OPTICS聚类算法原理

基础

OPTICS聚类算法是基于密度的聚类算法,全称是Ordering points to identify the clustering structure,目标是将空间中的数据按照密度分布进行聚类,其思想和DBSCAN非常类似,但是和DBSCAN不同的是,OPTICS算法可以获得不同密度的聚类,直接说就是经过OPTICS算法的处理,理论上可以获得任意密度的聚类。因为OPTICS算法输出的是样本的一个有序队列,从这个队列里面可以获得任意密度的聚类。

定义

OPTICS算法的基础有两点,

  • 参数(半径,最少点数):

一个是输入的参数,包括:半径 ε ,和最少点数 MinPts 。

  • 定义(核心点,核心距离,可达距离,直接密度可达):

另一个是相关概念的定义:
核心点的定义,如果一个点的半径内包含点的数量不少于最少点数,则该点为核心点,数学描述即

Nε(P)>=MinPts

在这个基础上可以引出核心距离的定义,即对于核心点,距离其第 MinPtsth 近的点与之的距离

coreDist(P)={UNDIFED, MinPtsth Distance in N(P),if N(P)<=MinPtselse

可达距离,对于核心点P,O到P的可达距离定义为O到P的距离或者P的核心距离,即公式

reachDist(O,P)={UNDIFED, max(coreDist(P), dist(O,P)),if N(P)<=MinPtselse

O到P直接密度可达,即P为核心点,且P到O的距离小于半径。

算法

OPTICS算法的难点在于维护核心点的直接可达点的有序列表。算法的计算过程如下:

  • 输入:数据样本D,初始化所有点的可达距离和核心距离为MAX,半径 ε ,和最少点数 MinPts 。

  • 1、建立两个队列,有序队列(核心点及该核心点的直接密度可达点),结果队列(存储样本输出及处理次序)

  • 2、如果D中数据全部处理完,则算法结束,否则从D中选择一个未处理且未核心对象的点,将该核心点放入结果队列,该核心点的直接密度可达点放入有序队列,直接密度可达点并按可达距离升序排列;
  • 3、如果有序序列为空,则回到步骤2,否则从有序队列中取出第一个点;
  • 3.1 判断该点是否为核心点,不是则回到步骤3,是的话则将该点存入结果队列,如果该点不在结果队列;
  • 3.2 该点是核心点的话,找到其所有直接密度可达点,并将这些点放入有序队列,且将有序队列中的点按照可达距离重新排序,如果该点已经在有序队列中且新的可达距离较小,则更新该点的可达距离。
  • 3.3 重复步骤3,直至有序队列为空。
  • 4、算法结束。

输出结果

给定半径 ε ,和最少点数 MinPts ,就可以输出所有的聚类。

计算过程为:

给定结果队列

    • 1、从结果队列中按顺序取出点,如果该点的可达距离不大于给定半径 ε ,则该点属于当前类别,否则至步骤2;
    • 2、如果该点的核心距离大于给定半径 ε ,则该点为噪声,可以忽略,否则该点属于新的聚类,跳至步骤1;
    • 3、结果队列遍历结束,则算法结束。

转载自:http://ddrv.cn/a/66368?unapproved=169375&moderation-hash=d65a76d583bc337cf8ee514ce3049cf6#comment-169375

OPTICS聚类算法原理的更多相关文章

  1. Kmeans聚类算法原理与实现

    Kmeans聚类算法 1 Kmeans聚类算法的基本原理 K-means算法是最为经典的基于划分的聚类方法,是十大经典数据挖掘算法之一.K-means算法的基本思想是:以空间中k个点为中心进行聚类,对 ...

  2. 【转】K-Means聚类算法原理及实现

    k-means 聚类算法原理: 1.从包含多个数据点的数据集 D 中随机取 k 个点,作为 k 个簇的各自的中心. 2.分别计算剩下的点到 k 个簇中心的相异度,将这些元素分别划归到相异度最低的簇.两 ...

  3. BIRCH聚类算法原理

    在K-Means聚类算法原理中,我们讲到了K-Means和Mini Batch K-Means的聚类原理.这里我们再来看看另外一种常见的聚类算法BIRCH.BIRCH算法比较适合于数据量大,类别数K也 ...

