子整理] Source URL: http://www.bbioo.com/lifesciences/40-112837-1.html Bowtie和Bowt ...
- bowtie2 Linux安装
目前最新版本为2.3.2,网址为:https://sourceforge.net/projects/bowtie-bio/files/bowtie2/2.3.2 安装分为简单的下载可执行文件和源编译安 ...
- Hisat2 bowtie2比对结果解读(Hisat2 Alignment summary)
RNA-seq数据的比对结果怎么解读?网上有很多人问,这里做一个大致的总结. Hisat2和bowtie2比对后产生的Alignment summary的格式是一样的,如下: Alignment su ...
- Bowtie2的安装与使用
Bowtie2的安装与使用 2017-06-15 18:58:52 342 0 0 Bowtie2用来快速比对短reads(50-100bp)与参考基因组,与常规的比对软件不 ...
- bowtie2-inspect 根据bowtie2的索引取得fasta 序列
今天运行tophat2的时候看到下面这条记录: [2016-02-27 11:40:03] Checking for reference FASTA file Warning: Could not f ...
- bowtie2用法
bowtie2的功能:短序列的比对 用法:bowtie2 [options]* -x <bt2-idx> {-1 <m1> -2 <m2> | -U <r&g ...
- 30、 bowtie和bowtie2使用条件区别及用法
转载:http://blog.csdn.net/soyabean555999/article/details/62235577 一.转录组还是基因组? map常用的工具有bowtie/bowtie2, ...
随机推荐
- 有限状态机(Python)
有限状态机(Finite-state machine, FSM),又称有限状态自动机,简称状态机,是表示有限个状态以及在这些状态之间的转移和动作等行为的数学模型.FSM是一种算法思想,简单而言,有限状 ...
- VBA中使用JavaScript脚本语言解析JSON数据
JSON:JavaScript 对象表示法(JavaScript Object Notation) 和xml相似,都是文本形式(保存在文本文件中或字符串等形式),比如: jsstr = {" ...
- docker-registry使用笔记
在国内docker-hub是肯定用不了的,不解释:sweat:. 所以最好还是建一个私有的docker-registry,存储一些常用的images方便随时pull. 相关链接 github:http ...
- XAF学习资源整合大全
近期有很多XAF初学者与我联系,我多数时间在重复很多入门问题,所以决定整理一篇XAF资源列表,方便大家查找资料,也请知晓其他资源的人留言或与我联系,我将新资源追加到本篇文章中,方便更多人. 一.本博客 ...
- 如何浏览并管理 Outlook 邮件?
当你的邮件多起来的时候你就不得不考虑这个问题了,如何处理各种邮件? 如何浏览并管理 Outlook 邮件? 待续~
- django中“url映射规则”和“服务端响应顺序”
1.django搜索路径 使用 import 语句时,Python 所查找的系统目录清单. 查看方式: import sys print sys.path ...
- linux笔记:文件系统管理-fdisk分区
fdisk命令分区过程: 1.添加新硬盘 2.查看新硬盘: fdisk -l 3.使用fdisk命令分区: fdisk 硬盘设备文件名(如:fdisk /dev/sdb) fdisk交互指令说明: 4 ...
- 0505 Scrum 项目1.0
应用NABCD模型,分析你们初步选定的项目,充分说明你们选题的理由. 录制为演说视频,上传到视频网站,并把链接发到团队博客上. 团队项目选题 一个售书网站(O2O) NABCD 模型 1) N (N ...
- webstorm 注册码,亲测可用
WebStorm注册码 User Name: EMBRACE License Key: ===== LICENSE BEGIN ===== 24718-12042010 00001h6wzKLpfo3 ...
- ListView在列表的头部和底部添加布局——addHeaderView,addFooterView
addHeaderView()方法:主要是向listView的头部添加布局addFooterView()方法:主要是向listView的底部添加布局 以addHeaderView为例: View he ...
