1. DNA测序技术

https://www.jianshu.com/p/6122cecec54a

2.FASTA和FASTQ文件格式

https://www.jianshu.com/p/50ff302d049f

3.数据质控

https://www.jianshu.com/p/36891a89ed6e

4.构建WGS分析主流程

https://www.jianshu.com/p/859c0345624c

5. 理解并操作BAM文件

https://www.jianshu.com/p/364e640d3c9f

6. GATK4.0和全基因组数据分析实践_上

https://www.jianshu.com/p/66361e7e2340

7. GATK4.0和全基因组数据分析实践_下

https://www.jianshu.com/p/ff8204ae7ebf

WGS 全基因组测序数据分析的更多相关文章

  1. 全基因组测序 Whole Genome Sequencing

    全基因组测序 Whole Genome Sequencing 全基因组测序(Whole Genome Sequencing,WGS)是利用高通量测序平台对一种生物的基因组中的全部基因进行测序,测定其 ...

  2. cfDNA（circulating cell free DNA）全基因组测序

    参考资料: [cfDNA专题]cell-free DNA在非肿瘤疾病中的临床价值(好) ctDNA, cfDNA和CTCs有什么区别吗? cfDNA你懂多少? 新发现 | 基因是否表达,做个cfDNA ...

  3. PacBio全基因组测序和组装

    PacBio公司的业务范围也就5个(官网): Whole Genome Sequencing Targeted Sequencing Complex Populations RNA Sequencin ...

  4. 全基因组测序 从头测序(de novo sequencing) 重测序(re-sequencing)

    全基因组测序 全基因组测序分为从头测序(de novo sequencing)和重测序(re-sequencing). 从头测序(de novo)不需要任何参考基因组信息即可对某个物种的基因组进行测序 ...

  5. 利用ONT测序检测真核生物全基因组甲基化状态

    摘要 甲基化在真核生物基因组序列中广泛存在,其中5mC最为普遍,在真核生物基因组中也有发现6mA.捕获基因组中的甲基化状态的常用技术是全基因组甲基化测序(WGBS)和简化甲基化测序(RRBS),而随着 ...

  6. 如何鉴定全基因组加倍事件（WGD）

    目前鉴定全基因组加倍(whole-genome duplication events)有3种 通过染色体共线性(synteny) 方法是比较两个基因组的序列,并将同源序列的位置绘制成点状图,如果能在点 ...

  7. GWAS | 全基因组关联分析 | Linkage disequilibrium (LD)连锁不平衡 | 曼哈顿图 Manhattan_plot | QQ_plot | haplotype phasing

    现在GWAS已经属于比较古老的技术了,主要是碰到严重的瓶颈了,单纯的snp与表现的关联已经不够,需要具体的生物学解释,这些snp是如何具体导致疾病的发生的. 而且,大多数病找到的都不是个别显著的snp ...

  8. 【GWAS文献解读】疟原虫青蒿素抗药性的全基因组关联分析

    英文名:Genetic architecture of artemisinin-resistant Plasmodium falciparum 中文名:疟原虫青蒿素抗药性的全基因组关联分析 期刊:Na ...

  9. 柳叶刀重磅出击！全外显子测序在胎儿结构异常的评估Whole-exome sequencing in the evaluation of fetal structural anomalies: a prospective cohort study

    柳叶刀发表的文献解读:Whole-exome sequencing in the evaluation of fetal structural anomalies: a prospective coh ...

随机推荐

  1. gitbub高效查找优秀项目

    in:name example   名字中带有example的项目 in:readme example 在readme文件带有example的项目 in:description example 描述里 ...

  2. C#字符串（String）类型中@的用法

    C# string 字符串的前面可以加 @(称作"逐字字符串")将转义字符(\)当作普通字符对待,比如: string str = @"C:\Windows"; ...

  3. springboot的pom.xml配置

    <?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?><project xmlns="http://maven ...

  4. 通过Nginx获取用户真实IP

    nginx配置 location / { proxy_set_header Host $host; proxy_set_header X-real-ip $remote_addr; proxy_set ...

  5. 架构师小跟班：送你一份2019年阿里巴巴最新Java面试题，以供参考

    大家都说大厂面试造飞机,工作拧螺丝.这话只对了一部分,大厂是平时拧螺丝,一旦需要飞机时也能造的起来. 目录 技术一面(23问) 技术二面(3大块) JAVA开发技术面试中可能问到的问题(17问) JA ...

  6. 左右对齐Justify遇到的坑

    遇到的问题 这两天在开发一个病历的对外展示页面,设计稿上label是左右拉伸对齐的,显示效果如下: 怎么实现这种效果呢? 首先想到的是文字中间加空格,但是这种方式太low了,而且不太容易控制.网上查资 ...

  7. 【转】LockSupport深入浅出

    原文:https://www.cnblogs.com/qingquanzi/p/8228422.html 本篇是<自己动手写把"锁">系列技术铺垫的最后一个知识点.本篇 ...

  8. Golang循环中调用go func参数异常分析

    项目中,需要循环调用API服务器列表,在循环中使用go func创建协程时遇到了参数失灵的现象. 具体代码如下所示: for _, apiServerAddr := range apiServerAd ...

  9. Docker 0x08: Docker 命令

    目录 Docker 命令 run 与 start 区别 docker 进程相关命令 Restful API Docker 命令 docker命令容易混淆几个 run 与 start 区别 run: 会 ...

  10. 迁移生产环境的GItLab11.3.5到新的服务器

    在新的服务器上 rpm安装git 首先停止,Gitlab服务 root@localhost # gitlab-ctl stop 参考了 以下链接: https://blog.csdn.net/liul ...