  4. K-Means聚类算法原理

    K-Means算法是无监督的聚类算法,它实现起来比较简单,聚类效果也不错,因此应用很广泛.K-Means算法有大量的变体,本文就从最传统的K-Means算法讲起,在其基础上讲述K-Means的优化变体 ...

  5. K-Means 聚类算法原理分析与代码实现

    前言 在前面的文章中,涉及到的机器学习算法均为监督学习算法. 所谓监督学习,就是有训练过程的学习.再确切点,就是有 "分类标签集" 的学习. 现在开始,将进入到非监督学习领域.从经 ...

  6. 第十三篇:K-Means 聚类算法原理分析与代码实现

    前言 在前面的文章中,涉及到的机器学习算法均为监督学习算法. 所谓监督学习,就是有训练过程的学习.再确切点,就是有 "分类标签集" 的学习. 现在开始,将进入到非监督学习领域.从经 ...

  7. 机器学习中K-means聚类算法原理及C语言实现

    本人以前主要focus在传统音频的软件开发,接触到的算法主要是音频信号处理相关的,如各种编解码算法和回声消除算法等.最近切到语音识别上,接触到的算法就变成了各种机器学习算法,如GMM等.K-means ...

  8. 【机器学习】:Kmeans均值聚类算法原理(附带Python代码实现)

    这个算法中文名为k均值聚类算法,首先我们在二维的特殊条件下讨论其实现的过程,方便大家理解. 第一步.随机生成质心 由于这是一个无监督学习的算法,因此我们首先在一个二维的坐标轴下随机给定一堆点,并随即给 ...

  9. 密度峰值聚类算法原理+python实现

    ​ 密度峰值聚类(Density peaks clustering, DPC)来自Science上Clustering by fast search and find of density peaks ...

随机推荐

  1. Gatling脚本编写技巧篇(一)

    一.公共类抽取 熟悉Gatling的同学都知道Gatling脚本的同学都知道,Gatling的脚本包含三大部分: http head配置 Scenario 执行细节 setUp 组装 那么针对三部分我 ...

  2. Mark down 使用总结

    Markdown语法 Markdown是一种纯文本.轻量级的标记语言,通过简单的标记,就可以使文本具有一定的格式,操作简单.使用广泛,常见的比如github上的README.md . Markdown ...

  3. NCTF2018_easy_audit->coding_breaks

    easy_audit 题目源码 <?php highlight_file(__FILE__); error_reporting(0); if($_REQUEST){ foreach ($_REQ ...

  4. [nodejs] 同步/异步创建多层目录

    背景 有时项目里需要同时创建多层目录的功能,但低版本的nodejs并没有提供快捷的api 尽管在v10.12.0版本 mkdir() 第二个参数支持recursive 参数,为true时能递归创建,但 ...

  5. Java 基础之详解 Java 反射机制

    一.什么是 Java 的反射机制?   反射(Reflection)是Java的高级特性之一,是框架实现的基础,定义:JAVA反射机制是在运行状态中,对于任意一个类,都能够知道这个类的所有属性和方法: ...

  6. List of common SCSI KCQs

    Category Key ASC ASCQ Error Condition No Sense 0 00 00 No error 0 5D 00 No sense - PFA threshold rea ...

  7. Asynchronous Disk I/O Appears as Synchronous on Windows

    Summary File I/O on Microsoft Windows can be synchronous or asynchronous. The default behavior for I ...

  8. 基于 Docker 构建企业 Jenkins CI平台

    持续集成(Continuous Integration,CI):代码合并.构建.部署.测试都在一起,不断地执行这个过程,并对结果反馈. 持续部署(Continuous Deployment,CD):部 ...

  9. ICML2016 TUTORIAL参会分享

    本次ICML会议的tutorial安排在主会前一天.这次tutorial内容非常丰富,有微软亚研的hekaiming(已经跳去facebook)介绍深度残差网络,也有deepmind的david si ...

  10. 谁需要GUI?快看Linux 终端生存之道

    完全在 Linux 终端中生存并不容易,但这绝对是可行的. 处理常见功能的最佳 Linux shell 应用 你是否曾想像过完完全全在 Linux 终端里生存?没有图形桌面,没有现代的 GUI 软件, ...