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EventNum
This was developed by the MySQL team, and written in PHP.
Fossil
Fossil is written in C, and uses SQLite database.
The Bug Genie
Bug genie is written in PHP.
WebIssues
WebIssue is written in PHP, and uses MySQL database for the server side. Everything in this top 10 list is web based bug tracking system except WebIssues.
其它：
I would recommend Flyspray. It is small, easy to use/install, uses PHP.
参考：

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